FuNGI

C9SYC5

Protein Details

Accession

C9SYC5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-59	EAPAPKFTRKPLRQSGLRKSIN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
293-305	KKAEREEKARRRR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012890 GCFC2-like
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	val:VDBG_09900 -
Pfam	View protein in Pfam PF15458 NTR2

Amino Acid Sequences

MSSFAKRKARVIKVDDDDDVTLGGSSSTTTDQQLVSEEAPAPKFTRKPLRQSGLRKSINVNQIDDPDGASTTLGKAATAHNDDEDDGPVVIRPAIGRAGSTKQKKRASTSRLSFGPGQDTGGAAFSTPKKSSLGQQAAENSAIKKPGFTHRLPMRRFNDDEEDRPRYSKEFLDELQSSTPNTPQPISSLRGTSDDEMELDPSELEGALIVNEGTYTEAAVPQQTSILSNTEIQERKQRRARLAREEDFISLDDEGDDRTDGKPSENTRLVPEDEDLGEGFDDFVEDGGLSLGKKAEREEKARRRREMAEQIQMAEGNSEESSDESDAERRAAFEAAQTRSGMDGLSKPEKRDPAEALLQVPAKITPLPELDGCLEKLSLSLRGMEGALREKQSALDRLKAEREAILAREGEVQALLDEAGKRYTSILGGSGPTLEAGQSPARQIQNAGMSELAVERGLESFGTTPVRRPDGGDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.55
4	0.47
5	0.37
6	0.31
7	0.21
8	0.14
9	0.1
10	0.09
11	0.06
12	0.05
13	0.07
14	0.09
15	0.1
16	0.12
17	0.14
18	0.14
19	0.15
20	0.17
21	0.18
22	0.16
23	0.17
24	0.19
25	0.21
26	0.22
27	0.23
28	0.23
29	0.27
30	0.3
31	0.36
32	0.44
33	0.48
34	0.57
35	0.65
36	0.72
37	0.75
38	0.82
39	0.84
40	0.83
41	0.8
42	0.73
43	0.68
44	0.66
45	0.64
46	0.58
47	0.51
48	0.43
49	0.41
50	0.41
51	0.36
52	0.28
53	0.21
54	0.18
55	0.15
56	0.12
57	0.1
58	0.08
59	0.11
60	0.1
61	0.09
62	0.1
63	0.12
64	0.18
65	0.21
66	0.21
67	0.19
68	0.2
69	0.21
70	0.21
71	0.2
72	0.14
73	0.12
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.09
78	0.08
79	0.07
80	0.08
81	0.1
82	0.1
83	0.1
84	0.13
85	0.19
86	0.28
87	0.37
88	0.44
89	0.51
90	0.58
91	0.62
92	0.67
93	0.71
94	0.7
95	0.71
96	0.69
97	0.67
98	0.62
99	0.61
100	0.55
101	0.46
102	0.42
103	0.32
104	0.27
105	0.2
106	0.18
107	0.15
108	0.13
109	0.11
110	0.07
111	0.1
112	0.12
113	0.16
114	0.17
115	0.18
116	0.19
117	0.2
118	0.27
119	0.34
120	0.37
121	0.34
122	0.37
123	0.38
124	0.38
125	0.38
126	0.33
127	0.23
128	0.19
129	0.2
130	0.17
131	0.15
132	0.17
133	0.24
134	0.29
135	0.29
136	0.37
137	0.43
138	0.52
139	0.54
140	0.61
141	0.56
142	0.56
143	0.57
144	0.52
145	0.53
146	0.47
147	0.49
148	0.46
149	0.47
150	0.42
151	0.41
152	0.38
153	0.3
154	0.3
155	0.26
156	0.23
157	0.21
158	0.21
159	0.26
160	0.26
161	0.26
162	0.25
163	0.23
164	0.2
165	0.17
166	0.19
167	0.15
168	0.15
169	0.14
170	0.12
171	0.15
172	0.17
173	0.2
174	0.19
175	0.19
176	0.18
177	0.2
178	0.21
179	0.19
180	0.17
181	0.14
182	0.13
183	0.12
184	0.12
185	0.09
186	0.08
187	0.07
188	0.06
189	0.05
190	0.04
191	0.04
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.02
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.04
205	0.04
206	0.05
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.05
211	0.06
212	0.07
213	0.08
214	0.08
215	0.09
216	0.1
217	0.16
218	0.17
219	0.17
220	0.25
221	0.27
222	0.34
223	0.39
224	0.42
225	0.45
226	0.54
227	0.59
228	0.61
229	0.66
230	0.62
231	0.58
232	0.55
233	0.47
234	0.38
235	0.32
236	0.22
237	0.13
238	0.1
239	0.07
240	0.06
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.14
250	0.16
251	0.23
252	0.24
253	0.25
254	0.25
255	0.28
256	0.27
257	0.24
258	0.22
259	0.16
260	0.14
261	0.13
262	0.11
263	0.08
264	0.07
265	0.06
266	0.06
267	0.04
268	0.04
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.04
276	0.04
277	0.04
278	0.06
279	0.06
280	0.07
281	0.09
282	0.17
283	0.22
284	0.3
285	0.4
286	0.49
287	0.59
288	0.67
289	0.69
290	0.66
291	0.65
292	0.67
293	0.67
294	0.63
295	0.61
296	0.53
297	0.5
298	0.46
299	0.42
300	0.32
301	0.21
302	0.14
303	0.08
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.08
312	0.1
313	0.11
314	0.12
315	0.12
316	0.11
317	0.12
318	0.11
319	0.11
320	0.12
321	0.18
322	0.19
323	0.21
324	0.2
325	0.19
326	0.19
327	0.19
328	0.15
329	0.1
330	0.11
331	0.15
332	0.24
333	0.25
334	0.27
335	0.33
336	0.38
337	0.39
338	0.41
339	0.39
340	0.36
341	0.39
342	0.38
343	0.34
344	0.32
345	0.3
346	0.26
347	0.23
348	0.17
349	0.13
350	0.13
351	0.12
352	0.12
353	0.12
354	0.14
355	0.14
356	0.16
357	0.17
358	0.18
359	0.18
360	0.16
361	0.14
362	0.12
363	0.13
364	0.12
365	0.13
366	0.12
367	0.12
368	0.12
369	0.13
370	0.13
371	0.13
372	0.14
373	0.15
374	0.18
375	0.18
376	0.19
377	0.18
378	0.21
379	0.26
380	0.31
381	0.3
382	0.33
383	0.34
384	0.38
385	0.42
386	0.4
387	0.36
388	0.29
389	0.29
390	0.25
391	0.24
392	0.22
393	0.18
394	0.18
395	0.21
396	0.2
397	0.17
398	0.15
399	0.13
400	0.1
401	0.1
402	0.09
403	0.07
404	0.09
405	0.09
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.12
410	0.14
411	0.12
412	0.12
413	0.13
414	0.13
415	0.14
416	0.14
417	0.13
418	0.12
419	0.11
420	0.1
421	0.09
422	0.07
423	0.1
424	0.13
425	0.14
426	0.16
427	0.23
428	0.24
429	0.25
430	0.25
431	0.28
432	0.31
433	0.31
434	0.3
435	0.23
436	0.22
437	0.21
438	0.21
439	0.16
440	0.09
441	0.08
442	0.07
443	0.08
444	0.08
445	0.07
446	0.08
447	0.09
448	0.12
449	0.18
450	0.19
451	0.24
452	0.31
453	0.35
454	0.34

C9SYC5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer