FuNGI

C9SMG3

Protein Details

Accession

C9SMG3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-23	ASVHRPKEQTPAKKRPDGFRVF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 8.5, cyto_nucl 8, cyto 6.5, mito 6, pero 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	val:VDBG_06087 -
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MASVHRPKEQTPAKKRPDGFRVFLSNLNRQYGLGIHASDSKLTARERRINANSDPQAERVGKIQERLRYLFFKERTVLQGILDQLHGCAAKPPNTQLHERGAFLGTLSLPQEPSTAQVGPNTETEFLQTTLYNLLSQAWKAHGPLERSFGTIHKAVTDAGGRPYKRNSGGAYPEAPNRECKRSRQREGDANALDDVPVRIRTVTSPFETSVDRVTASRAPLTLHQPQKSSHSFYNRSANTSNTTPTSSVFSQPQEVDHVLQGSQLTVEASSQERQRGDSLPNPQCSSRQYDAASDAARLLQDSLSKHEESLAQLDKPLSKHHREDHLVNQHGLFEEDGFQNSETTSLESLFGLKERLRKVWPRLPKFLNQAPLTVCWEVTRIALHCGVDLEHLTGLCYSDRWVDQHTLRAELYKHSSFQGKAFPETCPEAAWTAGNGNFEGPQSRAVCISIDLSWNTAPIGPLFSVSLQPLKLDLGHRLGRRFGSDRFLEMNFPSFTATGVPPQLTRLNGATDTIIKWLTTEKHFLAGRQWAAFFTRDVDKVTAGLAQGLTAWEGKATTKTRLKQCRVCCFAEGGHSFSPSNRIPAKADAKNVNGRTKMKLTDMLEWAIAIRANAAQPSLKLFSRLALSNRTYPTIVFEPGQIIHHAEDICSKSGKVMNDGVAEMSPKAAKVIAEYLGLADTPSAYQGRFGSAKGVWIVGTDPDNKDDFEIETYPSQRKWECDFWDEDHRTFEVKTEARPLRAANLNMQFIPVLVNGDVKRGTDKHRMRNAIAGCLRTTLKEELARQRSSMNDPVQFRQWIHENFFQGYRSDRVRDQNIRFLAGLPDNEAERVNMLLDAGFRPKKLSFLREVSYKMAFRKCELLKSKMNIKVGCSTYAKMVVDFKGVLEEGEIHLGFSTKFMDPDGQFSDTLLHGMDVLVARAPAHFPSDIQRVRAVFRPELRHLKDVIVFSIKGDSPLADLLSGGDYDGDQAWVCWDPAIVNSFQNVAYPVVPDLFALGYLEKRKGTFQDLVQNNSSNMDRAVAEFMYESFTFNMKEQFLGICTAYKERLCYGYNGIDNNDAVVLSHLVGNLVDQAKQGIVFGRDQWVRFCKGLLKNGLQNLPEPRYKAETGVNHNQRSLEDGKLDEEHVLDYLKFRVALPLVDQEMEAFNSMLGNEAVTFDKDLLGPFDDFERLMQTSMPLGNSGAIFPKPGASTTFKEYYRSSSSFVWNIAGRQLAWIKASSRTEGPAGPVAVTSSMYAILRPDSGLVKGIMAKKCSADGQSVVLDDVEYDEDGTQIDDT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.83
3	0.82
4	0.83
5	0.8
6	0.74
7	0.7
8	0.68
9	0.62
10	0.62
11	0.59
12	0.57
13	0.53
14	0.52
15	0.45
16	0.38
17	0.36
18	0.31
19	0.29
20	0.23
21	0.19
22	0.17
23	0.21
24	0.22
25	0.21
26	0.21
27	0.2
28	0.22
29	0.26
30	0.32
31	0.36
32	0.45
33	0.49
34	0.57
35	0.62
36	0.63
37	0.64
38	0.67
39	0.63
40	0.59
41	0.57
42	0.48
43	0.48
44	0.43
45	0.39
46	0.33
47	0.36
48	0.33
49	0.38
50	0.42
51	0.42
52	0.46
53	0.49
54	0.5
55	0.46
56	0.49
57	0.52
58	0.49
59	0.48
60	0.45
61	0.45
62	0.44
63	0.44
64	0.39
65	0.3
66	0.32
67	0.28
68	0.27
69	0.24
70	0.19
71	0.15
72	0.17
73	0.16
74	0.12
75	0.17
76	0.21
77	0.27
78	0.3
79	0.35
80	0.41
81	0.45
82	0.5
83	0.48
84	0.52
85	0.48
86	0.46
87	0.43
88	0.36
89	0.32
90	0.26
91	0.24
92	0.15
93	0.14
94	0.14
95	0.13
96	0.12
97	0.13
98	0.14
99	0.12
100	0.14
101	0.16
102	0.16
103	0.15
104	0.18
105	0.2
106	0.21
107	0.24
108	0.23
109	0.2
110	0.19
111	0.2
112	0.2
113	0.18
114	0.17
115	0.15
116	0.14
117	0.15
118	0.16
119	0.14
120	0.12
121	0.14
122	0.14
123	0.15
124	0.16
125	0.16
126	0.17
127	0.17
128	0.22
129	0.25
130	0.27
131	0.29
132	0.33
133	0.31
134	0.31
135	0.31
136	0.28
137	0.27
138	0.25
139	0.23
140	0.18
141	0.18
142	0.17
143	0.18
144	0.2
145	0.17
146	0.22
147	0.28
148	0.29
149	0.32
150	0.36
151	0.41
152	0.41
153	0.44
154	0.41
155	0.42
156	0.47
157	0.47
158	0.47
159	0.43
160	0.44
161	0.45
162	0.42
163	0.44
164	0.42
165	0.47
166	0.47
167	0.55
168	0.61
169	0.67
170	0.76
171	0.77
172	0.79
173	0.79
174	0.79
175	0.79
176	0.69
177	0.6
178	0.51
179	0.41
180	0.33
181	0.24
182	0.2
183	0.13
184	0.12
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.14
189	0.19
190	0.22
191	0.24
192	0.26
193	0.26
194	0.28
195	0.28
196	0.27
197	0.25
198	0.21
199	0.18
200	0.16
201	0.18
202	0.19
203	0.2
204	0.2
205	0.18
206	0.19
207	0.22
208	0.28
209	0.34
210	0.38
211	0.39
212	0.4
213	0.41
214	0.47
215	0.48
216	0.48
217	0.45
218	0.47
219	0.49
220	0.52
221	0.6
222	0.54
223	0.54
224	0.5
225	0.46
226	0.41
227	0.38
228	0.36
229	0.28
230	0.29
231	0.24
232	0.23
233	0.27
234	0.23
235	0.24
236	0.25
237	0.25
238	0.27
239	0.26
240	0.27
241	0.25
242	0.25
243	0.23
244	0.21
245	0.2
246	0.15
247	0.16
248	0.15
249	0.11
250	0.09
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.09
257	0.13
258	0.15
259	0.19
260	0.2
261	0.22
262	0.24
263	0.26
264	0.28
265	0.31
266	0.38
267	0.41
268	0.45
269	0.46
270	0.44
271	0.44
272	0.42
273	0.44
274	0.37
275	0.34
276	0.31
277	0.31
278	0.32
279	0.32
280	0.3
281	0.22
282	0.19
283	0.16
284	0.14
285	0.12
286	0.11
287	0.09
288	0.11
289	0.12
290	0.17
291	0.2
292	0.2
293	0.2
294	0.21
295	0.22
296	0.2
297	0.25
298	0.23
299	0.19
300	0.2
301	0.22
302	0.23
303	0.22
304	0.29
305	0.3
306	0.34
307	0.4
308	0.45
309	0.52
310	0.54
311	0.57
312	0.59
313	0.61
314	0.59
315	0.53
316	0.47
317	0.39
318	0.35
319	0.31
320	0.21
321	0.11
322	0.11
323	0.1
324	0.11
325	0.12
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.09
331	0.1
332	0.09
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.1
337	0.09
338	0.09
339	0.1
340	0.12
341	0.17
342	0.19
343	0.23
344	0.29
345	0.36
346	0.44
347	0.5
348	0.58
349	0.59
350	0.65
351	0.66
352	0.66
353	0.66
354	0.63
355	0.63
356	0.53
357	0.49
358	0.42
359	0.39
360	0.36
361	0.29
362	0.24
363	0.16
364	0.16
365	0.14
366	0.13
367	0.13
368	0.1
369	0.12
370	0.14
371	0.14
372	0.13
373	0.13
374	0.12
375	0.11
376	0.11
377	0.09
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.07
382	0.08
383	0.07
384	0.07
385	0.07
386	0.09
387	0.1
388	0.11
389	0.14
390	0.18
391	0.19
392	0.26
393	0.26
394	0.26
395	0.25
396	0.26
397	0.24
398	0.23
399	0.28
400	0.23
401	0.23
402	0.22
403	0.26
404	0.24
405	0.25
406	0.29
407	0.25
408	0.27
409	0.27
410	0.26
411	0.25
412	0.27
413	0.25
414	0.19
415	0.18
416	0.15
417	0.14
418	0.13
419	0.11
420	0.1
421	0.11
422	0.11
423	0.1
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.11
428	0.1
429	0.13
430	0.13
431	0.14
432	0.14
433	0.13
434	0.13
435	0.13
436	0.13
437	0.1
438	0.11
439	0.1
440	0.11
441	0.11
442	0.11
443	0.1
444	0.09
445	0.09
446	0.07
447	0.09
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.08
452	0.09
453	0.09
454	0.11
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.09
459	0.11
460	0.11
461	0.12
462	0.16
463	0.21
464	0.24
465	0.25
466	0.26
467	0.25
468	0.28
469	0.28
470	0.25
471	0.25
472	0.23
473	0.24
474	0.25
475	0.25
476	0.23
477	0.2
478	0.22
479	0.16
480	0.16
481	0.14
482	0.12
483	0.11
484	0.12
485	0.12
486	0.1
487	0.11
488	0.11
489	0.1
490	0.13
491	0.15
492	0.13
493	0.14
494	0.13
495	0.14
496	0.14
497	0.14
498	0.12
499	0.11
500	0.11
501	0.11
502	0.1
503	0.08
504	0.08
505	0.1
506	0.13
507	0.14
508	0.17
509	0.16
510	0.21
511	0.22
512	0.22
513	0.23
514	0.25
515	0.24
516	0.21
517	0.21
518	0.16
519	0.17
520	0.17
521	0.14
522	0.12
523	0.13
524	0.13
525	0.15
526	0.15
527	0.13
528	0.13
529	0.13
530	0.11
531	0.09
532	0.08
533	0.06
534	0.06
535	0.06
536	0.05
537	0.06
538	0.05
539	0.05
540	0.04
541	0.04
542	0.05
543	0.1
544	0.12
545	0.18
546	0.24
547	0.31
548	0.4
549	0.5
550	0.56
551	0.58
552	0.64
553	0.67
554	0.67
555	0.62
556	0.54
557	0.46
558	0.4
559	0.38
560	0.31
561	0.25
562	0.21
563	0.2
564	0.19
565	0.17
566	0.22
567	0.16
568	0.2
569	0.17
570	0.18
571	0.19
572	0.25
573	0.33
574	0.3
575	0.34
576	0.33
577	0.35
578	0.4
579	0.42
580	0.4
581	0.37
582	0.36
583	0.34
584	0.34
585	0.32
586	0.27
587	0.29
588	0.27
589	0.27
590	0.27
591	0.24
592	0.21
593	0.19
594	0.18
595	0.13
596	0.11
597	0.06
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.06
603	0.05
604	0.05
605	0.08
606	0.1
607	0.09
608	0.11
609	0.11
610	0.12
611	0.14
612	0.16
613	0.15
614	0.18
615	0.2
616	0.23
617	0.24
618	0.24
619	0.22
620	0.19
621	0.21
622	0.18
623	0.17
624	0.13
625	0.12
626	0.12
627	0.12
628	0.13
629	0.1
630	0.09
631	0.08
632	0.1
633	0.09
634	0.08
635	0.11
636	0.11
637	0.12
638	0.12
639	0.11
640	0.11
641	0.14
642	0.15
643	0.14
644	0.14
645	0.15
646	0.15
647	0.16
648	0.14
649	0.11
650	0.11
651	0.08
652	0.07
653	0.05
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.06
659	0.07
660	0.08
661	0.08
662	0.08
663	0.08
664	0.07
665	0.07
666	0.06
667	0.04
668	0.03
669	0.03
670	0.04
671	0.05
672	0.04
673	0.06
674	0.06
675	0.09
676	0.1
677	0.1
678	0.12
679	0.11
680	0.13
681	0.12
682	0.12
683	0.09
684	0.08
685	0.09
686	0.07
687	0.09
688	0.1
689	0.1
690	0.12
691	0.12
692	0.12
693	0.12
694	0.12
695	0.1
696	0.1
697	0.11
698	0.1
699	0.11
700	0.14
701	0.15
702	0.15
703	0.17
704	0.17
705	0.19
706	0.23
707	0.28
708	0.29
709	0.3
710	0.33
711	0.33
712	0.42
713	0.41
714	0.36
715	0.31
716	0.28
717	0.26
718	0.23
719	0.21
720	0.18
721	0.16
722	0.17
723	0.24
724	0.25
725	0.26
726	0.27
727	0.26
728	0.24
729	0.28
730	0.28
731	0.25
732	0.27
733	0.27
734	0.26
735	0.26
736	0.2
737	0.16
738	0.16
739	0.1
740	0.07
741	0.06
742	0.09
743	0.09
744	0.11
745	0.11
746	0.1
747	0.13
748	0.14
749	0.2
750	0.27
751	0.34
752	0.42
753	0.5
754	0.53
755	0.51
756	0.56
757	0.51
758	0.49
759	0.44
760	0.36
761	0.28
762	0.27
763	0.26
764	0.2
765	0.22
766	0.15
767	0.16
768	0.19
769	0.23
770	0.3
771	0.36
772	0.36
773	0.33
774	0.34
775	0.33
776	0.34
777	0.37
778	0.31
779	0.3
780	0.32
781	0.34
782	0.36
783	0.35
784	0.3
785	0.26
786	0.29
787	0.27
788	0.3
789	0.32
790	0.3
791	0.3
792	0.31
793	0.29
794	0.23
795	0.22
796	0.21
797	0.19
798	0.2
799	0.22
800	0.27
801	0.34
802	0.42
803	0.42
804	0.46
805	0.45
806	0.44
807	0.4
808	0.35
809	0.3
810	0.23
811	0.2
812	0.14
813	0.14
814	0.13
815	0.13
816	0.13
817	0.1
818	0.08
819	0.08
820	0.07
821	0.06
822	0.05
823	0.05
824	0.06
825	0.07
826	0.12
827	0.13
828	0.13
829	0.15
830	0.16
831	0.22
832	0.25
833	0.28
834	0.29
835	0.33
836	0.36
837	0.37
838	0.39
839	0.36
840	0.36
841	0.34
842	0.32
843	0.33
844	0.3
845	0.28
846	0.34
847	0.33
848	0.38
849	0.41
850	0.42
851	0.44
852	0.47
853	0.54
854	0.5
855	0.54
856	0.46
857	0.44
858	0.45
859	0.4
860	0.4
861	0.34
862	0.29
863	0.26
864	0.29
865	0.26
866	0.2
867	0.21
868	0.17
869	0.17
870	0.16
871	0.14
872	0.12
873	0.12
874	0.1
875	0.08
876	0.08
877	0.07
878	0.09
879	0.09
880	0.07
881	0.08
882	0.08
883	0.08
884	0.08
885	0.1
886	0.08
887	0.08
888	0.09
889	0.14
890	0.14
891	0.18
892	0.21
893	0.2
894	0.2
895	0.2
896	0.21
897	0.15
898	0.15
899	0.11
900	0.08
901	0.06
902	0.06
903	0.07
904	0.06
905	0.06
906	0.06
907	0.06
908	0.06
909	0.06
910	0.07
911	0.06
912	0.09
913	0.09
914	0.09
915	0.14
916	0.24
917	0.25
918	0.26
919	0.28
920	0.27
921	0.29
922	0.35
923	0.34
924	0.3
925	0.34
926	0.39
927	0.43
928	0.51
929	0.53
930	0.51
931	0.47
932	0.45
933	0.43
934	0.37
935	0.33
936	0.27
937	0.23
938	0.2
939	0.22
940	0.19
941	0.16
942	0.16
943	0.13
944	0.11
945	0.12
946	0.12
947	0.08
948	0.08
949	0.07
950	0.07
951	0.07
952	0.06
953	0.05
954	0.04
955	0.06
956	0.06
957	0.06
958	0.05
959	0.05
960	0.07
961	0.08
962	0.08
963	0.07
964	0.07
965	0.07
966	0.09
967	0.12
968	0.11
969	0.11
970	0.11
971	0.13
972	0.12
973	0.13
974	0.12
975	0.11
976	0.1
977	0.1
978	0.1
979	0.1
980	0.1
981	0.09
982	0.08
983	0.07
984	0.07
985	0.07
986	0.07
987	0.1
988	0.13
989	0.15
990	0.15
991	0.16
992	0.19
993	0.21
994	0.26
995	0.27
996	0.28
997	0.36
998	0.39
999	0.42
1000	0.43
1001	0.41
1002	0.36
1003	0.33
1004	0.3
1005	0.21
1006	0.17
1007	0.14
1008	0.12
1009	0.12
1010	0.14
1011	0.11
1012	0.11
1013	0.1
1014	0.1
1015	0.13
1016	0.13
1017	0.13
1018	0.11
1019	0.13
1020	0.14
1021	0.15
1022	0.18
1023	0.15
1024	0.15
1025	0.15
1026	0.14
1027	0.14
1028	0.15
1029	0.15
1030	0.13
1031	0.14
1032	0.16
1033	0.19
1034	0.19
1035	0.2
1036	0.19
1037	0.24
1038	0.23
1039	0.24
1040	0.26
1041	0.29
1042	0.31
1043	0.31
1044	0.3
1045	0.28
1046	0.26
1047	0.24
1048	0.19
1049	0.12
1050	0.1
1051	0.09
1052	0.08
1053	0.07
1054	0.08
1055	0.07
1056	0.07
1057	0.07
1058	0.07
1059	0.11
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.1
1063	0.11
1064	0.11
1065	0.11
1066	0.12
1067	0.1
1068	0.12
1069	0.12
1070	0.14
1071	0.21
1072	0.23
1073	0.24
1074	0.29
1075	0.31
1076	0.33
1077	0.32
1078	0.32
1079	0.33
1080	0.37
1081	0.44
1082	0.45
1083	0.46
1084	0.48
1085	0.53
1086	0.56
1087	0.48
1088	0.46
1089	0.45
1090	0.43
1091	0.4
1092	0.37
1093	0.35
1094	0.36
1095	0.36
1096	0.35
1097	0.36
1098	0.38
1099	0.43
1100	0.52
1101	0.57
1102	0.53
1103	0.53
1104	0.51
1105	0.44
1106	0.43
1107	0.37
1108	0.29
1109	0.23
1110	0.22
1111	0.23
1112	0.24
1113	0.24
1114	0.19
1115	0.17
1116	0.15
1117	0.13
1118	0.13
1119	0.11
1120	0.11
1121	0.12
1122	0.13
1123	0.13
1124	0.13
1125	0.17
1126	0.17
1127	0.18
1128	0.19
1129	0.23
1130	0.23
1131	0.22
1132	0.22
1133	0.18
1134	0.18
1135	0.18
1136	0.16
1137	0.1
1138	0.09
1139	0.09
1140	0.09
1141	0.09
1142	0.08
1143	0.07
1144	0.07
1145	0.08
1146	0.1
1147	0.1
1148	0.11
1149	0.1
1150	0.11
1151	0.11
1152	0.12
1153	0.13
1154	0.14
1155	0.13
1156	0.13
1157	0.15
1158	0.15
1159	0.14
1160	0.14
1161	0.16
1162	0.14
1163	0.14
1164	0.14
1165	0.13
1166	0.15
1167	0.17
1168	0.17
1169	0.14
1170	0.13
1171	0.14
1172	0.14
1173	0.14
1174	0.14
1175	0.13
1176	0.13
1177	0.13
1178	0.16
1179	0.15
1180	0.16
1181	0.2
1182	0.22
1183	0.26
1184	0.31
1185	0.38
1186	0.36
1187	0.39
1188	0.39
1189	0.42
1190	0.44
1191	0.42
1192	0.39
1193	0.37
1194	0.42
1195	0.41
1196	0.41
1197	0.38
1198	0.32
1199	0.31
1200	0.3
1201	0.27
1202	0.21
1203	0.23
1204	0.25
1205	0.22
1206	0.22
1207	0.24
1208	0.23
1209	0.29
1210	0.31
1211	0.3
1212	0.29
1213	0.3
1214	0.31
1215	0.3
1216	0.32
1217	0.3
1218	0.28
1219	0.24
1220	0.22
1221	0.2
1222	0.18
1223	0.18
1224	0.14
1225	0.1
1226	0.11
1227	0.11
1228	0.11
1229	0.11
1230	0.12
1231	0.12
1232	0.12
1233	0.14
1234	0.13
1235	0.15
1236	0.17
1237	0.15
1238	0.16
1239	0.21
1240	0.28
1241	0.3
1242	0.31
1243	0.32
1244	0.31
1245	0.33
1246	0.35
1247	0.32
1248	0.29
1249	0.26
1250	0.27
1251	0.27
1252	0.26
1253	0.24
1254	0.2
1255	0.18
1256	0.13
1257	0.13
1258	0.11
1259	0.09
1260	0.09
1261	0.09
1262	0.09
1263	0.09

C9SMG3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer