FuNGI

C9STP8

Protein Details

Accession

C9STP8

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-58	QDQKPNPTGQQPRPPPIKRRAKGDPLVARRRPQPKPNAPRPQGAG	Hydrophilic
555-577	SETESTLRKKKLKKNGSSVQVSR	Hydrophilic
653-675	QADKTTQVHRRRARIRVPAHPPD	Hydrophilic
677-703	GPLNPGRSSQRCRRRAYRQKNSTDAST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-54	PRPPPIKRRAKGDPLVARRRPQPKPNAPRP
536-546	AARKGKSLKRP
562-568	RKKKLKK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	val:VDBG_08319 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSAPPSGLPNGQAQDQKPNPTGQQPRPPPIKRRAKGDPLVARRRPQPKPNAPRPQGAGAASSSRATPPSAALRPEVHTAGLLARITNNRTKTAANGGWTEPLPPGGREWKIVTTKRALMEGTRHHVMRFSSSRIEKEKLHIDPTDQNDFTRPVTLQRRDPRQPAAGREVKPEEEEPEPEPNPEDEKEAERIAQLKAEKDAWKAMEAAKSAPAIKDPNASTRTKQPKQEDRGVQFHRAPRSEKERKQQSLRYEEALPWHIEDADGKHVWVGSYVAPLSETTVCLVATTDGKFAMTPLEKWYKFQPKPNFTTMRIEEAEALMKQQSGVSRWHMQAQEKKAGQKDLEDWRKFKNGPSRIKTESSTFRGVSKSEKMDHDEIDFEGDEFQDDDEAPNFEPDNDEDQKESAERIKREQLGANVFGEGDEGKVDQEELETRLLEESRKREGKTINKALVKREKETIYKKDSDDEDGNRYFGPSDEEDSDDESKDGEDEAKKDEDKASSQDPSAQSQDANGAKDKDANSKGTLTPSGKQKEADAARKGKSLKRPGSPNLSESSETESTLRKKKLKKNGSSVQVSRSGTPLPSGHKHKVGMSSMSDGEATGGEMSDGQQRKKKIKLLGTGARSTPTGSRAGSPAPAGAAGSTLRPLEESMDQADKTTQVHRRRARIRVPAHPPDPGPLNPGRSSQRCRRRAYRQKNSTDASTNALVMDQARHPKLDGSTS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.43
3	0.48
4	0.45
5	0.47
6	0.46
7	0.5
8	0.58
9	0.57
10	0.63
11	0.65
12	0.71
13	0.77
14	0.82
15	0.81
16	0.82
17	0.84
18	0.79
19	0.79
20	0.8
21	0.8
22	0.79
23	0.8
24	0.79
25	0.78
26	0.83
27	0.8
28	0.76
29	0.75
30	0.77
31	0.76
32	0.76
33	0.77
34	0.77
35	0.82
36	0.87
37	0.9
38	0.85
39	0.83
40	0.78
41	0.72
42	0.65
43	0.55
44	0.46
45	0.37
46	0.35
47	0.29
48	0.24
49	0.2
50	0.17
51	0.17
52	0.16
53	0.15
54	0.17
55	0.24
56	0.28
57	0.29
58	0.31
59	0.33
60	0.34
61	0.37
62	0.34
63	0.26
64	0.22
65	0.2
66	0.18
67	0.19
68	0.16
69	0.12
70	0.15
71	0.19
72	0.23
73	0.29
74	0.3
75	0.3
76	0.32
77	0.32
78	0.32
79	0.37
80	0.36
81	0.32
82	0.33
83	0.31
84	0.33
85	0.32
86	0.3
87	0.21
88	0.22
89	0.2
90	0.17
91	0.2
92	0.24
93	0.25
94	0.27
95	0.3
96	0.34
97	0.41
98	0.45
99	0.46
100	0.44
101	0.47
102	0.46
103	0.45
104	0.38
105	0.33
106	0.36
107	0.38
108	0.38
109	0.38
110	0.37
111	0.34
112	0.37
113	0.35
114	0.36
115	0.33
116	0.31
117	0.35
118	0.38
119	0.44
120	0.46
121	0.48
122	0.42
123	0.44
124	0.48
125	0.43
126	0.44
127	0.39
128	0.38
129	0.41
130	0.44
131	0.46
132	0.38
133	0.36
134	0.34
135	0.35
136	0.32
137	0.28
138	0.23
139	0.23
140	0.32
141	0.37
142	0.43
143	0.5
144	0.59
145	0.63
146	0.67
147	0.65
148	0.64
149	0.64
150	0.6
151	0.61
152	0.59
153	0.54
154	0.55
155	0.53
156	0.46
157	0.44
158	0.39
159	0.33
160	0.27
161	0.28
162	0.24
163	0.27
164	0.27
165	0.24
166	0.25
167	0.23
168	0.24
169	0.23
170	0.23
171	0.18
172	0.2
173	0.23
174	0.21
175	0.2
176	0.18
177	0.2
178	0.17
179	0.19
180	0.18
181	0.17
182	0.19
183	0.23
184	0.24
185	0.23
186	0.27
187	0.24
188	0.23
189	0.23
190	0.23
191	0.22
192	0.21
193	0.2
194	0.18
195	0.19
196	0.18
197	0.17
198	0.17
199	0.16
200	0.16
201	0.21
202	0.2
203	0.26
204	0.29
205	0.31
206	0.31
207	0.39
208	0.48
209	0.48
210	0.55
211	0.57
212	0.63
213	0.68
214	0.75
215	0.74
216	0.69
217	0.73
218	0.68
219	0.64
220	0.59
221	0.56
222	0.53
223	0.48
224	0.46
225	0.43
226	0.5
227	0.55
228	0.57
229	0.62
230	0.66
231	0.7
232	0.74
233	0.74
234	0.71
235	0.69
236	0.64
237	0.57
238	0.48
239	0.42
240	0.38
241	0.35
242	0.27
243	0.19
244	0.17
245	0.14
246	0.13
247	0.12
248	0.11
249	0.13
250	0.13
251	0.12
252	0.12
253	0.12
254	0.12
255	0.12
256	0.11
257	0.06
258	0.08
259	0.08
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.09
264	0.09
265	0.08
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.07
270	0.08
271	0.06
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.11
280	0.1
281	0.1
282	0.15
283	0.23
284	0.23
285	0.25
286	0.33
287	0.39
288	0.42
289	0.5
290	0.55
291	0.54
292	0.59
293	0.65
294	0.62
295	0.54
296	0.59
297	0.51
298	0.46
299	0.39
300	0.35
301	0.27
302	0.23
303	0.22
304	0.14
305	0.13
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.08
310	0.08
311	0.09
312	0.11
313	0.15
314	0.18
315	0.19
316	0.24
317	0.25
318	0.29
319	0.34
320	0.36
321	0.4
322	0.37
323	0.4
324	0.38
325	0.38
326	0.33
327	0.28
328	0.29
329	0.31
330	0.39
331	0.38
332	0.38
333	0.38
334	0.43
335	0.42
336	0.41
337	0.41
338	0.4
339	0.47
340	0.5
341	0.53
342	0.51
343	0.53
344	0.5
345	0.45
346	0.42
347	0.37
348	0.36
349	0.3
350	0.28
351	0.27
352	0.26
353	0.25
354	0.24
355	0.22
356	0.22
357	0.23
358	0.26
359	0.26
360	0.26
361	0.23
362	0.2
363	0.17
364	0.15
365	0.14
366	0.09
367	0.08
368	0.07
369	0.06
370	0.05
371	0.05
372	0.04
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.09
383	0.14
384	0.14
385	0.15
386	0.15
387	0.15
388	0.15
389	0.15
390	0.14
391	0.14
392	0.18
393	0.19
394	0.22
395	0.28
396	0.29
397	0.31
398	0.33
399	0.31
400	0.29
401	0.3
402	0.26
403	0.2
404	0.18
405	0.16
406	0.13
407	0.09
408	0.06
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.06
417	0.07
418	0.08
419	0.08
420	0.08
421	0.09
422	0.1
423	0.11
424	0.14
425	0.16
426	0.24
427	0.28
428	0.29
429	0.33
430	0.4
431	0.47
432	0.53
433	0.58
434	0.57
435	0.58
436	0.59
437	0.62
438	0.63
439	0.58
440	0.5
441	0.47
442	0.44
443	0.46
444	0.52
445	0.52
446	0.49
447	0.5
448	0.48
449	0.48
450	0.45
451	0.43
452	0.4
453	0.36
454	0.35
455	0.31
456	0.31
457	0.26
458	0.24
459	0.19
460	0.15
461	0.16
462	0.11
463	0.14
464	0.14
465	0.16
466	0.16
467	0.19
468	0.2
469	0.16
470	0.15
471	0.12
472	0.11
473	0.1
474	0.09
475	0.09
476	0.1
477	0.11
478	0.15
479	0.17
480	0.18
481	0.19
482	0.21
483	0.2
484	0.2
485	0.23
486	0.23
487	0.22
488	0.22
489	0.27
490	0.26
491	0.27
492	0.27
493	0.24
494	0.2
495	0.19
496	0.25
497	0.21
498	0.21
499	0.21
500	0.2
501	0.2
502	0.24
503	0.25
504	0.27
505	0.28
506	0.29
507	0.28
508	0.29
509	0.3
510	0.29
511	0.33
512	0.27
513	0.29
514	0.35
515	0.37
516	0.36
517	0.35
518	0.33
519	0.37
520	0.42
521	0.44
522	0.43
523	0.45
524	0.45
525	0.5
526	0.52
527	0.5
528	0.52
529	0.55
530	0.55
531	0.57
532	0.62
533	0.64
534	0.7
535	0.67
536	0.6
537	0.53
538	0.49
539	0.43
540	0.36
541	0.37
542	0.27
543	0.25
544	0.24
545	0.26
546	0.28
547	0.36
548	0.42
549	0.42
550	0.51
551	0.6
552	0.7
553	0.75
554	0.78
555	0.8
556	0.82
557	0.83
558	0.82
559	0.75
560	0.69
561	0.65
562	0.57
563	0.47
564	0.41
565	0.33
566	0.25
567	0.26
568	0.24
569	0.23
570	0.29
571	0.36
572	0.39
573	0.42
574	0.44
575	0.44
576	0.48
577	0.45
578	0.41
579	0.36
580	0.35
581	0.3
582	0.29
583	0.25
584	0.19
585	0.16
586	0.12
587	0.1
588	0.06
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.07
593	0.14
594	0.18
595	0.21
596	0.26
597	0.32
598	0.39
599	0.46
600	0.52
601	0.53
602	0.58
603	0.63
604	0.67
605	0.7
606	0.69
607	0.66
608	0.6
609	0.53
610	0.45
611	0.38
612	0.31
613	0.25
614	0.22
615	0.19
616	0.2
617	0.21
618	0.23
619	0.23
620	0.21
621	0.19
622	0.16
623	0.15
624	0.13
625	0.1
626	0.1
627	0.08
628	0.09
629	0.1
630	0.09
631	0.09
632	0.1
633	0.1
634	0.12
635	0.14
636	0.15
637	0.17
638	0.21
639	0.21
640	0.21
641	0.22
642	0.2
643	0.2
644	0.26
645	0.31
646	0.36
647	0.46
648	0.53
649	0.62
650	0.69
651	0.77
652	0.79
653	0.8
654	0.79
655	0.79
656	0.81
657	0.8
658	0.74
659	0.7
660	0.61
661	0.56
662	0.54
663	0.45
664	0.41
665	0.36
666	0.39
667	0.36
668	0.41
669	0.45
670	0.48
671	0.55
672	0.6
673	0.65
674	0.69
675	0.76
676	0.79
677	0.82
678	0.86
679	0.89
680	0.89
681	0.89
682	0.9
683	0.9
684	0.84
685	0.79
686	0.73
687	0.64
688	0.58
689	0.49
690	0.4
691	0.31
692	0.26
693	0.21
694	0.16
695	0.18
696	0.18
697	0.25
698	0.27
699	0.28
700	0.29
701	0.32

C9STP8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer