Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SJN3

Protein Details
Accession C9SJN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-29TAWRTSQRSRKLKLITRNLAHydrophilic
303-328KAYPPEEKAKKVKKVKDKGSRHPGTGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-334EKAKKVKKVKDKGSRHPGTGPAGAEK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 11, mito_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR023617  Tyr-tRNA-ligase_arc/euk-type  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004831  F:tyrosine-tRNA ligase activity  
GO:0006418  P:tRNA aminoacylation for protein translation  
KEGG val:VDBG_05756  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
Amino Acid Sequences MCPETRSLHTAWRTSQRSRKLKLITRNLAEALDVDILEKVYDEGREPNIYWGHRGQLVGLILADCSDPSNAKSSQLTHCRLRFVLGSEYQKSSDYVMDLFKLSSITSEHDARKAGAEVVKQTSNAPLVLDEQYLGADCQFGGVDQRKLFTAAKAWLPKLGYKERAHLMNPMVPGLQGGKMSSSEADSKIDLLDSPDVVTKKLRKAEAVPKIPENNGVLSFTEFVLLPASELKSGKAEFVVDRSRDNLEPLVYNDIAKMHEDYKNDILSPQILKPAVTKALLELMEPIVKDFESSKEWQEVMLKAYPPEEKAKKVKKVKDKGSRHPGTGPAGAEKAEGKNEKPVEEQTGISTLEIANHPPAP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.66
3 0.68
4 0.72
5 0.73
6 0.75
7 0.75
8 0.77
9 0.79
10 0.81
11 0.79
12 0.73
13 0.72
14 0.64
15 0.54
16 0.46
17 0.35
18 0.27
19 0.18
20 0.14
21 0.11
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.09
26 0.07
27 0.08
28 0.09
29 0.1
30 0.13
31 0.16
32 0.19
33 0.2
34 0.25
35 0.29
36 0.29
37 0.31
38 0.3
39 0.29
40 0.29
41 0.28
42 0.23
43 0.22
44 0.22
45 0.18
46 0.16
47 0.13
48 0.1
49 0.11
50 0.1
51 0.06
52 0.06
53 0.07
54 0.07
55 0.08
56 0.14
57 0.14
58 0.16
59 0.19
60 0.22
61 0.29
62 0.37
63 0.42
64 0.45
65 0.47
66 0.48
67 0.46
68 0.44
69 0.38
70 0.33
71 0.33
72 0.31
73 0.35
74 0.34
75 0.36
76 0.34
77 0.33
78 0.29
79 0.25
80 0.2
81 0.15
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.13
94 0.18
95 0.19
96 0.21
97 0.22
98 0.21
99 0.22
100 0.2
101 0.19
102 0.17
103 0.17
104 0.18
105 0.2
106 0.21
107 0.2
108 0.19
109 0.19
110 0.17
111 0.16
112 0.13
113 0.1
114 0.11
115 0.12
116 0.11
117 0.09
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.05
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.08
129 0.11
130 0.15
131 0.15
132 0.16
133 0.16
134 0.19
135 0.19
136 0.15
137 0.16
138 0.15
139 0.2
140 0.23
141 0.23
142 0.22
143 0.23
144 0.24
145 0.26
146 0.29
147 0.32
148 0.3
149 0.33
150 0.34
151 0.35
152 0.34
153 0.31
154 0.28
155 0.23
156 0.22
157 0.19
158 0.16
159 0.13
160 0.13
161 0.1
162 0.09
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.13
186 0.16
187 0.2
188 0.25
189 0.26
190 0.25
191 0.31
192 0.4
193 0.46
194 0.49
195 0.46
196 0.45
197 0.46
198 0.44
199 0.41
200 0.32
201 0.24
202 0.18
203 0.17
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.07
215 0.08
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.1
225 0.15
226 0.2
227 0.18
228 0.19
229 0.21
230 0.23
231 0.22
232 0.23
233 0.2
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.2
238 0.17
239 0.17
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.14
244 0.15
245 0.13
246 0.16
247 0.18
248 0.21
249 0.24
250 0.25
251 0.24
252 0.22
253 0.2
254 0.19
255 0.21
256 0.17
257 0.18
258 0.17
259 0.18
260 0.19
261 0.22
262 0.21
263 0.19
264 0.18
265 0.15
266 0.19
267 0.19
268 0.18
269 0.15
270 0.14
271 0.15
272 0.15
273 0.14
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.1
278 0.12
279 0.15
280 0.18
281 0.2
282 0.23
283 0.23
284 0.24
285 0.27
286 0.25
287 0.25
288 0.27
289 0.25
290 0.22
291 0.25
292 0.26
293 0.25
294 0.33
295 0.33
296 0.36
297 0.46
298 0.55
299 0.62
300 0.69
301 0.76
302 0.77
303 0.84
304 0.87
305 0.87
306 0.88
307 0.88
308 0.9
309 0.86
310 0.78
311 0.72
312 0.67
313 0.62
314 0.56
315 0.47
316 0.39
317 0.35
318 0.31
319 0.28
320 0.25
321 0.22
322 0.26
323 0.27
324 0.25
325 0.33
326 0.35
327 0.36
328 0.37
329 0.38
330 0.38
331 0.37
332 0.36
333 0.29
334 0.3
335 0.28
336 0.25
337 0.22
338 0.15
339 0.17
340 0.17
341 0.17