Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SZ43

Protein Details
Accession C9SZ43    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-42PEEIRKSRKRAATKFSKRRKTFLRRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-38RKSRKRAATKFSKRRKTF
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
KEGG val:VDBG_10168  -  
Amino Acid Sequences MSKRQQITPLPLKPYDPEEIRKSRKRAATKFSKRRKTFLRRAHDLSQDCQAKVYTFIEYNRRTWVFTSEPDQASFPPTKDEILRIYPLPEIFIPSMFSTLPQVHNDKHDVVDSALSDGFDTHVADQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.44
3 0.39
4 0.39
5 0.41
6 0.49
7 0.57
8 0.63
9 0.64
10 0.64
11 0.68
12 0.72
13 0.72
14 0.72
15 0.74
16 0.77
17 0.83
18 0.86
19 0.88
20 0.81
21 0.81
22 0.82
23 0.81
24 0.8
25 0.79
26 0.78
27 0.74
28 0.78
29 0.75
30 0.72
31 0.64
32 0.55
33 0.54
34 0.47
35 0.4
36 0.34
37 0.28
38 0.21
39 0.21
40 0.2
41 0.13
42 0.12
43 0.14
44 0.21
45 0.23
46 0.23
47 0.26
48 0.26
49 0.25
50 0.24
51 0.26
52 0.2
53 0.19
54 0.23
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.23
59 0.19
60 0.2
61 0.2
62 0.16
63 0.14
64 0.13
65 0.14
66 0.14
67 0.16
68 0.16
69 0.18
70 0.2
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.17
76 0.14
77 0.15
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.13
82 0.14
83 0.12
84 0.12
85 0.12
86 0.15
87 0.17
88 0.19
89 0.23
90 0.23
91 0.27
92 0.3
93 0.28
94 0.27
95 0.26
96 0.23
97 0.21
98 0.21
99 0.17
100 0.16
101 0.15
102 0.14
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.1