Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

C9SCA1

Protein Details
Accession C9SCA1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
675-694PALPPKQVSKVKPPNKRFMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-227KKKARKAL
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 9.833, cyto 6, cyto_nucl 5.333, extr 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045046  Vps9-like  
IPR037191  VPS9_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG val:VDBG_02825  -  
Amino Acid Sequences MSTRAGLISLTSSTTPINMAANETPKSSVGSRPSLFRATSSTQGAGAASNDPLQPPRRAQTFHNGAAVVAPLSKAPPPAEIERPDAFETGQDADEDEDDGIDPGRGSVDLDDLPIELVSLTDSFVDALTSKVHKTPPSIDNVAQLFQDFYLSASSHVNTHISALATRQSRANSPAPPSKLTPAGRLRAKAASIGSKDKPQNIPKPETERQMITAEELAEKKKARKALEAKRAMLEEAVERRLCEGLYNRIYRHRSTQDQAQDDKLRSKTAALALVGIGPADLGIDLGEDTTATPAAAVQRAEEIRGWLEQARTDLIRMHEKRYPLGKLNHLKAAHKSIVDTLGAFPSNFRWEPKLTGRKPHTALTNLEAAISFLETVDLSTLRADELPQGPPKDGMPGISRADTFPPAFPPGLTITADGAAEGTVETDTSNAAALRPPPSPSASSGLRAVVQARNRRLSELVNTPAQAFGAASDAVFKSADQGLNNITNSLGDSYKFLLGKLRETQGAPTATGEALVVPRTLDDARKLVSTPPPDEDGSVSGASSVHGADERETAHKPPPSDDKVMSLIGGKKAAARDHSADSARSASSSKKVLFAQEKHAAAPSPLPTSSANPLENAVRNFGNSFNPMGQALEHGVMRGFGRVASSPVAPTLKDPQTKPAEGGDLSAAFPDIAPALPPKQVSKVKPPNKRFMELQNPGDLKLGEVLELLRDYRRLADALKERDAFDGAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.14
5 0.12
6 0.17
7 0.2
8 0.25
9 0.26
10 0.26
11 0.26
12 0.24
13 0.28
14 0.25
15 0.27
16 0.29
17 0.36
18 0.36
19 0.4
20 0.44
21 0.45
22 0.43
23 0.38
24 0.39
25 0.35
26 0.38
27 0.37
28 0.33
29 0.29
30 0.29
31 0.28
32 0.22
33 0.18
34 0.14
35 0.12
36 0.13
37 0.14
38 0.14
39 0.19
40 0.23
41 0.27
42 0.3
43 0.36
44 0.4
45 0.42
46 0.45
47 0.51
48 0.55
49 0.53
50 0.52
51 0.45
52 0.38
53 0.36
54 0.33
55 0.22
56 0.14
57 0.11
58 0.08
59 0.09
60 0.11
61 0.13
62 0.13
63 0.16
64 0.21
65 0.26
66 0.33
67 0.35
68 0.39
69 0.38
70 0.41
71 0.4
72 0.35
73 0.3
74 0.24
75 0.23
76 0.19
77 0.17
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.09
116 0.11
117 0.12
118 0.16
119 0.2
120 0.22
121 0.26
122 0.33
123 0.35
124 0.4
125 0.43
126 0.41
127 0.43
128 0.42
129 0.39
130 0.31
131 0.26
132 0.19
133 0.15
134 0.15
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.2
156 0.22
157 0.27
158 0.31
159 0.3
160 0.35
161 0.41
162 0.42
163 0.43
164 0.43
165 0.41
166 0.44
167 0.41
168 0.43
169 0.42
170 0.46
171 0.48
172 0.47
173 0.46
174 0.41
175 0.4
176 0.34
177 0.3
178 0.28
179 0.27
180 0.32
181 0.31
182 0.35
183 0.38
184 0.41
185 0.47
186 0.49
187 0.54
188 0.55
189 0.59
190 0.58
191 0.64
192 0.63
193 0.6
194 0.55
195 0.48
196 0.43
197 0.39
198 0.33
199 0.25
200 0.22
201 0.17
202 0.17
203 0.16
204 0.15
205 0.17
206 0.19
207 0.22
208 0.25
209 0.3
210 0.3
211 0.38
212 0.47
213 0.54
214 0.62
215 0.64
216 0.62
217 0.58
218 0.57
219 0.47
220 0.37
221 0.27
222 0.21
223 0.18
224 0.19
225 0.17
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.16
230 0.15
231 0.15
232 0.2
233 0.26
234 0.29
235 0.29
236 0.36
237 0.4
238 0.39
239 0.43
240 0.41
241 0.4
242 0.41
243 0.48
244 0.48
245 0.5
246 0.5
247 0.48
248 0.46
249 0.42
250 0.45
251 0.38
252 0.32
253 0.27
254 0.26
255 0.23
256 0.21
257 0.22
258 0.17
259 0.16
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.1
264 0.07
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.02
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.13
303 0.23
304 0.23
305 0.26
306 0.27
307 0.28
308 0.31
309 0.33
310 0.34
311 0.31
312 0.33
313 0.39
314 0.43
315 0.45
316 0.47
317 0.44
318 0.42
319 0.38
320 0.4
321 0.33
322 0.26
323 0.24
324 0.19
325 0.19
326 0.17
327 0.15
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.15
339 0.19
340 0.28
341 0.37
342 0.35
343 0.44
344 0.47
345 0.51
346 0.52
347 0.51
348 0.45
349 0.38
350 0.38
351 0.31
352 0.29
353 0.22
354 0.2
355 0.17
356 0.13
357 0.1
358 0.08
359 0.06
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.07
373 0.09
374 0.12
375 0.15
376 0.16
377 0.16
378 0.17
379 0.16
380 0.16
381 0.14
382 0.13
383 0.12
384 0.15
385 0.16
386 0.16
387 0.16
388 0.14
389 0.16
390 0.16
391 0.15
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.12
397 0.13
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.12
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.09
406 0.07
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.06
421 0.08
422 0.1
423 0.11
424 0.13
425 0.14
426 0.16
427 0.17
428 0.18
429 0.21
430 0.2
431 0.2
432 0.2
433 0.19
434 0.17
435 0.17
436 0.17
437 0.16
438 0.21
439 0.26
440 0.29
441 0.35
442 0.35
443 0.36
444 0.35
445 0.33
446 0.32
447 0.3
448 0.29
449 0.25
450 0.25
451 0.24
452 0.22
453 0.2
454 0.15
455 0.09
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.05
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.07
465 0.08
466 0.11
467 0.13
468 0.11
469 0.12
470 0.14
471 0.17
472 0.18
473 0.15
474 0.13
475 0.11
476 0.11
477 0.12
478 0.1
479 0.07
480 0.08
481 0.1
482 0.13
483 0.13
484 0.13
485 0.17
486 0.18
487 0.22
488 0.25
489 0.25
490 0.24
491 0.25
492 0.26
493 0.26
494 0.26
495 0.22
496 0.18
497 0.17
498 0.15
499 0.14
500 0.13
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.06
506 0.06
507 0.08
508 0.09
509 0.1
510 0.12
511 0.14
512 0.15
513 0.16
514 0.17
515 0.18
516 0.23
517 0.26
518 0.26
519 0.27
520 0.29
521 0.29
522 0.29
523 0.26
524 0.21
525 0.19
526 0.17
527 0.14
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.07
533 0.05
534 0.06
535 0.07
536 0.08
537 0.09
538 0.11
539 0.14
540 0.16
541 0.17
542 0.22
543 0.25
544 0.25
545 0.28
546 0.36
547 0.38
548 0.41
549 0.4
550 0.37
551 0.37
552 0.36
553 0.32
554 0.27
555 0.25
556 0.22
557 0.22
558 0.18
559 0.18
560 0.21
561 0.23
562 0.22
563 0.23
564 0.25
565 0.28
566 0.32
567 0.31
568 0.29
569 0.28
570 0.27
571 0.22
572 0.2
573 0.18
574 0.16
575 0.19
576 0.24
577 0.23
578 0.25
579 0.27
580 0.34
581 0.41
582 0.41
583 0.45
584 0.47
585 0.47
586 0.44
587 0.44
588 0.37
589 0.29
590 0.3
591 0.24
592 0.2
593 0.19
594 0.21
595 0.2
596 0.23
597 0.28
598 0.29
599 0.27
600 0.24
601 0.26
602 0.28
603 0.31
604 0.29
605 0.27
606 0.22
607 0.22
608 0.23
609 0.23
610 0.22
611 0.19
612 0.21
613 0.18
614 0.19
615 0.18
616 0.18
617 0.16
618 0.14
619 0.14
620 0.13
621 0.12
622 0.11
623 0.11
624 0.12
625 0.12
626 0.11
627 0.1
628 0.08
629 0.1
630 0.11
631 0.13
632 0.14
633 0.15
634 0.14
635 0.18
636 0.19
637 0.17
638 0.19
639 0.26
640 0.31
641 0.37
642 0.37
643 0.43
644 0.49
645 0.5
646 0.49
647 0.43
648 0.4
649 0.34
650 0.34
651 0.28
652 0.21
653 0.2
654 0.18
655 0.15
656 0.11
657 0.1
658 0.09
659 0.07
660 0.06
661 0.07
662 0.11
663 0.12
664 0.16
665 0.18
666 0.2
667 0.28
668 0.36
669 0.4
670 0.48
671 0.57
672 0.64
673 0.73
674 0.79
675 0.81
676 0.8
677 0.79
678 0.73
679 0.72
680 0.74
681 0.71
682 0.67
683 0.65
684 0.59
685 0.55
686 0.52
687 0.42
688 0.32
689 0.28
690 0.24
691 0.15
692 0.15
693 0.14
694 0.13
695 0.14
696 0.15
697 0.13
698 0.14
699 0.15
700 0.17
701 0.19
702 0.19
703 0.2
704 0.28
705 0.35
706 0.4
707 0.47
708 0.45
709 0.44
710 0.44