Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SVK3

Protein Details
Accession C9SVK3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
97-124GSRLNRSKSKAWARRTRRRSERVCLCRLHydrophilic
376-404LDAKQQKRYLEKEREKETRKAAKKQTMRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
102-115RSKSKAWARRTRRR
382-402KRYLEKEREKETRKAAKKQTM
Subcellular Location(s) cyto 13, cyto_nucl 10, nucl 5, mito 4, pero 2, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG val:VDBG_08928  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MANVLNSFFGGGKAADKAVPAADSDFADFAEAPNPVPTDTVVPVGATAVDGTAAAEATSVQFTRWYRVDQRHSLAEFRLEGIVISIGLVIFIVHLIGSRLNRSKSKAWARRTRRRSERVCLCRLSGQSTVESDPQPSRACSRRSRSWSALFNFFWDSVGAPRDIMDAVIYPFDGKETLTVPQVPGTHELRSKDSKSSYDGFVWAIVAKGRMKQLREERYDLSITFTKDHSKLPNWATVMTESAEITEQLLTPEIIQAVELAGDAFDYLIVSDQPIDKPRTLEEATTGRKRIFLRYTIPSNNDFSTVTPLFTQFLQLPDSLVAKAKFRPEILRKVNRVREEAVAQLKKEADAVVAEERNAERERVKKVKRDQELAGLDAKQQKRYLEKEREKETRKAAKKQTMRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.13
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.13
8 0.13
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.13
13 0.12
14 0.13
15 0.12
16 0.11
17 0.13
18 0.12
19 0.12
20 0.14
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.15
25 0.15
26 0.16
27 0.17
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.12
33 0.08
34 0.07
35 0.05
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.05
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.12
49 0.14
50 0.19
51 0.22
52 0.26
53 0.33
54 0.42
55 0.51
56 0.53
57 0.56
58 0.58
59 0.58
60 0.55
61 0.48
62 0.42
63 0.34
64 0.28
65 0.24
66 0.16
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.02
81 0.03
82 0.04
83 0.07
84 0.08
85 0.13
86 0.19
87 0.23
88 0.27
89 0.32
90 0.36
91 0.43
92 0.53
93 0.57
94 0.62
95 0.69
96 0.76
97 0.81
98 0.86
99 0.86
100 0.86
101 0.87
102 0.85
103 0.84
104 0.85
105 0.82
106 0.8
107 0.71
108 0.63
109 0.58
110 0.52
111 0.46
112 0.38
113 0.31
114 0.26
115 0.26
116 0.26
117 0.23
118 0.22
119 0.2
120 0.18
121 0.2
122 0.2
123 0.19
124 0.23
125 0.27
126 0.32
127 0.38
128 0.45
129 0.51
130 0.57
131 0.63
132 0.64
133 0.64
134 0.66
135 0.61
136 0.59
137 0.5
138 0.44
139 0.38
140 0.32
141 0.26
142 0.18
143 0.15
144 0.11
145 0.12
146 0.1
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.06
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.07
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.16
172 0.16
173 0.18
174 0.2
175 0.21
176 0.23
177 0.26
178 0.27
179 0.27
180 0.27
181 0.26
182 0.27
183 0.28
184 0.26
185 0.22
186 0.21
187 0.17
188 0.15
189 0.14
190 0.1
191 0.08
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.09
196 0.14
197 0.17
198 0.17
199 0.24
200 0.33
201 0.39
202 0.43
203 0.44
204 0.41
205 0.41
206 0.42
207 0.35
208 0.3
209 0.25
210 0.21
211 0.19
212 0.18
213 0.19
214 0.2
215 0.23
216 0.23
217 0.22
218 0.28
219 0.28
220 0.32
221 0.29
222 0.28
223 0.26
224 0.22
225 0.21
226 0.15
227 0.14
228 0.09
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.02
253 0.02
254 0.02
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.09
261 0.13
262 0.16
263 0.17
264 0.18
265 0.2
266 0.25
267 0.25
268 0.23
269 0.23
270 0.27
271 0.32
272 0.36
273 0.37
274 0.31
275 0.35
276 0.36
277 0.39
278 0.36
279 0.35
280 0.36
281 0.41
282 0.48
283 0.48
284 0.5
285 0.45
286 0.43
287 0.39
288 0.35
289 0.29
290 0.23
291 0.25
292 0.22
293 0.2
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.17
298 0.18
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.17
308 0.16
309 0.17
310 0.2
311 0.24
312 0.26
313 0.27
314 0.36
315 0.39
316 0.48
317 0.56
318 0.62
319 0.65
320 0.72
321 0.78
322 0.73
323 0.7
324 0.62
325 0.57
326 0.49
327 0.48
328 0.48
329 0.44
330 0.39
331 0.38
332 0.36
333 0.31
334 0.3
335 0.24
336 0.15
337 0.12
338 0.14
339 0.17
340 0.17
341 0.17
342 0.19
343 0.19
344 0.22
345 0.23
346 0.22
347 0.22
348 0.27
349 0.36
350 0.44
351 0.51
352 0.56
353 0.65
354 0.73
355 0.76
356 0.77
357 0.71
358 0.7
359 0.66
360 0.59
361 0.53
362 0.44
363 0.4
364 0.43
365 0.42
366 0.37
367 0.37
368 0.4
369 0.44
370 0.51
371 0.57
372 0.59
373 0.67
374 0.71
375 0.77
376 0.83
377 0.81
378 0.81
379 0.81
380 0.8
381 0.79
382 0.8
383 0.81
384 0.81