Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SCA1

Protein Details
Accession C9SCA1    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
675-694PALPPKQVSKVKPPNKRFMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
220-227KKKARKAL
Subcellular Location(s) mito 12.5, cyto_mito 9.833, cyto 6, cyto_nucl 5.333, extr 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045046  Vps9-like  
IPR037191  VPS9_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005085  F:guanyl-nucleotide exchange factor activity  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG val:VDBG_02825  -  
Amino Acid Sequences MSTRAGLISLTSSTTPINMAANETPKSSVGSRPSLFRATSSTQGAGAASNDPLQPPRRAQTFHNGAAVVAPLSKAPPPAEIERPDAFETGQDADEDEDDGIDPGRGSVDLDDLPIELVSLTDSFVDALTSKVHKTPPSIDNVAQLFQDFYLSASSHVNTHISALATRQSRANSPAPPSKLTPAGRLRAKAASIGSKDKPQNIPKPETERQMITAEELAEKKKARKALEAKRAMLEEAVERRLCEGLYNRIYRHRSTQDQAQDDKLRSKTAALALVGIGPADLGIDLGEDTTATPAAAVQRAEEIRGWLEQARTDLIRMHEKRYPLGKLNHLKAAHKSIVDTLGAFPSNFRWEPKLTGRKPHTALTNLEAAISFLETVDLSTLRADELPQGPPKDGMPGISRADTFPPAFPPGLTITADGAAEGTVETDTSNAAALRPPPSPSASSGLRAVVQARNRRLSELVNTPAQAFGAASDAVFKSADQGLNNITNSLGDSYKFLLGKLRETQGAPTATGEALVVPRTLDDARKLVSTPPPDEDGSVSGASSVHGADERETAHKPPPSDDKVMSLIGGKKAAARDHSADSARSASSSKKVLFAQEKHAAAPSPLPTSSANPLENAVRNFGNSFNPMGQALEHGVMRGFGRVASSPVAPTLKDPQTKPAEGGDLSAAFPDIAPALPPKQVSKVKPPNKRFMELQNPGDLKLGEVLELLRDYRRLADALKERDAFDGAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.12
4 0.14
5 0.12
6 0.17
7 0.2
8 0.25
9 0.26
10 0.26
11 0.26
12 0.24
13 0.28
14 0.25
15 0.27
16 0.29
17 0.36
18 0.36
19 0.4
20 0.44
21 0.45
22 0.43
23 0.38
24 0.39
25 0.35
26 0.38
27 0.37
28 0.33
29 0.29
30 0.29
31 0.28
32 0.22
33 0.18
34 0.14
35 0.12
36 0.13
37 0.14
38 0.14
39 0.19
40 0.23
41 0.27
42 0.3
43 0.36
44 0.4
45 0.42
46 0.45
47 0.51
48 0.55
49 0.53
50 0.52
51 0.45
52 0.38
53 0.36
54 0.33
55 0.22
56 0.14
57 0.11
58 0.08
59 0.09
60 0.11
61 0.13
62 0.13
63 0.16
64 0.21
65 0.26
66 0.33
67 0.35
68 0.39
69 0.38
70 0.41
71 0.4
72 0.35
73 0.3
74 0.24
75 0.23
76 0.19
77 0.17
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.07
92 0.06
93 0.07
94 0.07
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.09
116 0.11
117 0.12
118 0.16
119 0.2
120 0.22
121 0.26
122 0.33
123 0.35
124 0.4
125 0.43
126 0.41
127 0.43
128 0.42
129 0.39
130 0.31
131 0.26
132 0.19
133 0.15
134 0.15
135 0.09
136 0.08
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.2
156 0.22
157 0.27
158 0.31
159 0.3
160 0.35
161 0.41
162 0.42
163 0.43
164 0.43
165 0.41
166 0.44
167 0.41
168 0.43
169 0.42
170 0.46
171 0.48
172 0.47
173 0.46
174 0.41
175 0.4
176 0.34
177 0.3
178 0.28
179 0.27
180 0.32
181 0.31
182 0.35
183 0.38
184 0.41
185 0.47
186 0.49
187 0.54
188 0.55
189 0.59
190 0.58
191 0.64
192 0.63
193 0.6
194 0.55
195 0.48
196 0.43
197 0.39
198 0.33
199 0.25
200 0.22
201 0.17
202 0.17
203 0.16
204 0.15
205 0.17
206 0.19
207 0.22
208 0.25
209 0.3
210 0.3
211 0.38
212 0.47
213 0.54
214 0.62
215 0.64
216 0.62
217 0.58
218 0.57
219 0.47
220 0.37
221 0.27
222 0.21
223 0.18
224 0.19
225 0.17
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.16
230 0.15
231 0.15
232 0.2
233 0.26
234 0.29
235 0.29
236 0.36
237 0.4
238 0.39
239 0.43
240 0.41
241 0.4
242 0.41
243 0.48
244 0.48
245 0.5
246 0.5
247 0.48
248 0.46
249 0.42
250 0.45
251 0.38
252 0.32
253 0.27
254 0.26
255 0.23
256 0.21
257 0.22
258 0.17
259 0.16
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.1
264 0.07
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.02
269 0.02
270 0.02
271 0.02
272 0.02
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.04
279 0.03
280 0.03
281 0.04
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.11
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.13
302 0.13
303 0.23
304 0.23
305 0.26
306 0.27
307 0.28
308 0.31
309 0.33
310 0.34
311 0.31
312 0.33
313 0.39
314 0.43
315 0.45
316 0.47
317 0.44
318 0.42
319 0.38
320 0.4
321 0.33
322 0.26
323 0.24
324 0.19
325 0.19
326 0.17
327 0.15
328 0.1
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.14
338 0.15
339 0.19
340 0.28
341 0.37
342 0.35
343 0.44
344 0.47
345 0.51
346 0.52
347 0.51
348 0.45
349 0.38
350 0.38
351 0.31
352 0.29
353 0.22
354 0.2
355 0.17
356 0.13
357 0.1
358 0.08
359 0.06
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.03
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.07
373 0.09
374 0.12
375 0.15
376 0.16
377 0.16
378 0.17
379 0.16
380 0.16
381 0.14
382 0.13
383 0.12
384 0.15
385 0.16
386 0.16
387 0.16
388 0.14
389 0.16
390 0.16
391 0.15
392 0.12
393 0.13
394 0.14
395 0.13
396 0.12
397 0.13
398 0.12
399 0.13
400 0.13
401 0.12
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.09
406 0.07
407 0.05
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.03
415 0.03
416 0.03
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.06
421 0.08
422 0.1
423 0.11
424 0.13
425 0.14
426 0.16
427 0.17
428 0.18
429 0.21
430 0.2
431 0.2
432 0.2
433 0.19
434 0.17
435 0.17
436 0.17
437 0.16
438 0.21
439 0.26
440 0.29
441 0.35
442 0.35
443 0.36
444 0.35
445 0.33
446 0.32
447 0.3
448 0.29
449 0.25
450 0.25
451 0.24
452 0.22
453 0.2
454 0.15
455 0.09
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.05
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.07
465 0.08
466 0.11
467 0.13
468 0.11
469 0.12
470 0.14
471 0.17
472 0.18
473 0.15
474 0.13
475 0.11
476 0.11
477 0.12
478 0.1
479 0.07
480 0.08
481 0.1
482 0.13
483 0.13
484 0.13
485 0.17
486 0.18
487 0.22
488 0.25
489 0.25
490 0.24
491 0.25
492 0.26
493 0.26
494 0.26
495 0.22
496 0.18
497 0.17
498 0.15
499 0.14
500 0.13
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.06
506 0.06
507 0.08
508 0.09
509 0.1
510 0.12
511 0.14
512 0.15
513 0.16
514 0.17
515 0.18
516 0.23
517 0.26
518 0.26
519 0.27
520 0.29
521 0.29
522 0.29
523 0.26
524 0.21
525 0.19
526 0.17
527 0.14
528 0.11
529 0.1
530 0.1
531 0.09
532 0.07
533 0.05
534 0.06
535 0.07
536 0.08
537 0.09
538 0.11
539 0.14
540 0.16
541 0.17
542 0.22
543 0.25
544 0.25
545 0.28
546 0.36
547 0.38
548 0.41
549 0.4
550 0.37
551 0.37
552 0.36
553 0.32
554 0.27
555 0.25
556 0.22
557 0.22
558 0.18
559 0.18
560 0.21
561 0.23
562 0.22
563 0.23
564 0.25
565 0.28
566 0.32
567 0.31
568 0.29
569 0.28
570 0.27
571 0.22
572 0.2
573 0.18
574 0.16
575 0.19
576 0.24
577 0.23
578 0.25
579 0.27
580 0.34
581 0.41
582 0.41
583 0.45
584 0.47
585 0.47
586 0.44
587 0.44
588 0.37
589 0.29
590 0.3
591 0.24
592 0.2
593 0.19
594 0.21
595 0.2
596 0.23
597 0.28
598 0.29
599 0.27
600 0.24
601 0.26
602 0.28
603 0.31
604 0.29
605 0.27
606 0.22
607 0.22
608 0.23
609 0.23
610 0.22
611 0.19
612 0.21
613 0.18
614 0.19
615 0.18
616 0.18
617 0.16
618 0.14
619 0.14
620 0.13
621 0.12
622 0.11
623 0.11
624 0.12
625 0.12
626 0.11
627 0.1
628 0.08
629 0.1
630 0.11
631 0.13
632 0.14
633 0.15
634 0.14
635 0.18
636 0.19
637 0.17
638 0.19
639 0.26
640 0.31
641 0.37
642 0.37
643 0.43
644 0.49
645 0.5
646 0.49
647 0.43
648 0.4
649 0.34
650 0.34
651 0.28
652 0.21
653 0.2
654 0.18
655 0.15
656 0.11
657 0.1
658 0.09
659 0.07
660 0.06
661 0.07
662 0.11
663 0.12
664 0.16
665 0.18
666 0.2
667 0.28
668 0.36
669 0.4
670 0.48
671 0.57
672 0.64
673 0.73
674 0.79
675 0.81
676 0.8
677 0.79
678 0.73
679 0.72
680 0.74
681 0.71
682 0.67
683 0.65
684 0.59
685 0.55
686 0.52
687 0.42
688 0.32
689 0.28
690 0.24
691 0.15
692 0.15
693 0.14
694 0.13
695 0.14
696 0.15
697 0.13
698 0.14
699 0.15
700 0.17
701 0.19
702 0.19
703 0.2
704 0.28
705 0.35
706 0.4
707 0.47
708 0.45
709 0.44
710 0.44