Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SSP2

Protein Details
Accession C9SSP2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
422-466EDEEKVRDKKDKERWARLRRVKSLFETKGGKKSRKSQSRPGTGHSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-459RDKKDKERWARLRRVKSLFETKGGKKSRKSQS
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 7.5, cyto_nucl 6.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG val:VDBG_07917  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MNATKRKFNSLIQGIGSRSSTPANDTGTTNDAAPSASPRPASLASLHTSPATMAVEEDLLQKRRRLQALTDKRAAATNTIKSLGGTTKVSNIVLKKWNSTREPADAPSRPPRGGCARARRGVRCTLCSKELLVKLTKKEVDGQDVPALVSSDVEEALQEKYAELVVTAHQEDCLWRRQGCDDSLLRLSLTNAKVSHEALRQRYDELCARKPFLPYEFNLRLPEGLDMDAVLSQLPDDFFNNPAPRPDMDHPNRVALALAVMGWQGLSNARIGAVPNSASCHTCLRRLGLWMFKSKEVGPNNEVLVPAPMDHLDPAREHRFFCPWKNPQTQRWNSTKPPSEKDLPAWTILTQVIKNDAYLRGALDDWPKSRARPSTAKHNTDKDGNGPPSTPRRPSIAATTIGDRGGVSFDTPSLAAQDGDDEDEEKVRDKKDKERWARLRRVKSLFETKGGKKSRKSQSRPGTGHSTASALTGTVPGETTKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.42
3 0.39
4 0.29
5 0.25
6 0.23
7 0.2
8 0.2
9 0.23
10 0.24
11 0.25
12 0.26
13 0.27
14 0.28
15 0.28
16 0.24
17 0.21
18 0.17
19 0.15
20 0.15
21 0.17
22 0.17
23 0.19
24 0.19
25 0.19
26 0.23
27 0.24
28 0.26
29 0.23
30 0.24
31 0.24
32 0.25
33 0.26
34 0.21
35 0.2
36 0.18
37 0.18
38 0.14
39 0.11
40 0.1
41 0.1
42 0.1
43 0.11
44 0.16
45 0.19
46 0.23
47 0.26
48 0.29
49 0.35
50 0.42
51 0.46
52 0.44
53 0.47
54 0.53
55 0.62
56 0.67
57 0.66
58 0.59
59 0.55
60 0.55
61 0.47
62 0.42
63 0.37
64 0.33
65 0.31
66 0.31
67 0.31
68 0.27
69 0.29
70 0.25
71 0.22
72 0.2
73 0.18
74 0.2
75 0.22
76 0.23
77 0.24
78 0.24
79 0.27
80 0.32
81 0.33
82 0.36
83 0.4
84 0.47
85 0.47
86 0.51
87 0.49
88 0.47
89 0.49
90 0.45
91 0.48
92 0.43
93 0.46
94 0.49
95 0.49
96 0.44
97 0.4
98 0.42
99 0.42
100 0.47
101 0.5
102 0.52
103 0.56
104 0.62
105 0.68
106 0.67
107 0.63
108 0.64
109 0.6
110 0.55
111 0.52
112 0.5
113 0.46
114 0.43
115 0.4
116 0.38
117 0.37
118 0.35
119 0.36
120 0.35
121 0.36
122 0.41
123 0.41
124 0.35
125 0.39
126 0.37
127 0.38
128 0.35
129 0.35
130 0.3
131 0.29
132 0.28
133 0.21
134 0.19
135 0.12
136 0.1
137 0.08
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.1
159 0.12
160 0.17
161 0.18
162 0.18
163 0.19
164 0.23
165 0.26
166 0.26
167 0.29
168 0.24
169 0.25
170 0.25
171 0.24
172 0.21
173 0.17
174 0.17
175 0.18
176 0.18
177 0.17
178 0.16
179 0.18
180 0.19
181 0.2
182 0.23
183 0.21
184 0.26
185 0.26
186 0.29
187 0.29
188 0.29
189 0.29
190 0.28
191 0.29
192 0.29
193 0.32
194 0.31
195 0.33
196 0.33
197 0.34
198 0.33
199 0.31
200 0.29
201 0.23
202 0.3
203 0.3
204 0.29
205 0.29
206 0.27
207 0.23
208 0.21
209 0.21
210 0.12
211 0.09
212 0.07
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.06
225 0.07
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.14
230 0.16
231 0.15
232 0.2
233 0.21
234 0.28
235 0.3
236 0.36
237 0.35
238 0.35
239 0.35
240 0.29
241 0.26
242 0.15
243 0.12
244 0.06
245 0.05
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.17
268 0.17
269 0.2
270 0.21
271 0.22
272 0.22
273 0.25
274 0.27
275 0.27
276 0.29
277 0.32
278 0.32
279 0.3
280 0.31
281 0.29
282 0.33
283 0.3
284 0.32
285 0.27
286 0.27
287 0.27
288 0.26
289 0.25
290 0.18
291 0.16
292 0.11
293 0.1
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.14
302 0.2
303 0.21
304 0.22
305 0.23
306 0.31
307 0.33
308 0.38
309 0.43
310 0.44
311 0.52
312 0.61
313 0.65
314 0.66
315 0.73
316 0.75
317 0.72
318 0.73
319 0.71
320 0.67
321 0.7
322 0.7
323 0.65
324 0.62
325 0.61
326 0.58
327 0.54
328 0.52
329 0.51
330 0.43
331 0.38
332 0.34
333 0.28
334 0.25
335 0.24
336 0.21
337 0.15
338 0.14
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.16
343 0.16
344 0.15
345 0.15
346 0.14
347 0.12
348 0.12
349 0.14
350 0.17
351 0.19
352 0.2
353 0.23
354 0.24
355 0.24
356 0.3
357 0.33
358 0.35
359 0.41
360 0.44
361 0.51
362 0.6
363 0.66
364 0.67
365 0.68
366 0.64
367 0.61
368 0.58
369 0.52
370 0.51
371 0.46
372 0.41
373 0.36
374 0.38
375 0.42
376 0.46
377 0.45
378 0.38
379 0.4
380 0.42
381 0.44
382 0.46
383 0.41
384 0.39
385 0.37
386 0.38
387 0.34
388 0.3
389 0.28
390 0.19
391 0.15
392 0.13
393 0.11
394 0.09
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.09
403 0.08
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.11
408 0.11
409 0.11
410 0.13
411 0.13
412 0.16
413 0.19
414 0.21
415 0.29
416 0.33
417 0.42
418 0.51
419 0.61
420 0.68
421 0.75
422 0.82
423 0.85
424 0.91
425 0.91
426 0.91
427 0.89
428 0.86
429 0.81
430 0.79
431 0.79
432 0.72
433 0.69
434 0.67
435 0.63
436 0.65
437 0.68
438 0.67
439 0.64
440 0.71
441 0.74
442 0.77
443 0.8
444 0.81
445 0.83
446 0.86
447 0.83
448 0.79
449 0.77
450 0.68
451 0.63
452 0.53
453 0.44
454 0.33
455 0.3
456 0.23
457 0.14
458 0.13
459 0.11
460 0.11
461 0.09
462 0.1