Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S6L0

Protein Details
Accession C9S6L0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-158MRYSLEKRQRGGRKKKKKKFDHQLETDWDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-148KRQRGGRKKKKKK
373-378KRKKKS
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, mito 4, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG val:VDBG_00609  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MAAPPPPPPARGGLSLYANLLDPASDPSATISSAPVRYNQDGSAVDLGDDAAAKKPKDPCPSPPALSFVNVDAKAVKPKPSFPKAAPQVMPLPAGPTTSDVPTAVATLGGAQSQQKTSLADWAAAGDDEMRYSLEKRQRGGRKKKKKKFDHQLETDWDEIYDPTRPTNVDEYLRSDERIREVQDWKAVLYRHRRKKSFSDDSDQDSVRDSRPAANQFAPPSNYSFAPPPPSPPTLAQLPDDATADDVYARRQTLHTAPVPPPLDFIPPPTSPPPPPPSSEPKETATISRAPVRYSPSKPSEDDVPDSPPLSLGLGADSHAGNRTSDSEAPRSLRPGQAGFAQRLMSKYGWTKGSGLGADESGIINPLRVQVEKRKKKSDAEGGGWRDPANKAKIIGGQRRDDGAASSSGYGPMSNVIVLRNMLEGMQDLQGEISSGLGQEIGEECGDKYGRVERLYFDVENRQVFIKFTDQVSGLRAVSELNGRVFNGNTVAATFYDAEQFELGVYI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.34
3 0.33
4 0.28
5 0.24
6 0.2
7 0.16
8 0.11
9 0.09
10 0.12
11 0.13
12 0.12
13 0.12
14 0.14
15 0.15
16 0.16
17 0.15
18 0.14
19 0.17
20 0.2
21 0.21
22 0.24
23 0.29
24 0.32
25 0.34
26 0.32
27 0.32
28 0.29
29 0.31
30 0.29
31 0.22
32 0.19
33 0.17
34 0.16
35 0.12
36 0.11
37 0.09
38 0.12
39 0.17
40 0.17
41 0.23
42 0.31
43 0.39
44 0.48
45 0.52
46 0.54
47 0.59
48 0.66
49 0.64
50 0.59
51 0.55
52 0.47
53 0.44
54 0.37
55 0.31
56 0.31
57 0.27
58 0.25
59 0.23
60 0.23
61 0.3
62 0.31
63 0.36
64 0.31
65 0.39
66 0.49
67 0.54
68 0.58
69 0.52
70 0.61
71 0.6
72 0.66
73 0.58
74 0.52
75 0.5
76 0.46
77 0.44
78 0.33
79 0.28
80 0.2
81 0.2
82 0.17
83 0.14
84 0.15
85 0.14
86 0.15
87 0.13
88 0.13
89 0.13
90 0.13
91 0.1
92 0.08
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.06
97 0.07
98 0.08
99 0.1
100 0.11
101 0.12
102 0.12
103 0.13
104 0.14
105 0.2
106 0.18
107 0.17
108 0.16
109 0.15
110 0.15
111 0.13
112 0.13
113 0.07
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.15
121 0.22
122 0.25
123 0.28
124 0.37
125 0.47
126 0.57
127 0.67
128 0.71
129 0.76
130 0.84
131 0.91
132 0.92
133 0.93
134 0.93
135 0.93
136 0.93
137 0.93
138 0.88
139 0.85
140 0.79
141 0.71
142 0.61
143 0.49
144 0.38
145 0.28
146 0.21
147 0.16
148 0.14
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.16
154 0.2
155 0.22
156 0.2
157 0.21
158 0.26
159 0.3
160 0.3
161 0.29
162 0.26
163 0.25
164 0.25
165 0.28
166 0.25
167 0.25
168 0.27
169 0.28
170 0.3
171 0.29
172 0.25
173 0.25
174 0.24
175 0.25
176 0.34
177 0.41
178 0.48
179 0.57
180 0.6
181 0.62
182 0.7
183 0.74
184 0.73
185 0.68
186 0.66
187 0.6
188 0.63
189 0.61
190 0.52
191 0.41
192 0.33
193 0.29
194 0.22
195 0.2
196 0.16
197 0.16
198 0.21
199 0.24
200 0.24
201 0.25
202 0.27
203 0.27
204 0.3
205 0.27
206 0.23
207 0.22
208 0.21
209 0.19
210 0.18
211 0.17
212 0.16
213 0.2
214 0.19
215 0.21
216 0.24
217 0.24
218 0.25
219 0.24
220 0.26
221 0.23
222 0.25
223 0.21
224 0.18
225 0.18
226 0.16
227 0.15
228 0.12
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.07
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.11
240 0.12
241 0.17
242 0.18
243 0.21
244 0.21
245 0.27
246 0.28
247 0.25
248 0.24
249 0.2
250 0.21
251 0.17
252 0.2
253 0.18
254 0.17
255 0.2
256 0.21
257 0.23
258 0.22
259 0.28
260 0.3
261 0.27
262 0.3
263 0.32
264 0.38
265 0.41
266 0.44
267 0.41
268 0.38
269 0.39
270 0.37
271 0.34
272 0.28
273 0.25
274 0.22
275 0.25
276 0.24
277 0.21
278 0.23
279 0.27
280 0.31
281 0.32
282 0.37
283 0.36
284 0.39
285 0.39
286 0.38
287 0.39
288 0.35
289 0.35
290 0.29
291 0.27
292 0.25
293 0.24
294 0.22
295 0.16
296 0.13
297 0.11
298 0.09
299 0.06
300 0.06
301 0.05
302 0.06
303 0.07
304 0.06
305 0.06
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.09
310 0.11
311 0.13
312 0.16
313 0.19
314 0.2
315 0.22
316 0.25
317 0.25
318 0.27
319 0.26
320 0.26
321 0.25
322 0.23
323 0.22
324 0.25
325 0.27
326 0.24
327 0.24
328 0.22
329 0.21
330 0.21
331 0.23
332 0.17
333 0.17
334 0.19
335 0.21
336 0.22
337 0.22
338 0.22
339 0.21
340 0.24
341 0.21
342 0.19
343 0.15
344 0.13
345 0.12
346 0.11
347 0.1
348 0.07
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.06
353 0.09
354 0.1
355 0.11
356 0.15
357 0.24
358 0.36
359 0.46
360 0.54
361 0.59
362 0.63
363 0.68
364 0.73
365 0.73
366 0.69
367 0.65
368 0.66
369 0.63
370 0.61
371 0.55
372 0.46
373 0.38
374 0.33
375 0.33
376 0.29
377 0.25
378 0.24
379 0.26
380 0.32
381 0.38
382 0.44
383 0.43
384 0.43
385 0.43
386 0.44
387 0.41
388 0.36
389 0.28
390 0.23
391 0.18
392 0.15
393 0.14
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.11
398 0.09
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.1
405 0.1
406 0.1
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.1
414 0.09
415 0.09
416 0.09
417 0.09
418 0.09
419 0.08
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.08
431 0.08
432 0.12
433 0.13
434 0.12
435 0.13
436 0.19
437 0.24
438 0.25
439 0.27
440 0.25
441 0.3
442 0.35
443 0.34
444 0.3
445 0.34
446 0.36
447 0.36
448 0.35
449 0.32
450 0.27
451 0.27
452 0.27
453 0.24
454 0.23
455 0.22
456 0.24
457 0.24
458 0.24
459 0.26
460 0.27
461 0.21
462 0.19
463 0.18
464 0.15
465 0.15
466 0.19
467 0.19
468 0.18
469 0.19
470 0.2
471 0.22
472 0.22
473 0.21
474 0.19
475 0.17
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.12
480 0.14
481 0.14
482 0.12
483 0.16
484 0.16
485 0.16
486 0.15
487 0.15