Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S932

Protein Details
Accession C9S932    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-313DFLGKFTKPGKRTNKKARPQTGLEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
210-215RRKKRK
296-302GKRTNKK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 9, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG val:VDBG_00187  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MQHMRDLNTGAGEAVWVEAEAPKNQGKGKQTQSLEDAIRGLDVKDDPSSLGDDARFAQGLPKANYQSQQDVPDAIAGLQPDMDPRLREVLEALDDEAYVEEDDDIFQELAKDGREISQYEFEDQFGEEDDGWESDHTAKPNKEYNDDAVPELVTVDGAEPTAADQNEDWLEDFKQFKKDQKNPGVKPRGAAVDPSEVQSSMWTTTTMGGRRKKRKGALTNPSSYSMTSSSMVRTEQLTLLDARFDRIEEEYTSEMGGGDDLGSVSAVSAMSSVQGETRNDLDNILDDFLGKFTKPGKRTNKKARPQTGLEQLDEIRRGLGPARLRPQGYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.05
4 0.05
5 0.08
6 0.11
7 0.12
8 0.16
9 0.18
10 0.22
11 0.25
12 0.31
13 0.33
14 0.4
15 0.46
16 0.51
17 0.5
18 0.51
19 0.52
20 0.52
21 0.47
22 0.39
23 0.33
24 0.24
25 0.23
26 0.19
27 0.16
28 0.13
29 0.12
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.13
34 0.14
35 0.16
36 0.13
37 0.15
38 0.13
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.14
43 0.12
44 0.15
45 0.17
46 0.24
47 0.26
48 0.3
49 0.32
50 0.34
51 0.39
52 0.38
53 0.4
54 0.37
55 0.36
56 0.31
57 0.29
58 0.27
59 0.23
60 0.2
61 0.14
62 0.12
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.14
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.09
101 0.11
102 0.12
103 0.14
104 0.2
105 0.2
106 0.22
107 0.22
108 0.2
109 0.19
110 0.18
111 0.15
112 0.1
113 0.1
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.1
123 0.12
124 0.16
125 0.17
126 0.2
127 0.27
128 0.28
129 0.28
130 0.28
131 0.3
132 0.29
133 0.29
134 0.26
135 0.2
136 0.18
137 0.15
138 0.13
139 0.09
140 0.05
141 0.04
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.1
159 0.12
160 0.12
161 0.18
162 0.19
163 0.26
164 0.35
165 0.42
166 0.49
167 0.58
168 0.66
169 0.65
170 0.74
171 0.76
172 0.66
173 0.59
174 0.52
175 0.45
176 0.35
177 0.31
178 0.23
179 0.2
180 0.2
181 0.2
182 0.18
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.12
187 0.08
188 0.09
189 0.07
190 0.07
191 0.1
192 0.14
193 0.18
194 0.24
195 0.31
196 0.4
197 0.5
198 0.57
199 0.62
200 0.66
201 0.72
202 0.75
203 0.78
204 0.79
205 0.76
206 0.74
207 0.68
208 0.64
209 0.55
210 0.44
211 0.36
212 0.26
213 0.21
214 0.17
215 0.15
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.13
223 0.12
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.14
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.12
236 0.16
237 0.15
238 0.15
239 0.15
240 0.14
241 0.12
242 0.1
243 0.09
244 0.05
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.07
261 0.11
262 0.12
263 0.14
264 0.17
265 0.19
266 0.19
267 0.19
268 0.18
269 0.16
270 0.17
271 0.15
272 0.13
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.13
277 0.1
278 0.11
279 0.17
280 0.25
281 0.29
282 0.39
283 0.49
284 0.58
285 0.69
286 0.79
287 0.83
288 0.84
289 0.91
290 0.91
291 0.88
292 0.84
293 0.81
294 0.81
295 0.74
296 0.65
297 0.57
298 0.5
299 0.47
300 0.42
301 0.33
302 0.24
303 0.2
304 0.2
305 0.19
306 0.23
307 0.25
308 0.32
309 0.39
310 0.45