Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S9P5

Protein Details
Accession C9S9P5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
141-160RYLVDRRKLRRKGRQGTSLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
147-152RKLRRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 10.5, cyto 10.5, plas 2, mito 1, extr 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG val:VDBG_02217  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MGKPDTKTIYANERRFLDDRGTAAALAPNGENPAKIMEKAVIGRIVDAQYFQYQCFALNEAGIVDRVVNDVKFIGGTYGSAQKPTPFLCLAFKLLQLAPSDAVLEMYLSFGGDKFKYLRALACFYIRMTRRAKDVYAILERYLVDRRKLRRKGRQGTSLTFVDEFVDDLLTKTRVCATSFRELPRRTDLVDLGELEERESPLGDIDELLDADDEEQQQEQQQQQQQDETPGSRADDESDGEIVERPQNGGRMDVDRSPSRSRSRSRERTP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.52
3 0.5
4 0.45
5 0.38
6 0.35
7 0.32
8 0.31
9 0.25
10 0.24
11 0.23
12 0.18
13 0.16
14 0.14
15 0.11
16 0.14
17 0.14
18 0.13
19 0.11
20 0.16
21 0.16
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.18
26 0.19
27 0.21
28 0.19
29 0.17
30 0.18
31 0.19
32 0.19
33 0.16
34 0.15
35 0.15
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.15
41 0.16
42 0.16
43 0.17
44 0.12
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.08
51 0.06
52 0.05
53 0.07
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.05
63 0.06
64 0.07
65 0.14
66 0.14
67 0.15
68 0.15
69 0.16
70 0.19
71 0.19
72 0.2
73 0.15
74 0.16
75 0.17
76 0.19
77 0.21
78 0.2
79 0.19
80 0.18
81 0.18
82 0.19
83 0.17
84 0.16
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.09
89 0.09
90 0.06
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.08
102 0.1
103 0.12
104 0.13
105 0.16
106 0.16
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.18
111 0.16
112 0.22
113 0.21
114 0.23
115 0.23
116 0.24
117 0.26
118 0.27
119 0.27
120 0.23
121 0.23
122 0.22
123 0.22
124 0.21
125 0.18
126 0.17
127 0.17
128 0.17
129 0.21
130 0.18
131 0.19
132 0.24
133 0.31
134 0.41
135 0.5
136 0.58
137 0.63
138 0.72
139 0.78
140 0.8
141 0.82
142 0.76
143 0.7
144 0.66
145 0.56
146 0.46
147 0.36
148 0.28
149 0.2
150 0.15
151 0.12
152 0.07
153 0.07
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.11
161 0.12
162 0.14
163 0.18
164 0.21
165 0.29
166 0.33
167 0.37
168 0.43
169 0.43
170 0.45
171 0.47
172 0.44
173 0.36
174 0.35
175 0.31
176 0.26
177 0.26
178 0.22
179 0.18
180 0.18
181 0.17
182 0.15
183 0.15
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.06
195 0.07
196 0.06
197 0.05
198 0.06
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.1
205 0.14
206 0.16
207 0.21
208 0.26
209 0.3
210 0.31
211 0.34
212 0.34
213 0.35
214 0.35
215 0.3
216 0.27
217 0.24
218 0.23
219 0.21
220 0.2
221 0.19
222 0.17
223 0.17
224 0.17
225 0.16
226 0.15
227 0.14
228 0.15
229 0.13
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.16
234 0.21
235 0.21
236 0.22
237 0.23
238 0.24
239 0.27
240 0.29
241 0.33
242 0.33
243 0.38
244 0.42
245 0.46
246 0.51
247 0.56
248 0.61
249 0.65
250 0.72