Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SDN9

Protein Details
Accession C9SDN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
432-488VADEVEKDKKKSKKEKKDKSDKKEKKRKRESEVGAAEPAPVEDGEKKKKKKKSKHDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
438-486KDKKKSKKEKKDKSDKKEKKRKRESEVGAAEPAPVEDGEKKKKKKKSKH
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13.333, cyto 11.5, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045056  Nop56/Nop58  
IPR012974  NOP58/56_N  
IPR042239  Nop_C  
IPR002687  Nop_dom  
IPR036070  Nop_dom_sf  
Gene Ontology GO:0031428  C:box C/D RNP complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
KEGG val:VDBG_03268  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01798  Nop  
PF08156  NOP5NT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51358  NOP  
Amino Acid Sequences MASVNYVLYEAPMGYGVFQVEHQADSIGLRSKETQEAINDLSRFGKMIKLLNFTPFHTGKEALSEINMISEGVMSDNLKSILELNLPKTSGKKSKVVLAVAEKNLASSIKSSFTGVDCETGETSEVAADFLRGVRLHADKLLKACRLVRPHRLVLVSATPTPVARLSSTPPRTTTTSSRPAPPSTSRNRASTQFFMRVREMVRLELSPMFFLDLLHDIAALVEEDGEKAQAIIDAAKVSMGLQITAQDLEIVKGFAQAVVQQAEARRSTSSYLEKKMGIVAPNLQCLIGTPVAARLISHAGSLTSLSKYPASTLQILGAEKALFRALKTKSNTPKYGLIYHSSFIGKAGVRNKGRISRYLANKCSIASRIDNFSEEPSVKFGQVLRQQVEDRLEFYASGKKPAKNADVMASVLDIVEGDDMQLDESMMAAPVADEVEKDKKKSKKEKKDKSDKKEKKRKRESEVGAAEPAPVEDGEKKKKKKKSKHDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.12
7 0.12
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.15
14 0.18
15 0.18
16 0.19
17 0.22
18 0.25
19 0.3
20 0.31
21 0.31
22 0.26
23 0.31
24 0.32
25 0.35
26 0.31
27 0.27
28 0.27
29 0.24
30 0.22
31 0.18
32 0.19
33 0.16
34 0.23
35 0.27
36 0.31
37 0.32
38 0.39
39 0.4
40 0.38
41 0.43
42 0.37
43 0.34
44 0.32
45 0.32
46 0.25
47 0.28
48 0.28
49 0.2
50 0.2
51 0.18
52 0.15
53 0.14
54 0.14
55 0.09
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.15
70 0.18
71 0.19
72 0.22
73 0.23
74 0.24
75 0.26
76 0.31
77 0.35
78 0.37
79 0.4
80 0.39
81 0.46
82 0.5
83 0.49
84 0.46
85 0.45
86 0.47
87 0.42
88 0.42
89 0.34
90 0.28
91 0.27
92 0.23
93 0.16
94 0.11
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.18
102 0.17
103 0.17
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.14
108 0.14
109 0.11
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.19
125 0.21
126 0.2
127 0.25
128 0.3
129 0.28
130 0.28
131 0.31
132 0.33
133 0.4
134 0.44
135 0.49
136 0.5
137 0.51
138 0.53
139 0.5
140 0.44
141 0.38
142 0.36
143 0.29
144 0.23
145 0.21
146 0.17
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.15
154 0.24
155 0.29
156 0.29
157 0.3
158 0.33
159 0.35
160 0.38
161 0.4
162 0.37
163 0.42
164 0.43
165 0.47
166 0.47
167 0.45
168 0.46
169 0.45
170 0.45
171 0.44
172 0.51
173 0.48
174 0.48
175 0.49
176 0.49
177 0.48
178 0.45
179 0.42
180 0.42
181 0.4
182 0.39
183 0.38
184 0.35
185 0.31
186 0.31
187 0.27
188 0.2
189 0.2
190 0.17
191 0.17
192 0.17
193 0.16
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.06
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.15
257 0.22
258 0.24
259 0.27
260 0.28
261 0.28
262 0.28
263 0.29
264 0.27
265 0.2
266 0.17
267 0.2
268 0.19
269 0.2
270 0.2
271 0.17
272 0.15
273 0.14
274 0.16
275 0.1
276 0.08
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.07
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.13
298 0.15
299 0.15
300 0.15
301 0.16
302 0.18
303 0.18
304 0.16
305 0.14
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.08
311 0.08
312 0.15
313 0.16
314 0.24
315 0.28
316 0.36
317 0.44
318 0.52
319 0.55
320 0.52
321 0.56
322 0.52
323 0.53
324 0.46
325 0.41
326 0.35
327 0.33
328 0.31
329 0.25
330 0.21
331 0.17
332 0.18
333 0.14
334 0.16
335 0.21
336 0.28
337 0.29
338 0.33
339 0.37
340 0.41
341 0.43
342 0.43
343 0.46
344 0.46
345 0.54
346 0.6
347 0.59
348 0.54
349 0.52
350 0.48
351 0.43
352 0.37
353 0.3
354 0.25
355 0.24
356 0.26
357 0.27
358 0.28
359 0.25
360 0.25
361 0.26
362 0.23
363 0.2
364 0.2
365 0.2
366 0.18
367 0.19
368 0.18
369 0.23
370 0.28
371 0.34
372 0.31
373 0.34
374 0.35
375 0.38
376 0.41
377 0.33
378 0.28
379 0.24
380 0.22
381 0.18
382 0.19
383 0.24
384 0.2
385 0.29
386 0.33
387 0.34
388 0.37
389 0.44
390 0.47
391 0.42
392 0.44
393 0.39
394 0.36
395 0.34
396 0.3
397 0.23
398 0.18
399 0.14
400 0.11
401 0.07
402 0.05
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.09
423 0.19
424 0.23
425 0.27
426 0.35
427 0.41
428 0.52
429 0.63
430 0.71
431 0.72
432 0.8
433 0.88
434 0.91
435 0.96
436 0.96
437 0.96
438 0.96
439 0.95
440 0.95
441 0.95
442 0.95
443 0.95
444 0.95
445 0.94
446 0.92
447 0.92
448 0.89
449 0.88
450 0.85
451 0.77
452 0.68
453 0.58
454 0.49
455 0.38
456 0.3
457 0.21
458 0.14
459 0.13
460 0.17
461 0.25
462 0.35
463 0.45
464 0.55
465 0.63
466 0.73
467 0.82
468 0.86