FuNGI

C9SWM1

Protein Details

Accession

C9SWM1

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MASRKRKAPSRSKTSRSDLPD	Hydrophilic
35-60	STPPLAEESPRKRRRPGERPATPAAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-7	RK
44-57	PRKRRRPGERPATP
144-150	APERRKP

Subcellular Location(s)

mito 14, nucl 8.5, cyto_nucl 7, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR018327 BHD_2 IPR004583 DNA_repair_Rad4 IPR038765 Papain-like_cys_pep_sf IPR018326 Rad4_beta-hairpin_dom1 IPR018328 Rad4_beta-hairpin_dom3 IPR042488 Rad4_BHD3_sf IPR036985 Transglutaminase-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003684 F:damaged DNA binding GO:0006289 P:nucleotide-excision repair
KEGG	val:VDBG_09296 -
Pfam	View protein in Pfam PF10403 BHD_1 PF10404 BHD_2 PF10405 BHD_3

Amino Acid Sequences

MASRKRKAPSRSKTSRSDLPDVYQDLLAEAGAGPSTPPLAEESPRKRRRPGERPATPAAAPKTPKTEQVSEDDDSDDELEFEDVPIPAPNLQTMYLDTDEEDEDDEMIFEDVPIVPMQTSPIIAAPRADLELNLTAHRAVAPKAPERRKPITKAERDLRIHAHKSHLLCLLIHTARRNRWCNDSEVQNRLRPLLSKKVASLLKPRPNLSQFGQTESLKDGLEQIGRTFKAKYQVTERGLRRCLWAEAPEHLEKYEPPDDMDSCIGRDDFQTAARTLEGSRDTGAQLLCALLRSAGVQTRLVASFQPLSFTAGGPTLPKPQTVKMSTSKAKAEEMQRLAKAKQEMAPSPATPSARRRLGHPNATAYRVPTMTAAPSTSRPVKIHKPLRESPYPVYWVEVLDVAHQRDANSARSVGKRSSVSRRRPTDVDHIEASELEATASREPMPRNVADFKDHPIYALERHLRRHEVLKADAQPAGTMSAGSKAPLETIYRRRDVRIARSRDKWYRMGRDVKAMEMPVKFLTKRVNTKPGEYVDDGYGGDVRDAEGTPVFTEEQTEDYRPPPVVRGRVPKNKFGNIDLYVPGMVPKGGVWIADDSEDEPSSARAAFILGIDYAPALTGFLFKGRQGTAVLNGVVVAKEYEEAMRAVKAGLSDVEAQQQQDRRATAALRMWKRFLVVLRIHERVYAGVSAEERAADEAGRGFVADGDQEGHGSDCATEAAHEDEVLDEEALEAPDEVDADEEAASETTEEITMAEEDFGGGGFMTEGDDLGGGFMVD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.84
2	0.82
3	0.78
4	0.75
5	0.68
6	0.62
7	0.61
8	0.54
9	0.49
10	0.41
11	0.33
12	0.25
13	0.22
14	0.17
15	0.11
16	0.08
17	0.06
18	0.05
19	0.05
20	0.05
21	0.05
22	0.06
23	0.06
24	0.06
25	0.1
26	0.13
27	0.19
28	0.29
29	0.39
30	0.49
31	0.59
32	0.63
33	0.68
34	0.75
35	0.81
36	0.81
37	0.82
38	0.82
39	0.81
40	0.83
41	0.81
42	0.76
43	0.66
44	0.63
45	0.56
46	0.52
47	0.47
48	0.43
49	0.45
50	0.42
51	0.49
52	0.48
53	0.5
54	0.45
55	0.49
56	0.5
57	0.44
58	0.43
59	0.36
60	0.29
61	0.25
62	0.22
63	0.16
64	0.11
65	0.1
66	0.09
67	0.08
68	0.08
69	0.09
70	0.08
71	0.09
72	0.1
73	0.1
74	0.12
75	0.12
76	0.13
77	0.13
78	0.14
79	0.14
80	0.14
81	0.17
82	0.17
83	0.16
84	0.16
85	0.16
86	0.15
87	0.15
88	0.14
89	0.1
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.08
94	0.07
95	0.07
96	0.05
97	0.06
98	0.06
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.07
103	0.07
104	0.09
105	0.09
106	0.09
107	0.08
108	0.12
109	0.12
110	0.13
111	0.13
112	0.12
113	0.13
114	0.14
115	0.13
116	0.1
117	0.12
118	0.16
119	0.17
120	0.16
121	0.16
122	0.14
123	0.14
124	0.16
125	0.15
126	0.12
127	0.16
128	0.2
129	0.27
130	0.37
131	0.45
132	0.51
133	0.58
134	0.66
135	0.69
136	0.71
137	0.74
138	0.75
139	0.76
140	0.78
141	0.77
142	0.78
143	0.73
144	0.7
145	0.67
146	0.65
147	0.61
148	0.54
149	0.52
150	0.47
151	0.46
152	0.45
153	0.41
154	0.34
155	0.29
156	0.28
157	0.29
158	0.27
159	0.28
160	0.29
161	0.32
162	0.38
163	0.47
164	0.51
165	0.47
166	0.52
167	0.52
168	0.52
169	0.51
170	0.54
171	0.52
172	0.54
173	0.55
174	0.5
175	0.48
176	0.44
177	0.4
178	0.35
179	0.34
180	0.37
181	0.37
182	0.35
183	0.35
184	0.41
185	0.43
186	0.42
187	0.46
188	0.45
189	0.49
190	0.52
191	0.54
192	0.53
193	0.53
194	0.54
195	0.47
196	0.47
197	0.39
198	0.4
199	0.42
200	0.35
201	0.34
202	0.31
203	0.29
204	0.19
205	0.19
206	0.15
207	0.13
208	0.15
209	0.14
210	0.13
211	0.17
212	0.18
213	0.19
214	0.18
215	0.19
216	0.26
217	0.27
218	0.29
219	0.32
220	0.4
221	0.43
222	0.51
223	0.53
224	0.51
225	0.52
226	0.5
227	0.45
228	0.39
229	0.37
230	0.31
231	0.3
232	0.24
233	0.25
234	0.29
235	0.28
236	0.26
237	0.24
238	0.22
239	0.18
240	0.23
241	0.23
242	0.18
243	0.18
244	0.2
245	0.2
246	0.21
247	0.23
248	0.17
249	0.14
250	0.14
251	0.13
252	0.11
253	0.11
254	0.1
255	0.09
256	0.11
257	0.13
258	0.12
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.12
263	0.15
264	0.13
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.13
269	0.14
270	0.14
271	0.1
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.07
277	0.04
278	0.04
279	0.05
280	0.06
281	0.08
282	0.09
283	0.09
284	0.1
285	0.12
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.1
290	0.12
291	0.12
292	0.13
293	0.11
294	0.14
295	0.14
296	0.13
297	0.12
298	0.1
299	0.1
300	0.1
301	0.11
302	0.15
303	0.15
304	0.17
305	0.18
306	0.21
307	0.28
308	0.29
309	0.32
310	0.31
311	0.38
312	0.4
313	0.41
314	0.4
315	0.35
316	0.34
317	0.33
318	0.32
319	0.32
320	0.32
321	0.33
322	0.32
323	0.33
324	0.32
325	0.31
326	0.29
327	0.23
328	0.24
329	0.23
330	0.23
331	0.24
332	0.25
333	0.22
334	0.22
335	0.23
336	0.21
337	0.2
338	0.23
339	0.27
340	0.3
341	0.31
342	0.33
343	0.4
344	0.46
345	0.5
346	0.48
347	0.48
348	0.44
349	0.47
350	0.43
351	0.34
352	0.29
353	0.21
354	0.2
355	0.13
356	0.12
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.1
362	0.13
363	0.15
364	0.17
365	0.17
366	0.22
367	0.29
368	0.37
369	0.44
370	0.46
371	0.51
372	0.55
373	0.6
374	0.59
375	0.55
376	0.48
377	0.43
378	0.4
379	0.32
380	0.28
381	0.22
382	0.18
383	0.14
384	0.13
385	0.09
386	0.09
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.13
393	0.15
394	0.15
395	0.14
396	0.15
397	0.17
398	0.19
399	0.21
400	0.19
401	0.21
402	0.21
403	0.24
404	0.34
405	0.4
406	0.47
407	0.54
408	0.58
409	0.59
410	0.58
411	0.58
412	0.58
413	0.52
414	0.46
415	0.37
416	0.33
417	0.29
418	0.27
419	0.22
420	0.12
421	0.09
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.07
427	0.08
428	0.1
429	0.11
430	0.14
431	0.17
432	0.16
433	0.19
434	0.23
435	0.23
436	0.24
437	0.24
438	0.25
439	0.25
440	0.25
441	0.22
442	0.19
443	0.19
444	0.17
445	0.22
446	0.25
447	0.24
448	0.27
449	0.3
450	0.32
451	0.32
452	0.35
453	0.33
454	0.31
455	0.31
456	0.33
457	0.33
458	0.32
459	0.32
460	0.27
461	0.22
462	0.18
463	0.16
464	0.11
465	0.07
466	0.06
467	0.08
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.07
472	0.08
473	0.09
474	0.12
475	0.15
476	0.23
477	0.28
478	0.33
479	0.34
480	0.35
481	0.4
482	0.42
483	0.47
484	0.49
485	0.53
486	0.55
487	0.6
488	0.67
489	0.68
490	0.68
491	0.65
492	0.63
493	0.62
494	0.63
495	0.65
496	0.58
497	0.59
498	0.55
499	0.48
500	0.43
501	0.35
502	0.32
503	0.23
504	0.24
505	0.17
506	0.19
507	0.18
508	0.18
509	0.25
510	0.28
511	0.36
512	0.41
513	0.49
514	0.48
515	0.51
516	0.54
517	0.49
518	0.47
519	0.4
520	0.36
521	0.27
522	0.26
523	0.23
524	0.17
525	0.16
526	0.11
527	0.09
528	0.07
529	0.07
530	0.07
531	0.07
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.08
536	0.09
537	0.09
538	0.08
539	0.09
540	0.09
541	0.11
542	0.13
543	0.15
544	0.15
545	0.16
546	0.18
547	0.18
548	0.18
549	0.2
550	0.24
551	0.28
552	0.33
553	0.42
554	0.5
555	0.59
556	0.62
557	0.66
558	0.66
559	0.67
560	0.62
561	0.55
562	0.52
563	0.44
564	0.43
565	0.35
566	0.29
567	0.23
568	0.2
569	0.18
570	0.12
571	0.09
572	0.07
573	0.06
574	0.07
575	0.07
576	0.07
577	0.08
578	0.09
579	0.1
580	0.1
581	0.11
582	0.09
583	0.11
584	0.11
585	0.1
586	0.09
587	0.09
588	0.1
589	0.09
590	0.08
591	0.06
592	0.06
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.06
597	0.06
598	0.06
599	0.06
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.04
604	0.04
605	0.05
606	0.05
607	0.08
608	0.09
609	0.09
610	0.13
611	0.14
612	0.15
613	0.16
614	0.17
615	0.18
616	0.2
617	0.2
618	0.16
619	0.16
620	0.15
621	0.13
622	0.11
623	0.08
624	0.05
625	0.06
626	0.07
627	0.07
628	0.07
629	0.08
630	0.09
631	0.09
632	0.09
633	0.09
634	0.09
635	0.09
636	0.09
637	0.09
638	0.1
639	0.12
640	0.13
641	0.17
642	0.18
643	0.18
644	0.22
645	0.26
646	0.27
647	0.29
648	0.29
649	0.26
650	0.28
651	0.28
652	0.28
653	0.3
654	0.36
655	0.4
656	0.42
657	0.43
658	0.41
659	0.41
660	0.39
661	0.36
662	0.36
663	0.33
664	0.39
665	0.42
666	0.44
667	0.43
668	0.41
669	0.38
670	0.3
671	0.27
672	0.19
673	0.14
674	0.13
675	0.14
676	0.14
677	0.13
678	0.13
679	0.11
680	0.11
681	0.1
682	0.09
683	0.09
684	0.09
685	0.1
686	0.09
687	0.09
688	0.08
689	0.08
690	0.08
691	0.08
692	0.07
693	0.08
694	0.08
695	0.09
696	0.09
697	0.09
698	0.09
699	0.09
700	0.08
701	0.07
702	0.07
703	0.07
704	0.07
705	0.08
706	0.11
707	0.11
708	0.11
709	0.1
710	0.1
711	0.12
712	0.13
713	0.11
714	0.08
715	0.08
716	0.1
717	0.1
718	0.09
719	0.08
720	0.07
721	0.07
722	0.07
723	0.07
724	0.06
725	0.06
726	0.06
727	0.06
728	0.06
729	0.07
730	0.07
731	0.07
732	0.06
733	0.07
734	0.07
735	0.07
736	0.07
737	0.06
738	0.08
739	0.08
740	0.08
741	0.08
742	0.07
743	0.07
744	0.07
745	0.07
746	0.05
747	0.05
748	0.04
749	0.04
750	0.04
751	0.05
752	0.05
753	0.05
754	0.05
755	0.05
756	0.05
757	0.05

C9SWM1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer