Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHW2

Protein Details
Accession C9SHW2    Localization Confidence Low Confidence Score 9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
267-290ETTPHHDTKPKKRSREPEGHPYAPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cysk 6, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016563  Npl4  
IPR007717  NPL4_C  
Gene Ontology GO:0006511  P:ubiquitin-dependent protein catabolic process  
KEGG val:VDBG_04644  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05021  NPL4  
CDD cd08061  MPN_NPL4  
Amino Acid Sequences MCGLQQVGVIWTDLLDAGNGDGSVVCKRHADSFFLAAQEICFSSRLQAQHPKPSKWSDTGRFGSNFVTCVISGNESGEIAISAYQVSNDAVEMVRADLIEPSADPTQMLVRDEEEDDGTASRTRYVPEVFYRRINEYGANVQENAKPAFPAEYLFVTLTHGFPADPKPTFIQPGFPIENREYIGESQEHSAVTKILKFNGGQKSKDDGLEMSNFHLLCFVHQMGILSKDEEALLCRVAAQHDLADSYQLRSTEGWQTLQAILSSAGETTPHHDTKPKKRSREPEGHPYAPPTRSGPVGVNGAGAADSDTPPHSARIPSEPGEPLAKRFAAFRLNERQRSQGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.07
10 0.12
11 0.12
12 0.13
13 0.15
14 0.16
15 0.24
16 0.26
17 0.3
18 0.29
19 0.32
20 0.33
21 0.32
22 0.31
23 0.23
24 0.21
25 0.18
26 0.15
27 0.12
28 0.1
29 0.1
30 0.12
31 0.17
32 0.18
33 0.23
34 0.33
35 0.37
36 0.47
37 0.55
38 0.56
39 0.57
40 0.62
41 0.61
42 0.58
43 0.62
44 0.58
45 0.6
46 0.6
47 0.59
48 0.53
49 0.49
50 0.45
51 0.36
52 0.3
53 0.22
54 0.2
55 0.14
56 0.15
57 0.15
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.12
62 0.1
63 0.1
64 0.08
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.05
85 0.06
86 0.06
87 0.05
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.11
94 0.12
95 0.13
96 0.11
97 0.11
98 0.13
99 0.13
100 0.14
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.13
112 0.14
113 0.17
114 0.22
115 0.29
116 0.29
117 0.33
118 0.35
119 0.35
120 0.35
121 0.32
122 0.26
123 0.22
124 0.24
125 0.22
126 0.2
127 0.18
128 0.18
129 0.19
130 0.2
131 0.19
132 0.14
133 0.12
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.06
149 0.07
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.13
154 0.15
155 0.16
156 0.19
157 0.18
158 0.18
159 0.16
160 0.21
161 0.22
162 0.2
163 0.23
164 0.21
165 0.22
166 0.19
167 0.19
168 0.15
169 0.13
170 0.14
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.13
184 0.13
185 0.2
186 0.28
187 0.32
188 0.3
189 0.31
190 0.35
191 0.35
192 0.35
193 0.28
194 0.2
195 0.18
196 0.19
197 0.18
198 0.14
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.12
204 0.1
205 0.14
206 0.12
207 0.1
208 0.11
209 0.12
210 0.11
211 0.14
212 0.13
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.09
225 0.1
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.13
235 0.12
236 0.13
237 0.13
238 0.16
239 0.2
240 0.21
241 0.21
242 0.19
243 0.21
244 0.21
245 0.21
246 0.18
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.1
256 0.16
257 0.17
258 0.18
259 0.24
260 0.33
261 0.44
262 0.54
263 0.6
264 0.63
265 0.71
266 0.8
267 0.84
268 0.86
269 0.82
270 0.82
271 0.82
272 0.76
273 0.67
274 0.64
275 0.6
276 0.5
277 0.45
278 0.37
279 0.31
280 0.29
281 0.3
282 0.26
283 0.24
284 0.26
285 0.23
286 0.2
287 0.18
288 0.16
289 0.14
290 0.11
291 0.09
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.1
296 0.12
297 0.13
298 0.15
299 0.17
300 0.18
301 0.21
302 0.27
303 0.31
304 0.31
305 0.34
306 0.34
307 0.34
308 0.39
309 0.37
310 0.33
311 0.33
312 0.32
313 0.28
314 0.28
315 0.3
316 0.31
317 0.33
318 0.37
319 0.43
320 0.51
321 0.59
322 0.6