Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SBY4

Protein Details
Accession C9SBY4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-193NSASRLKKLLDRKRARAAKKRQDAIDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
173-188LKKLLDRKRARAAKKR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039971  CWC24-like  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG val:VDBG_01977  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16539  RING-HC_RNF113A_B  
Amino Acid Sequences MSSKNLLGSTRAAPDGTYKGLANKTSFVQRNPDAPSRTVGPIKAPTNIRNHYGFCGFGDNCKFLHAREDYKQGWQLDKEWEDVAKGKKNLGGTIVADANRDKVADDDNEEEDAMLENIPFACIICREPYKSPVVTRCGHYFCEPCALKRYRKDPTCAACGSGTSGVFNSASRLKKLLDRKRARAAKKRQDAIDAGEEVSDEEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.24
3 0.23
4 0.22
5 0.19
6 0.23
7 0.27
8 0.3
9 0.27
10 0.26
11 0.27
12 0.34
13 0.37
14 0.35
15 0.38
16 0.38
17 0.42
18 0.46
19 0.5
20 0.44
21 0.42
22 0.42
23 0.38
24 0.4
25 0.37
26 0.31
27 0.29
28 0.32
29 0.33
30 0.36
31 0.36
32 0.37
33 0.43
34 0.45
35 0.44
36 0.4
37 0.39
38 0.37
39 0.34
40 0.29
41 0.22
42 0.25
43 0.21
44 0.23
45 0.24
46 0.22
47 0.2
48 0.22
49 0.22
50 0.16
51 0.23
52 0.21
53 0.23
54 0.26
55 0.33
56 0.31
57 0.35
58 0.4
59 0.34
60 0.33
61 0.29
62 0.28
63 0.27
64 0.28
65 0.25
66 0.21
67 0.2
68 0.18
69 0.21
70 0.23
71 0.23
72 0.22
73 0.22
74 0.23
75 0.24
76 0.23
77 0.2
78 0.17
79 0.12
80 0.13
81 0.14
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.11
86 0.09
87 0.09
88 0.07
89 0.06
90 0.08
91 0.08
92 0.1
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.07
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.03
108 0.04
109 0.04
110 0.06
111 0.1
112 0.12
113 0.15
114 0.17
115 0.21
116 0.25
117 0.26
118 0.29
119 0.31
120 0.34
121 0.33
122 0.35
123 0.37
124 0.35
125 0.35
126 0.35
127 0.31
128 0.27
129 0.34
130 0.31
131 0.27
132 0.34
133 0.37
134 0.4
135 0.46
136 0.53
137 0.53
138 0.57
139 0.61
140 0.61
141 0.62
142 0.61
143 0.55
144 0.49
145 0.39
146 0.35
147 0.32
148 0.25
149 0.2
150 0.14
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.17
157 0.19
158 0.2
159 0.22
160 0.23
161 0.3
162 0.41
163 0.48
164 0.52
165 0.59
166 0.65
167 0.74
168 0.82
169 0.84
170 0.84
171 0.85
172 0.85
173 0.86
174 0.85
175 0.78
176 0.75
177 0.67
178 0.63
179 0.58
180 0.48
181 0.38
182 0.3
183 0.27
184 0.21