Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SAM5

Protein Details
Accession C9SAM5    Localization Confidence Low Confidence Score 8.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-67YDTAGRRTNTRLQRRRRALEAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9, cysk 8, cyto 6, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG val:VDBG_01582  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16275  SF1-HH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50084  KH_TYPE_1  
Amino Acid Sequences MTAEQLDAYVTHFRIREITHQLTLPDVLVTRTAEPGWRREHSPAPEYDTAGRRTNTRLQRRRRALEAERHRCIEEAVARTPSYQLPHDYRRPKGFADRIYIPQADFPAVNFIGQILGPRGATLKAMQERAGVTLAIRGKGSVKEGRGRSKPIGGASDVSSQPLHVLVTAITQRKVDEGKRLIQEVITNAVSTPEWLNEHKKQQLRDLAMANGTFRDDEGRANARAQDQVSLNPTRSLMRVESSLDVEFEGEYARLMEDILGSREGYTDTQERSMVTLPPWRVDRLRAKTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.3
4 0.34
5 0.38
6 0.37
7 0.38
8 0.38
9 0.36
10 0.34
11 0.26
12 0.19
13 0.14
14 0.12
15 0.12
16 0.14
17 0.13
18 0.14
19 0.14
20 0.19
21 0.21
22 0.26
23 0.31
24 0.32
25 0.35
26 0.38
27 0.46
28 0.46
29 0.49
30 0.46
31 0.47
32 0.46
33 0.45
34 0.46
35 0.43
36 0.41
37 0.4
38 0.38
39 0.33
40 0.36
41 0.43
42 0.47
43 0.53
44 0.59
45 0.64
46 0.74
47 0.81
48 0.82
49 0.79
50 0.78
51 0.75
52 0.76
53 0.77
54 0.75
55 0.7
56 0.66
57 0.6
58 0.51
59 0.44
60 0.38
61 0.32
62 0.27
63 0.26
64 0.26
65 0.26
66 0.26
67 0.27
68 0.24
69 0.21
70 0.19
71 0.21
72 0.25
73 0.32
74 0.41
75 0.46
76 0.5
77 0.53
78 0.53
79 0.51
80 0.53
81 0.52
82 0.48
83 0.47
84 0.45
85 0.43
86 0.44
87 0.41
88 0.33
89 0.28
90 0.24
91 0.19
92 0.15
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.11
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.12
111 0.15
112 0.16
113 0.16
114 0.16
115 0.16
116 0.17
117 0.16
118 0.11
119 0.08
120 0.11
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.15
128 0.14
129 0.15
130 0.22
131 0.25
132 0.32
133 0.33
134 0.37
135 0.34
136 0.34
137 0.34
138 0.29
139 0.27
140 0.21
141 0.19
142 0.17
143 0.2
144 0.17
145 0.16
146 0.14
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.09
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.07
155 0.1
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.14
161 0.18
162 0.17
163 0.21
164 0.23
165 0.28
166 0.3
167 0.31
168 0.29
169 0.27
170 0.26
171 0.2
172 0.2
173 0.14
174 0.12
175 0.11
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.08
181 0.1
182 0.13
183 0.19
184 0.24
185 0.3
186 0.36
187 0.4
188 0.4
189 0.45
190 0.5
191 0.47
192 0.46
193 0.42
194 0.37
195 0.35
196 0.33
197 0.26
198 0.19
199 0.16
200 0.11
201 0.09
202 0.11
203 0.09
204 0.1
205 0.15
206 0.18
207 0.19
208 0.2
209 0.23
210 0.22
211 0.24
212 0.23
213 0.22
214 0.2
215 0.22
216 0.25
217 0.25
218 0.25
219 0.23
220 0.23
221 0.21
222 0.21
223 0.21
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.2
228 0.21
229 0.21
230 0.21
231 0.18
232 0.16
233 0.14
234 0.12
235 0.1
236 0.09
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.09
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.14
252 0.13
253 0.15
254 0.18
255 0.19
256 0.22
257 0.22
258 0.22
259 0.23
260 0.25
261 0.23
262 0.21
263 0.26
264 0.26
265 0.31
266 0.34
267 0.36
268 0.36
269 0.43
270 0.5