Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SBA6

Protein Details
Accession C9SBA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-168TRGASVPKKRKAPKKKSSNKVKTGDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-162GRATRGASVPKKRKAPKKKSSNK
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 13.833, cyto 11.5, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014876  DEK_C  
IPR019835  SWIB_domain  
IPR036885  SWIB_MDM2_dom_sf  
IPR003121  SWIB_MDM2_domain  
KEGG val:VDBG_02497  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08766  DEK_C  
PF02201  SWIB  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51998  DEK_C  
PS51925  SWIB_MDM2  
CDD cd10567  SWIB-MDM2_like  
Amino Acid Sequences MASPLSAGDEVQYTAIIDTILATADLTTITRKKIRAGLERALGGKDLSDQKDAIKALIEQRFDHFTASEQAEEADTQVKTEASPHNSKSQYGYRDEAAGSDGEGEPASARKKQKREASSEDADAKLAAQLQAQENSMARGRATRGASVPKKRKAPKKKSSNKVKTGDDSDVDGSDGATPKRKPGGGFQKPFNLSYPLAELLKEPQLSRPQVVKKLWEHIKGNNLQDPANKRQIICDAPMEAVFKLPKVDMFQMNKLIGSHLYPVEEEH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.07
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.06
13 0.06
14 0.1
15 0.13
16 0.18
17 0.22
18 0.24
19 0.28
20 0.34
21 0.42
22 0.47
23 0.52
24 0.53
25 0.53
26 0.55
27 0.51
28 0.46
29 0.38
30 0.28
31 0.21
32 0.2
33 0.22
34 0.21
35 0.22
36 0.21
37 0.22
38 0.27
39 0.27
40 0.22
41 0.17
42 0.17
43 0.22
44 0.27
45 0.27
46 0.23
47 0.26
48 0.3
49 0.28
50 0.27
51 0.2
52 0.17
53 0.2
54 0.21
55 0.18
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.1
66 0.09
67 0.14
68 0.18
69 0.2
70 0.26
71 0.28
72 0.35
73 0.36
74 0.37
75 0.37
76 0.38
77 0.37
78 0.35
79 0.36
80 0.28
81 0.29
82 0.28
83 0.23
84 0.18
85 0.13
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.08
94 0.1
95 0.13
96 0.2
97 0.27
98 0.33
99 0.41
100 0.5
101 0.53
102 0.59
103 0.62
104 0.63
105 0.58
106 0.55
107 0.49
108 0.4
109 0.34
110 0.26
111 0.18
112 0.11
113 0.09
114 0.07
115 0.05
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.14
129 0.15
130 0.15
131 0.16
132 0.25
133 0.32
134 0.4
135 0.47
136 0.48
137 0.56
138 0.62
139 0.71
140 0.73
141 0.78
142 0.79
143 0.82
144 0.86
145 0.88
146 0.92
147 0.91
148 0.89
149 0.85
150 0.78
151 0.71
152 0.65
153 0.57
154 0.46
155 0.38
156 0.3
157 0.23
158 0.19
159 0.15
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.09
164 0.14
165 0.14
166 0.17
167 0.21
168 0.22
169 0.22
170 0.3
171 0.41
172 0.46
173 0.5
174 0.51
175 0.55
176 0.56
177 0.55
178 0.47
179 0.4
180 0.31
181 0.27
182 0.27
183 0.2
184 0.19
185 0.18
186 0.16
187 0.15
188 0.2
189 0.19
190 0.17
191 0.2
192 0.28
193 0.3
194 0.32
195 0.37
196 0.38
197 0.45
198 0.47
199 0.49
200 0.45
201 0.52
202 0.56
203 0.56
204 0.53
205 0.5
206 0.57
207 0.56
208 0.57
209 0.52
210 0.46
211 0.41
212 0.44
213 0.45
214 0.44
215 0.46
216 0.44
217 0.39
218 0.41
219 0.45
220 0.43
221 0.39
222 0.35
223 0.27
224 0.27
225 0.28
226 0.26
227 0.2
228 0.21
229 0.18
230 0.16
231 0.16
232 0.15
233 0.16
234 0.2
235 0.25
236 0.29
237 0.34
238 0.39
239 0.43
240 0.43
241 0.41
242 0.37
243 0.33
244 0.26
245 0.23
246 0.22
247 0.18
248 0.18