Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SS60

Protein Details
Accession C9SS60    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
302-331RARGRGGARLRGRRERRRARHSAELQRAHGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
232-325WARARPRSAAAAGRARRGRRARGGRVPAGARGGGVPGRRLRRGDAGQRPPHHGAGDAQEPPARQGGRARVRARGRGGARLRGRRERRRARHSAE
Subcellular Location(s) mito 22.5, cyto_mito 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008949  Isoprenoid_synthase_dom_sf  
IPR002060  Squ/phyt_synthse  
Gene Ontology GO:0009058  P:biosynthetic process  
KEGG val:VDBG_07735  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00494  SQS_PSY  
Amino Acid Sequences MVSIMMISHGLRRLRPIQVRSGTRGIVTAADVDKARKYCQRQLHDYDAHLIQRTLPPHVRDAYLALRTLNLELVRLPEVVTNPTIGAMRMQFWRESIDKTFAGNPPAEPTCVLLHEAITSLQSRSNGSGSARAAATQMKFWIQRVIRTRERHMDNRPFATLASLEEYAENTYATLMYATLAALPVQSVHADHLASHIGKAAGIVAVLRGVPVARGAASGRRPPPDGSAAQVWARARPRSAAAAGRARRGRRARGGRVPAGARGGGVPGRRLRRGDAGQRPPHHGAGDAQEPPARQGGRARVRARGRGGARLRGRRERRRARHSAELQRAHGGRPAAGVPDEPGEGELQPVCRARELEAAVEHLAGGDEAADIGRIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.48
3 0.49
4 0.53
5 0.6
6 0.64
7 0.64
8 0.64
9 0.55
10 0.47
11 0.44
12 0.34
13 0.26
14 0.22
15 0.19
16 0.15
17 0.16
18 0.17
19 0.18
20 0.22
21 0.23
22 0.27
23 0.31
24 0.38
25 0.44
26 0.53
27 0.6
28 0.63
29 0.69
30 0.74
31 0.7
32 0.64
33 0.6
34 0.54
35 0.47
36 0.4
37 0.33
38 0.26
39 0.26
40 0.27
41 0.28
42 0.3
43 0.3
44 0.34
45 0.36
46 0.34
47 0.31
48 0.33
49 0.32
50 0.29
51 0.27
52 0.22
53 0.21
54 0.2
55 0.2
56 0.19
57 0.14
58 0.12
59 0.11
60 0.14
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.12
65 0.14
66 0.15
67 0.15
68 0.13
69 0.12
70 0.13
71 0.13
72 0.1
73 0.11
74 0.1
75 0.12
76 0.14
77 0.16
78 0.15
79 0.16
80 0.2
81 0.2
82 0.22
83 0.23
84 0.24
85 0.23
86 0.25
87 0.29
88 0.27
89 0.28
90 0.25
91 0.22
92 0.22
93 0.23
94 0.22
95 0.17
96 0.17
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.12
101 0.11
102 0.1
103 0.11
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.12
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.17
116 0.16
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.15
121 0.16
122 0.16
123 0.12
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.22
129 0.19
130 0.25
131 0.32
132 0.39
133 0.44
134 0.47
135 0.51
136 0.52
137 0.58
138 0.58
139 0.59
140 0.62
141 0.58
142 0.56
143 0.52
144 0.44
145 0.37
146 0.32
147 0.23
148 0.14
149 0.12
150 0.1
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.03
201 0.04
202 0.05
203 0.09
204 0.13
205 0.18
206 0.21
207 0.23
208 0.25
209 0.25
210 0.28
211 0.28
212 0.26
213 0.23
214 0.22
215 0.22
216 0.2
217 0.22
218 0.19
219 0.19
220 0.22
221 0.2
222 0.19
223 0.19
224 0.21
225 0.21
226 0.23
227 0.22
228 0.24
229 0.31
230 0.32
231 0.38
232 0.41
233 0.39
234 0.45
235 0.47
236 0.49
237 0.51
238 0.58
239 0.6
240 0.65
241 0.71
242 0.65
243 0.65
244 0.59
245 0.5
246 0.43
247 0.34
248 0.24
249 0.17
250 0.16
251 0.13
252 0.13
253 0.15
254 0.19
255 0.24
256 0.28
257 0.29
258 0.31
259 0.36
260 0.42
261 0.48
262 0.52
263 0.58
264 0.63
265 0.65
266 0.68
267 0.63
268 0.58
269 0.49
270 0.4
271 0.32
272 0.28
273 0.3
274 0.25
275 0.23
276 0.22
277 0.22
278 0.22
279 0.25
280 0.21
281 0.17
282 0.22
283 0.31
284 0.38
285 0.47
286 0.47
287 0.51
288 0.56
289 0.62
290 0.61
291 0.59
292 0.52
293 0.53
294 0.56
295 0.57
296 0.6
297 0.62
298 0.65
299 0.67
300 0.75
301 0.76
302 0.83
303 0.85
304 0.86
305 0.87
306 0.9
307 0.87
308 0.87
309 0.87
310 0.86
311 0.85
312 0.8
313 0.72
314 0.69
315 0.63
316 0.53
317 0.47
318 0.38
319 0.28
320 0.24
321 0.23
322 0.18
323 0.18
324 0.17
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.13
329 0.13
330 0.12
331 0.11
332 0.12
333 0.12
334 0.12
335 0.16
336 0.19
337 0.2
338 0.22
339 0.23
340 0.24
341 0.29
342 0.3
343 0.3
344 0.28
345 0.3
346 0.27
347 0.26
348 0.23
349 0.15
350 0.14
351 0.09
352 0.08
353 0.05
354 0.04
355 0.04
356 0.04