FuNGI

C9SBS3

Protein Details

Accession

C9SBS3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-45	DILFEQRPRKRVRQQSSELKSNL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
506-572	EKPKQIESSGNARGGGPPRGGQRGGQRGGPQRGGQRGGGGQRGGGGGQQRGRGGPPRASHAPGHMGR

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13.5, cyto 13, nucl 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
KEGG	val:VDBG_01916 -
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

MTTDLAEAIQGLRLDEKDVNIDDILFEQRPRKRVRQQSSELKSNLEKDFLSPSTSFSNDWLNRLQQLAPPQTRTVTRFQRHGLEGRVTGYKNVTVPANSATAKNSTSFSRKPASRAEFVRGAAGFFPFAPGGLEGVESAAALEDQLHRTSGVDAGSSNKLERVIKLGVDGSLLEVAPGLSRGINFSSKKNDQDEAKAVEQELDEEPEQAPDAQNEETAARADGDDAHTPEEDDSEDIDAILPVEFPALEPHGTLAASSARKAGREWAHMVDINRDITNFRELVPDMARDWPFELDTFQKEAIYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAARHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQEFDEVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVSLILLSATVPNTHEFASWVGRTKQKDIYVISTPKRPVPLEHYLWAGKDIHKIVTADKKFSEKGWKDANAALQGKEKPKQIESSGNARGGGPPRGGQRGGQRGGPQRGGQRGGGGQRGGGGGQQRGRGGPPRASHAPGHMGRGGRSGFASAAQDKNIWVHLVQFLKKNTLLPACIFVFSKKRCEQNADALSNQDFCTASEKSAIHMTIEKSVARLKPEDRQLPQIIRLRELLSRGIAVHHGGLLPIVKEVVEILFAQTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGYRKHDGHSFRNLLPGEYTQMAGRAGRRGLDPVGSVIIVPPGASDEVPPVVELQKMILGEASKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSEHATQQLLPEHEKAVKVSEADLAKVKRDSCDTCDKDKVMDVCHQASQDFKELTTSLYSALVKLPIGRKMFSQARLIVYNKDGVRTPGILLADGASVKGSSSGATLHVCELRTLRETRDSTDLLPFIPAFRKYLTPLPQHKKQIQVKTLHVPIADVECLTRYTTKGIVPDIFQGGEENLALQEIIEKRQEAVRTASHSPALECDNFVKHFAMCHDQWLIKDHIAQLQLSLSNQNLQLLPDYEQRVLVLKELQFIDDSARILLKGKVACEIHSGDELVLTELILDNVLADYEPAEIAALLSAFVFQEKTDSEPTLTGNLERGKQTIIDISEKINNVQTIHQVIQSTDDSNDFTSRPRFGLMEVVYEWARGMSFKNITDLTDVLEGTIVRTITRLDETCREVKNAARIIGDPELYQKMQAAQEMIKRDITAVASLYM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.18
3	0.19
4	0.2
5	0.21
6	0.23
7	0.21
8	0.2
9	0.17
10	0.17
11	0.2
12	0.17
13	0.19
14	0.24
15	0.3
16	0.38
17	0.45
18	0.54
19	0.6
20	0.69
21	0.77
22	0.79
23	0.84
24	0.87
25	0.87
26	0.86
27	0.77
28	0.71
29	0.66
30	0.61
31	0.53
32	0.45
33	0.37
34	0.3
35	0.35
36	0.31
37	0.31
38	0.25
39	0.26
40	0.28
41	0.29
42	0.28
43	0.23
44	0.32
45	0.3
46	0.33
47	0.35
48	0.33
49	0.33
50	0.35
51	0.35
52	0.28
53	0.35
54	0.41
55	0.42
56	0.43
57	0.43
58	0.45
59	0.48
60	0.48
61	0.49
62	0.5
63	0.51
64	0.53
65	0.55
66	0.59
67	0.59
68	0.61
69	0.57
70	0.51
71	0.47
72	0.44
73	0.45
74	0.38
75	0.36
76	0.32
77	0.29
78	0.25
79	0.26
80	0.25
81	0.21
82	0.22
83	0.22
84	0.24
85	0.22
86	0.22
87	0.22
88	0.22
89	0.22
90	0.22
91	0.22
92	0.22
93	0.29
94	0.31
95	0.34
96	0.4
97	0.42
98	0.45
99	0.53
100	0.55
101	0.55
102	0.56
103	0.57
104	0.52
105	0.5
106	0.5
107	0.4
108	0.34
109	0.28
110	0.25
111	0.19
112	0.14
113	0.15
114	0.1
115	0.1
116	0.1
117	0.09
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.07
122	0.07
123	0.07
124	0.06
125	0.05
126	0.05
127	0.04
128	0.04
129	0.06
130	0.08
131	0.11
132	0.12
133	0.12
134	0.12
135	0.13
136	0.14
137	0.15
138	0.13
139	0.11
140	0.11
141	0.15
142	0.18
143	0.18
144	0.18
145	0.17
146	0.2
147	0.21
148	0.21
149	0.23
150	0.22
151	0.21
152	0.22
153	0.22
154	0.18
155	0.17
156	0.16
157	0.12
158	0.11
159	0.1
160	0.08
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.07
165	0.06
166	0.06
167	0.06
168	0.09
169	0.12
170	0.19
171	0.2
172	0.24
173	0.33
174	0.37
175	0.43
176	0.45
177	0.47
178	0.44
179	0.48
180	0.5
181	0.47
182	0.44
183	0.4
184	0.36
185	0.33
186	0.29
187	0.25
188	0.2
189	0.18
190	0.16
191	0.16
192	0.16
193	0.14
194	0.15
195	0.14
196	0.13
197	0.1
198	0.13
199	0.12
200	0.12
201	0.12
202	0.12
203	0.12
204	0.11
205	0.11
206	0.09
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.13
211	0.15
212	0.16
213	0.17
214	0.16
215	0.17
216	0.16
217	0.15
218	0.13
219	0.1
220	0.1
221	0.1
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.08
226	0.08
227	0.07
228	0.06
229	0.04
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.07
234	0.09
235	0.09
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.09
242	0.13
243	0.13
244	0.14
245	0.18
246	0.18
247	0.19
248	0.2
249	0.27
250	0.27
251	0.31
252	0.34
253	0.32
254	0.35
255	0.37
256	0.37
257	0.33
258	0.3
259	0.28
260	0.24
261	0.21
262	0.19
263	0.18
264	0.2
265	0.16
266	0.14
267	0.16
268	0.16
269	0.19
270	0.2
271	0.2
272	0.17
273	0.23
274	0.23
275	0.2
276	0.21
277	0.19
278	0.18
279	0.17
280	0.18
281	0.15
282	0.17
283	0.19
284	0.18
285	0.18
286	0.17
287	0.18
288	0.2
289	0.19
290	0.17
291	0.15
292	0.15
293	0.15
294	0.15
295	0.14
296	0.1
297	0.07
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.07
317	0.06
318	0.05
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.07
323	0.07
324	0.08
325	0.1
326	0.11
327	0.15
328	0.16
329	0.18
330	0.21
331	0.24
332	0.24
333	0.27
334	0.36
335	0.38
336	0.47
337	0.47
338	0.52
339	0.54
340	0.55
341	0.61
342	0.53
343	0.46
344	0.42
345	0.43
346	0.35
347	0.32
348	0.32
349	0.21
350	0.19
351	0.16
352	0.1
353	0.07
354	0.08
355	0.07
356	0.06
357	0.07
358	0.06
359	0.07
360	0.07
361	0.07
362	0.06
363	0.05
364	0.06
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.09
376	0.11
377	0.1
378	0.09
379	0.1
380	0.11
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.08
388	0.07
389	0.08
390	0.09
391	0.07
392	0.06
393	0.08
394	0.08
395	0.09
396	0.09
397	0.09
398	0.07
399	0.09
400	0.09
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.09
405	0.08
406	0.08
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.05
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.03
418	0.03
419	0.03
420	0.04
421	0.03
422	0.03
423	0.04
424	0.05
425	0.05
426	0.05
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.1
434	0.13
435	0.14
436	0.17
437	0.19
438	0.24
439	0.26
440	0.29
441	0.33
442	0.31
443	0.34
444	0.33
445	0.34
446	0.36
447	0.4
448	0.39
449	0.38
450	0.37
451	0.35
452	0.37
453	0.33
454	0.28
455	0.29
456	0.35
457	0.33
458	0.33
459	0.34
460	0.31
461	0.3
462	0.3
463	0.24
464	0.17
465	0.18
466	0.18
467	0.16
468	0.17
469	0.17
470	0.19
471	0.27
472	0.27
473	0.25
474	0.25
475	0.28
476	0.27
477	0.28
478	0.35
479	0.27
480	0.32
481	0.37
482	0.38
483	0.36
484	0.38
485	0.39
486	0.34
487	0.34
488	0.29
489	0.27
490	0.28
491	0.3
492	0.31
493	0.32
494	0.28
495	0.28
496	0.31
497	0.29
498	0.34
499	0.34
500	0.37
501	0.37
502	0.36
503	0.34
504	0.31
505	0.31
506	0.26
507	0.24
508	0.18
509	0.17
510	0.18
511	0.21
512	0.21
513	0.21
514	0.25
515	0.31
516	0.31
517	0.31
518	0.34
519	0.38
520	0.41
521	0.4
522	0.36
523	0.32
524	0.34
525	0.34
526	0.29
527	0.24
528	0.23
529	0.23
530	0.22
531	0.18
532	0.14
533	0.13
534	0.13
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.12
540	0.14
541	0.13
542	0.14
543	0.15
544	0.2
545	0.21
546	0.24
547	0.22
548	0.27
549	0.29
550	0.31
551	0.3
552	0.26
553	0.31
554	0.26
555	0.28
556	0.24
557	0.23
558	0.2
559	0.23
560	0.21
561	0.14
562	0.14
563	0.12
564	0.09
565	0.09
566	0.11
567	0.1
568	0.1
569	0.11
570	0.11
571	0.1
572	0.11
573	0.1
574	0.09
575	0.07
576	0.07
577	0.1
578	0.13
579	0.15
580	0.18
581	0.19
582	0.21
583	0.21
584	0.21
585	0.2
586	0.18
587	0.18
588	0.14
589	0.17
590	0.15
591	0.15
592	0.14
593	0.14
594	0.2
595	0.2
596	0.27
597	0.27
598	0.32
599	0.33
600	0.38
601	0.39
602	0.42
603	0.47
604	0.42
605	0.38
606	0.34
607	0.33
608	0.28
609	0.25
610	0.16
611	0.1
612	0.08
613	0.12
614	0.11
615	0.11
616	0.14
617	0.14
618	0.14
619	0.16
620	0.16
621	0.12
622	0.15
623	0.15
624	0.14
625	0.15
626	0.14
627	0.13
628	0.16
629	0.17
630	0.16
631	0.18
632	0.17
633	0.22
634	0.29
635	0.34
636	0.32
637	0.36
638	0.37
639	0.36
640	0.41
641	0.41
642	0.35
643	0.3
644	0.3
645	0.26
646	0.24
647	0.24
648	0.18
649	0.13
650	0.13
651	0.11
652	0.1
653	0.09
654	0.08
655	0.07
656	0.06
657	0.06
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.04
667	0.04
668	0.04
669	0.04
670	0.04
671	0.05
672	0.05
673	0.05
674	0.05
675	0.05
676	0.04
677	0.05
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.06
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.07
690	0.07
691	0.07
692	0.07
693	0.07
694	0.07
695	0.07
696	0.07
697	0.08
698	0.1
699	0.14
700	0.19
701	0.23
702	0.28
703	0.28
704	0.29
705	0.34
706	0.37
707	0.38
708	0.41
709	0.41
710	0.36
711	0.41
712	0.4
713	0.34
714	0.29
715	0.25
716	0.19
717	0.15
718	0.15
719	0.1
720	0.1
721	0.1
722	0.1
723	0.11
724	0.11
725	0.11
726	0.12
727	0.12
728	0.13
729	0.13
730	0.13
731	0.12
732	0.1
733	0.1
734	0.09
735	0.08
736	0.07
737	0.06
738	0.05
739	0.05
740	0.04
741	0.04
742	0.05
743	0.05
744	0.05
745	0.06
746	0.07
747	0.07
748	0.07
749	0.07
750	0.07
751	0.08
752	0.07
753	0.07
754	0.08
755	0.08
756	0.08
757	0.08
758	0.07
759	0.08
760	0.11
761	0.13
762	0.13
763	0.14
764	0.15
765	0.16
766	0.19
767	0.23
768	0.24
769	0.29
770	0.29
771	0.33
772	0.33
773	0.32
774	0.31
775	0.25
776	0.22
777	0.15
778	0.13
779	0.09
780	0.07
781	0.06
782	0.05
783	0.06
784	0.06
785	0.07
786	0.09
787	0.11
788	0.13
789	0.14
790	0.15
791	0.14
792	0.16
793	0.17
794	0.17
795	0.19
796	0.19
797	0.23
798	0.26
799	0.25
800	0.25
801	0.26
802	0.26
803	0.24
804	0.22
805	0.19
806	0.18
807	0.18
808	0.17
809	0.16
810	0.15
811	0.14
812	0.13
813	0.16
814	0.15
815	0.16
816	0.2
817	0.18
818	0.19
819	0.22
820	0.22
821	0.19
822	0.23
823	0.25
824	0.25
825	0.35
826	0.37
827	0.4
828	0.44
829	0.43
830	0.39
831	0.41
832	0.37
833	0.29
834	0.31
835	0.29
836	0.26
837	0.27
838	0.26
839	0.23
840	0.23
841	0.22
842	0.22
843	0.18
844	0.16
845	0.17
846	0.16
847	0.17
848	0.17
849	0.15
850	0.1
851	0.12
852	0.12
853	0.11
854	0.12
855	0.11
856	0.1
857	0.14
858	0.16
859	0.19
860	0.21
861	0.21
862	0.21
863	0.28
864	0.33
865	0.33
866	0.34
867	0.31
868	0.33
869	0.36
870	0.37
871	0.32
872	0.27
873	0.3
874	0.26
875	0.24
876	0.22
877	0.2
878	0.21
879	0.19
880	0.19
881	0.16
882	0.16
883	0.14
884	0.13
885	0.12
886	0.1
887	0.09
888	0.09
889	0.06
890	0.05
891	0.05
892	0.06
893	0.05
894	0.05
895	0.05
896	0.06
897	0.08
898	0.09
899	0.09
900	0.11
901	0.13
902	0.13
903	0.14
904	0.14
905	0.15
906	0.19
907	0.2
908	0.2
909	0.27
910	0.28
911	0.3
912	0.34
913	0.32
914	0.3
915	0.32
916	0.3
917	0.22
918	0.22
919	0.19
920	0.15
921	0.18
922	0.18
923	0.16
924	0.17
925	0.19
926	0.2
927	0.28
928	0.34
929	0.39
930	0.48
931	0.54
932	0.61
933	0.67
934	0.68
935	0.7
936	0.71
937	0.72
938	0.69
939	0.67
940	0.64
941	0.64
942	0.63
943	0.55
944	0.46
945	0.37
946	0.31
947	0.27
948	0.22
949	0.14
950	0.11
951	0.1
952	0.11
953	0.12
954	0.12
955	0.1
956	0.13
957	0.15
958	0.17
959	0.19
960	0.21
961	0.22
962	0.21
963	0.24
964	0.23
965	0.2
966	0.18
967	0.16
968	0.13
969	0.12
970	0.1
971	0.08
972	0.06
973	0.06
974	0.06
975	0.04
976	0.09
977	0.1
978	0.13
979	0.14
980	0.15
981	0.16
982	0.2
983	0.22
984	0.19
985	0.22
986	0.24
987	0.27
988	0.3
989	0.31
990	0.3
991	0.29
992	0.27
993	0.25
994	0.25
995	0.21
996	0.19
997	0.19
998	0.21
999	0.21
1000	0.22
1001	0.21
1002	0.17
1003	0.18
1004	0.2
1005	0.24
1006	0.2
1007	0.23
1008	0.25
1009	0.25
1010	0.26
1011	0.29
1012	0.29
1013	0.23
1014	0.26
1015	0.24
1016	0.25
1017	0.25
1018	0.23
1019	0.19
1020	0.19
1021	0.19
1022	0.17
1023	0.17
1024	0.13
1025	0.15
1026	0.15
1027	0.17
1028	0.15
1029	0.15
1030	0.16
1031	0.16
1032	0.19
1033	0.22
1034	0.24
1035	0.23
1036	0.22
1037	0.22
1038	0.23
1039	0.22
1040	0.2
1041	0.2
1042	0.18
1043	0.22
1044	0.22
1045	0.22
1046	0.19
1047	0.19
1048	0.21
1049	0.17
1050	0.17
1051	0.13
1052	0.13
1053	0.13
1054	0.14
1055	0.16
1056	0.17
1057	0.17
1058	0.17
1059	0.23
1060	0.24
1061	0.25
1062	0.27
1063	0.27
1064	0.24
1065	0.24
1066	0.24
1067	0.17
1068	0.17
1069	0.16
1070	0.13
1071	0.11
1072	0.08
1073	0.07
1074	0.07
1075	0.07
1076	0.06
1077	0.05
1078	0.04
1079	0.04
1080	0.05
1081	0.04
1082	0.04
1083	0.04
1084	0.05
1085	0.05
1086	0.05
1087	0.05
1088	0.05
1089	0.05
1090	0.05
1091	0.05
1092	0.04
1093	0.04
1094	0.05
1095	0.05
1096	0.05
1097	0.06
1098	0.05
1099	0.08
1100	0.09
1101	0.13
1102	0.16
1103	0.18
1104	0.19
1105	0.19
1106	0.21
1107	0.22
1108	0.22
1109	0.19
1110	0.21
1111	0.24
1112	0.26
1113	0.26
1114	0.25
1115	0.23
1116	0.23
1117	0.24
1118	0.23
1119	0.23
1120	0.23
1121	0.23
1122	0.25
1123	0.29
1124	0.29
1125	0.29
1126	0.28
1127	0.27
1128	0.24
1129	0.26
1130	0.27
1131	0.27
1132	0.27
1133	0.28
1134	0.25
1135	0.23
1136	0.26
1137	0.25
1138	0.23
1139	0.19
1140	0.19
1141	0.18
1142	0.19
1143	0.21
1144	0.17
1145	0.2
1146	0.23
1147	0.24
1148	0.24
1149	0.25
1150	0.23
1151	0.22
1152	0.3
1153	0.27
1154	0.26
1155	0.24
1156	0.26
1157	0.24
1158	0.23
1159	0.22
1160	0.14
1161	0.13
1162	0.1
1163	0.12
1164	0.16
1165	0.2
1166	0.2
1167	0.25
1168	0.26
1169	0.27
1170	0.29
1171	0.26
1172	0.22
1173	0.2
1174	0.19
1175	0.15
1176	0.15
1177	0.14
1178	0.12
1179	0.15
1180	0.12
1181	0.1
1182	0.11
1183	0.11
1184	0.13
1185	0.19
1186	0.2
1187	0.22
1188	0.28
1189	0.34
1190	0.4
1191	0.42
1192	0.42
1193	0.39
1194	0.41
1195	0.45
1196	0.45
1197	0.42
1198	0.37
1199	0.36
1200	0.38
1201	0.4
1202	0.36
1203	0.27
1204	0.26
1205	0.28
1206	0.26
1207	0.26
1208	0.23
1209	0.23
1210	0.24
1211	0.25
1212	0.24
1213	0.24
1214	0.29
1215	0.34
1216	0.34
1217	0.31
1218	0.29
1219	0.28
1220	0.28
1221	0.25
1222	0.22

C9SBS3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer