Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SDY8

Protein Details
Accession C9SDY8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
89-108RSTDRRRPLMSQQKGKQGKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-116RRRPLMSQQKGKQGKKPAKAGEGK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR029044  Nucleotide-diphossugar_trans  
IPR011004  Trimer_LpxA-like_sf  
IPR003307  W2_domain  
IPR044123  W2_eIF2B_epsilon  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0031369  F:translation initiation factor binding  
KEGG val:VDBG_03344  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02020  W2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51363  W2  
CDD cd05787  LbH_eIF2B_epsilon  
cd11558  W2_eIF2B_epsilon  
Amino Acid Sequences MSVLLHGKGECNNESCYHKVQHWARPVDDSLHRPTHRTHREASDARPLRPIAPLTHSSTFASSNHQPAAQLPARRQHPTLRSPAPPLDRSTDRRRPLMSQQKGKQGKKPAKAGEGKREDVLQAVVSTTPWWGNNVEIQILMLMRPPDLQVIADSFQDRFHPLTSTSRDHGDLVSNISLEKALTGHKARKEASATNIMTVVLRSGGDDEHRTKANGITPTFVIDSKTRRCLHYDESHPLQSDHYMTLDPTIIDELSADFEVRSDFIDAQIDICTPEVLALWSESFDYELPRRNFLHGVLKDWELNGKAIYAEILEDGYAARANNLQMYEAISRDVIGRWTFPFIPDCNVLPGQSYQMRKHGVSAEDGVEFALSSRVSNAIFGKNTIVGSGSTVSGSIIGRRCTIGVNVTIEDSFIWDDVIIADGAVVRRSILGHSTVVGKKASVGEGSVLSSEVTVSDGIHLPESTVISSLAHDGKPVDPDTKLLGPRGRGTAYVDPEAEDFDDEDPAILQRSLLYNLSALSLSASSLSTLSSDLDSTFGDDDYNTSLSADESRHRLSSFASDDSGAGGKSSSSSSSFHQDAVHGLLDALRDDTGDFDSAKLEFMGLRLANDASDVQMRKAVAVAFARRAAELLTPAHGALEPAKAADAALAARSGAPSFIRESASAAASPSSASSSSRCKRPSLDVLEEEAIVAWWGDERAAAGEGMAAVRERCRVLVEWLENAEEEDDDEEDDEDDSDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.37
3 0.39
4 0.37
5 0.36
6 0.44
7 0.49
8 0.53
9 0.58
10 0.6
11 0.56
12 0.57
13 0.57
14 0.53
15 0.52
16 0.48
17 0.46
18 0.5
19 0.49
20 0.47
21 0.51
22 0.56
23 0.59
24 0.58
25 0.57
26 0.55
27 0.64
28 0.66
29 0.64
30 0.64
31 0.6
32 0.57
33 0.57
34 0.5
35 0.42
36 0.42
37 0.4
38 0.33
39 0.34
40 0.37
41 0.38
42 0.4
43 0.4
44 0.36
45 0.35
46 0.33
47 0.27
48 0.3
49 0.27
50 0.29
51 0.3
52 0.29
53 0.27
54 0.26
55 0.35
56 0.33
57 0.33
58 0.33
59 0.39
60 0.44
61 0.48
62 0.49
63 0.49
64 0.52
65 0.55
66 0.6
67 0.58
68 0.57
69 0.59
70 0.64
71 0.62
72 0.57
73 0.53
74 0.51
75 0.51
76 0.54
77 0.59
78 0.61
79 0.59
80 0.61
81 0.61
82 0.59
83 0.63
84 0.67
85 0.67
86 0.67
87 0.69
88 0.74
89 0.8
90 0.79
91 0.76
92 0.76
93 0.75
94 0.73
95 0.76
96 0.72
97 0.72
98 0.76
99 0.76
100 0.76
101 0.74
102 0.68
103 0.6
104 0.54
105 0.45
106 0.37
107 0.3
108 0.2
109 0.13
110 0.12
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.11
118 0.11
119 0.12
120 0.16
121 0.17
122 0.16
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.09
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.15
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.16
149 0.23
150 0.28
151 0.31
152 0.31
153 0.32
154 0.32
155 0.31
156 0.3
157 0.26
158 0.21
159 0.2
160 0.19
161 0.16
162 0.15
163 0.14
164 0.13
165 0.09
166 0.09
167 0.06
168 0.07
169 0.12
170 0.17
171 0.23
172 0.27
173 0.32
174 0.33
175 0.37
176 0.4
177 0.38
178 0.39
179 0.42
180 0.38
181 0.34
182 0.33
183 0.28
184 0.24
185 0.2
186 0.16
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.09
193 0.13
194 0.16
195 0.19
196 0.2
197 0.2
198 0.21
199 0.23
200 0.26
201 0.28
202 0.25
203 0.24
204 0.23
205 0.25
206 0.25
207 0.22
208 0.19
209 0.17
210 0.22
211 0.25
212 0.33
213 0.33
214 0.34
215 0.37
216 0.39
217 0.43
218 0.45
219 0.46
220 0.45
221 0.48
222 0.49
223 0.46
224 0.42
225 0.35
226 0.28
227 0.23
228 0.17
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.08
273 0.1
274 0.19
275 0.2
276 0.23
277 0.24
278 0.26
279 0.26
280 0.26
281 0.34
282 0.26
283 0.28
284 0.27
285 0.27
286 0.25
287 0.24
288 0.24
289 0.15
290 0.15
291 0.11
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.04
304 0.05
305 0.04
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.08
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.1
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.12
326 0.12
327 0.12
328 0.14
329 0.13
330 0.15
331 0.16
332 0.15
333 0.15
334 0.16
335 0.15
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.16
340 0.19
341 0.17
342 0.22
343 0.24
344 0.23
345 0.25
346 0.25
347 0.22
348 0.2
349 0.2
350 0.17
351 0.15
352 0.15
353 0.12
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.06
362 0.06
363 0.07
364 0.09
365 0.1
366 0.1
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.09
373 0.06
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.09
383 0.1
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.12
389 0.13
390 0.11
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.08
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.04
405 0.05
406 0.04
407 0.03
408 0.03
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.08
419 0.07
420 0.08
421 0.14
422 0.14
423 0.16
424 0.15
425 0.14
426 0.14
427 0.15
428 0.15
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.04
440 0.05
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.07
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.07
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.07
456 0.09
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.11
462 0.14
463 0.15
464 0.14
465 0.12
466 0.14
467 0.17
468 0.2
469 0.2
470 0.21
471 0.23
472 0.23
473 0.25
474 0.27
475 0.24
476 0.21
477 0.24
478 0.26
479 0.27
480 0.27
481 0.24
482 0.22
483 0.21
484 0.21
485 0.16
486 0.11
487 0.09
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.06
496 0.05
497 0.06
498 0.08
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.09
503 0.1
504 0.11
505 0.1
506 0.08
507 0.07
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.05
516 0.06
517 0.07
518 0.06
519 0.07
520 0.07
521 0.08
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.09
530 0.1
531 0.09
532 0.08
533 0.08
534 0.09
535 0.11
536 0.12
537 0.12
538 0.16
539 0.18
540 0.19
541 0.19
542 0.2
543 0.19
544 0.24
545 0.24
546 0.22
547 0.2
548 0.19
549 0.19
550 0.2
551 0.19
552 0.12
553 0.09
554 0.08
555 0.06
556 0.07
557 0.08
558 0.08
559 0.09
560 0.11
561 0.14
562 0.19
563 0.2
564 0.21
565 0.2
566 0.19
567 0.19
568 0.2
569 0.18
570 0.12
571 0.11
572 0.11
573 0.11
574 0.11
575 0.1
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.08
580 0.08
581 0.09
582 0.09
583 0.09
584 0.1
585 0.1
586 0.11
587 0.09
588 0.08
589 0.07
590 0.07
591 0.12
592 0.11
593 0.11
594 0.12
595 0.12
596 0.12
597 0.13
598 0.13
599 0.09
600 0.15
601 0.15
602 0.14
603 0.17
604 0.17
605 0.16
606 0.18
607 0.17
608 0.15
609 0.19
610 0.22
611 0.22
612 0.25
613 0.25
614 0.23
615 0.23
616 0.2
617 0.17
618 0.16
619 0.14
620 0.14
621 0.14
622 0.14
623 0.14
624 0.13
625 0.12
626 0.11
627 0.12
628 0.1
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.09
633 0.09
634 0.08
635 0.06
636 0.07
637 0.07
638 0.07
639 0.07
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.1
645 0.13
646 0.15
647 0.17
648 0.17
649 0.19
650 0.2
651 0.21
652 0.19
653 0.17
654 0.15
655 0.13
656 0.13
657 0.11
658 0.11
659 0.1
660 0.11
661 0.14
662 0.24
663 0.31
664 0.39
665 0.41
666 0.43
667 0.47
668 0.54
669 0.6
670 0.59
671 0.6
672 0.55
673 0.57
674 0.55
675 0.5
676 0.41
677 0.31
678 0.22
679 0.14
680 0.11
681 0.06
682 0.05
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.06
687 0.08
688 0.09
689 0.08
690 0.07
691 0.08
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.08
696 0.08
697 0.1
698 0.13
699 0.13
700 0.14
701 0.17
702 0.19
703 0.24
704 0.32
705 0.33
706 0.34
707 0.35
708 0.35
709 0.32
710 0.31
711 0.25
712 0.16
713 0.14
714 0.11
715 0.1
716 0.1
717 0.1
718 0.1
719 0.09
720 0.1
721 0.09