Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SJR3

Protein Details
Accession C9SJR3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-321RCDFMGCRKTYQKKEHLKRHQRAAHGBasic
372-393YDELCKQSKTRNTKKGLRTAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
KEGG val:VDBG_05786  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MIPSSWSHEQGSSIDIMDACFVRDPSFDFNTPLLSSSSASSPTYDSCDPFTPRSGRSTPHASAVDFSESFSSHGSFSFEPAAAAMPIHHKNHSHQHYHRAGTMDMPLQYSASMPLTPSRRHFSGIDIDYNTMLQATLNQQCMTTMSPVQATMMDQYASMPQDLQSSPFTMPTPSRSLPSSTPNHAVNMWPCNESPIMMFGNHGTPSPSPLQSMSMKRDHDSPSPPPSRSFRRRTMTEAQRRTMALQRHQSEMMYRSQHDSEAMAQLRSMKLDHHSAEDELDSVYVDRRVVPRPRERCDFMGCRKTYQKKEHLKRHQRAAHGIGGTPEMHTCPADGCHKVFKDRFDNFKQHLRIHKDGKSTRTPYNEEAAQMYDELCKQSKTRNTKKGLRTAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.13
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.14
11 0.16
12 0.21
13 0.26
14 0.26
15 0.27
16 0.27
17 0.29
18 0.29
19 0.27
20 0.22
21 0.18
22 0.17
23 0.16
24 0.17
25 0.17
26 0.17
27 0.17
28 0.17
29 0.17
30 0.22
31 0.22
32 0.22
33 0.24
34 0.29
35 0.32
36 0.32
37 0.38
38 0.37
39 0.37
40 0.42
41 0.41
42 0.39
43 0.41
44 0.46
45 0.41
46 0.44
47 0.43
48 0.37
49 0.35
50 0.35
51 0.33
52 0.25
53 0.24
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.1
60 0.11
61 0.14
62 0.13
63 0.14
64 0.16
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.1
70 0.1
71 0.09
72 0.13
73 0.18
74 0.2
75 0.23
76 0.24
77 0.28
78 0.39
79 0.45
80 0.48
81 0.47
82 0.55
83 0.59
84 0.59
85 0.58
86 0.5
87 0.43
88 0.36
89 0.35
90 0.28
91 0.22
92 0.2
93 0.17
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.11
98 0.09
99 0.09
100 0.08
101 0.13
102 0.18
103 0.21
104 0.25
105 0.29
106 0.29
107 0.32
108 0.32
109 0.31
110 0.35
111 0.34
112 0.34
113 0.29
114 0.29
115 0.26
116 0.25
117 0.21
118 0.12
119 0.09
120 0.05
121 0.06
122 0.1
123 0.13
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.16
128 0.17
129 0.17
130 0.14
131 0.11
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.11
152 0.13
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.12
157 0.13
158 0.15
159 0.2
160 0.18
161 0.2
162 0.2
163 0.22
164 0.23
165 0.29
166 0.29
167 0.27
168 0.3
169 0.29
170 0.29
171 0.26
172 0.26
173 0.21
174 0.21
175 0.19
176 0.17
177 0.16
178 0.16
179 0.16
180 0.14
181 0.12
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.08
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.08
192 0.11
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.15
198 0.19
199 0.23
200 0.24
201 0.27
202 0.28
203 0.28
204 0.33
205 0.33
206 0.32
207 0.33
208 0.34
209 0.38
210 0.41
211 0.41
212 0.4
213 0.42
214 0.48
215 0.52
216 0.54
217 0.54
218 0.57
219 0.59
220 0.62
221 0.67
222 0.68
223 0.69
224 0.67
225 0.6
226 0.55
227 0.53
228 0.48
229 0.44
230 0.39
231 0.36
232 0.39
233 0.39
234 0.39
235 0.39
236 0.37
237 0.34
238 0.31
239 0.29
240 0.24
241 0.23
242 0.23
243 0.23
244 0.23
245 0.21
246 0.19
247 0.16
248 0.19
249 0.19
250 0.16
251 0.15
252 0.17
253 0.17
254 0.17
255 0.15
256 0.1
257 0.12
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.2
263 0.2
264 0.19
265 0.17
266 0.12
267 0.11
268 0.08
269 0.06
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.1
274 0.13
275 0.2
276 0.28
277 0.36
278 0.45
279 0.52
280 0.58
281 0.63
282 0.64
283 0.61
284 0.62
285 0.62
286 0.61
287 0.63
288 0.58
289 0.57
290 0.62
291 0.67
292 0.68
293 0.69
294 0.7
295 0.72
296 0.81
297 0.86
298 0.88
299 0.9
300 0.89
301 0.9
302 0.86
303 0.8
304 0.76
305 0.7
306 0.65
307 0.55
308 0.47
309 0.38
310 0.33
311 0.28
312 0.21
313 0.17
314 0.12
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.1
319 0.14
320 0.18
321 0.21
322 0.22
323 0.29
324 0.31
325 0.39
326 0.41
327 0.45
328 0.5
329 0.54
330 0.6
331 0.6
332 0.66
333 0.63
334 0.69
335 0.67
336 0.64
337 0.67
338 0.67
339 0.68
340 0.67
341 0.68
342 0.69
343 0.69
344 0.7
345 0.7
346 0.67
347 0.65
348 0.65
349 0.65
350 0.58
351 0.59
352 0.54
353 0.45
354 0.42
355 0.37
356 0.3
357 0.25
358 0.22
359 0.18
360 0.17
361 0.2
362 0.19
363 0.2
364 0.21
365 0.3
366 0.38
367 0.47
368 0.56
369 0.62
370 0.7
371 0.77
372 0.85
373 0.86