Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SDB1

Protein Details
Accession C9SDB1    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
66-102PAPVKEKKELAKRERKEKDKMLKSHKKDKTNHRISLPBasic
429-454VSKEWRPPASRTSRRRRARAASCACSHydrophilic
478-497ATCLRARQRTPTRSHRLRGAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-96KEKKELAKRERKEKDKMLKSHKKDKTN
440-445TSRRRR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, mito 10, cyto_nucl 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014752  Arrestin-like_C  
IPR024391  LDB19_N  
KEGG val:VDBG_03172  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13002  LDB19  
Amino Acid Sequences MPHRVADFLRSSTETFSAAAVNTIKSSIRPQQQAPVRRRIERFPSYDPSLSEQYDEIPYLMYAPEPAPVKEKKELAKRERKEKDKMLKSHKKDKTNHRISLPFGRSREIHENPHAALDWKIESPPIIFFGDAESSSGALVSGQMIIEVKDEHLEIENFSAALNIHVHQKKPFMANCADCLDQYTELKKWTFLSHPTTLRKGRHQYPFSILLEGHLPASLDTPLVSIAYEFKSEVTLAKNARISALPIKFWKDFDVKRSLVQPDTPHHSVRVFPPTNIKAGADYDQIIHSTGSQHAVQLRLDGLTTVNDATKTVEYWKLKKITWKLEETIKTVAPACKKHQPTTPAEGSAPVAQKGASRTETRVLGERHMHDGWKSDYTATDGHVEFGFEYGVAASLLASSKNGAPGFACDSRSLDGTSVSHALMIEMVVSKEWRPPASRTSRRRRARAASCACSTTSCSPSAPVSAVSWDNEARRSTATCLRARQRTPTRSHRLRGAGDARCAPDEPRAEGMNTCRMGHMEPIWHCVLYGCT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.21
3 0.19
4 0.17
5 0.14
6 0.16
7 0.15
8 0.15
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.15
13 0.22
14 0.27
15 0.34
16 0.39
17 0.41
18 0.49
19 0.58
20 0.65
21 0.66
22 0.68
23 0.66
24 0.69
25 0.7
26 0.7
27 0.7
28 0.7
29 0.69
30 0.65
31 0.66
32 0.64
33 0.63
34 0.56
35 0.52
36 0.48
37 0.42
38 0.36
39 0.29
40 0.25
41 0.24
42 0.23
43 0.17
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.2
55 0.24
56 0.29
57 0.34
58 0.39
59 0.43
60 0.51
61 0.61
62 0.65
63 0.72
64 0.75
65 0.8
66 0.84
67 0.84
68 0.83
69 0.83
70 0.83
71 0.82
72 0.84
73 0.85
74 0.85
75 0.85
76 0.87
77 0.85
78 0.84
79 0.83
80 0.85
81 0.85
82 0.84
83 0.82
84 0.78
85 0.74
86 0.69
87 0.71
88 0.66
89 0.61
90 0.52
91 0.49
92 0.43
93 0.46
94 0.51
95 0.44
96 0.45
97 0.43
98 0.45
99 0.42
100 0.43
101 0.37
102 0.28
103 0.25
104 0.21
105 0.17
106 0.15
107 0.15
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.1
116 0.12
117 0.13
118 0.12
119 0.12
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.06
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.16
152 0.19
153 0.21
154 0.22
155 0.25
156 0.27
157 0.32
158 0.34
159 0.3
160 0.33
161 0.34
162 0.35
163 0.34
164 0.31
165 0.25
166 0.25
167 0.22
168 0.18
169 0.18
170 0.17
171 0.16
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.17
176 0.18
177 0.2
178 0.23
179 0.27
180 0.31
181 0.37
182 0.4
183 0.45
184 0.48
185 0.49
186 0.52
187 0.53
188 0.55
189 0.58
190 0.57
191 0.53
192 0.52
193 0.55
194 0.47
195 0.41
196 0.33
197 0.24
198 0.23
199 0.2
200 0.15
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.13
223 0.13
224 0.16
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.16
229 0.16
230 0.19
231 0.2
232 0.19
233 0.19
234 0.23
235 0.23
236 0.23
237 0.24
238 0.24
239 0.24
240 0.27
241 0.32
242 0.29
243 0.3
244 0.33
245 0.32
246 0.26
247 0.27
248 0.26
249 0.22
250 0.28
251 0.29
252 0.26
253 0.24
254 0.24
255 0.23
256 0.23
257 0.29
258 0.23
259 0.22
260 0.28
261 0.29
262 0.29
263 0.28
264 0.25
265 0.16
266 0.17
267 0.18
268 0.12
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.08
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.1
300 0.16
301 0.19
302 0.22
303 0.28
304 0.3
305 0.31
306 0.38
307 0.43
308 0.46
309 0.49
310 0.49
311 0.46
312 0.5
313 0.51
314 0.46
315 0.42
316 0.32
317 0.28
318 0.26
319 0.27
320 0.25
321 0.26
322 0.28
323 0.34
324 0.38
325 0.41
326 0.44
327 0.47
328 0.48
329 0.52
330 0.5
331 0.43
332 0.4
333 0.37
334 0.32
335 0.3
336 0.25
337 0.18
338 0.15
339 0.13
340 0.15
341 0.16
342 0.18
343 0.17
344 0.18
345 0.19
346 0.23
347 0.25
348 0.24
349 0.29
350 0.26
351 0.28
352 0.31
353 0.31
354 0.32
355 0.31
356 0.3
357 0.25
358 0.27
359 0.25
360 0.23
361 0.21
362 0.17
363 0.16
364 0.18
365 0.18
366 0.16
367 0.17
368 0.15
369 0.16
370 0.15
371 0.15
372 0.12
373 0.12
374 0.1
375 0.06
376 0.06
377 0.04
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.11
392 0.14
393 0.2
394 0.21
395 0.22
396 0.18
397 0.2
398 0.22
399 0.23
400 0.21
401 0.15
402 0.14
403 0.13
404 0.15
405 0.15
406 0.13
407 0.12
408 0.11
409 0.11
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.12
419 0.16
420 0.18
421 0.21
422 0.24
423 0.34
424 0.44
425 0.54
426 0.6
427 0.68
428 0.76
429 0.82
430 0.86
431 0.86
432 0.85
433 0.85
434 0.85
435 0.83
436 0.79
437 0.73
438 0.66
439 0.58
440 0.49
441 0.44
442 0.39
443 0.33
444 0.28
445 0.25
446 0.25
447 0.26
448 0.27
449 0.23
450 0.18
451 0.16
452 0.18
453 0.2
454 0.19
455 0.2
456 0.21
457 0.22
458 0.24
459 0.25
460 0.23
461 0.23
462 0.24
463 0.27
464 0.31
465 0.37
466 0.39
467 0.47
468 0.54
469 0.6
470 0.61
471 0.67
472 0.7
473 0.71
474 0.75
475 0.77
476 0.79
477 0.79
478 0.81
479 0.79
480 0.76
481 0.71
482 0.71
483 0.69
484 0.64
485 0.6
486 0.59
487 0.53
488 0.48
489 0.45
490 0.37
491 0.36
492 0.34
493 0.32
494 0.32
495 0.31
496 0.3
497 0.33
498 0.36
499 0.37
500 0.36
501 0.32
502 0.29
503 0.28
504 0.29
505 0.3
506 0.29
507 0.29
508 0.28
509 0.33
510 0.34
511 0.32
512 0.31