Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S8P0

Protein Details
Accession C9S8P0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MVSARKRRLFRKRKKPGAVVKIMTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-18RKRRLFRKRKKPGA
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 7, cyto 1, plas 1, extr 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038635  CCR4-NOT_su2/3/5_C_sf  
IPR040168  Not2/3/5  
IPR007282  NOT2/3/5_C  
Gene Ontology GO:0030015  C:CCR4-NOT core complex  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG val:VDBG_01041  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04153  NOT2_3_5  
Amino Acid Sequences MVSARKRRLFRKRKKPGAVVKIMTAPSPTPSSARPRKGYAEALKGDRPVESSKGEFPSLSNNPQLGNANQSSMWATAGSRAVSGQVPRNTSTPLSSQGPQEDLYNSTSSSRGNGGFRFGAQGTVGQPAQNSATPADDFPPLNRNANGEIGGERGGRSHVVSGFRGSSPRCRTFHTKQPGCATDSARQRITARPRETEDGEASDAQDPLAGMAPIDKFGIKGLRTMMNNNPSYAALMHGMDPNDLGLNVNSPELISTQQYSLFDDTPPRPVVPSHRLPECYQVTNVQPIETKIQSFNEETLFWIFYSCPQDVKQQLAAFELHSRNWRWHKKLHIWLTKDETMTPQTISPTHEQGYYVIWDIRNWRKERRELTLHYEDLETSLGRPPAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.94
2 0.94
3 0.93
4 0.93
5 0.91
6 0.83
7 0.75
8 0.7
9 0.61
10 0.51
11 0.43
12 0.33
13 0.26
14 0.27
15 0.24
16 0.2
17 0.25
18 0.35
19 0.42
20 0.5
21 0.52
22 0.54
23 0.58
24 0.61
25 0.66
26 0.63
27 0.62
28 0.59
29 0.58
30 0.56
31 0.52
32 0.47
33 0.38
34 0.34
35 0.28
36 0.27
37 0.25
38 0.25
39 0.29
40 0.31
41 0.31
42 0.28
43 0.26
44 0.31
45 0.33
46 0.34
47 0.32
48 0.29
49 0.29
50 0.31
51 0.34
52 0.26
53 0.27
54 0.24
55 0.22
56 0.21
57 0.21
58 0.2
59 0.17
60 0.16
61 0.1
62 0.1
63 0.12
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.15
70 0.18
71 0.22
72 0.24
73 0.27
74 0.28
75 0.3
76 0.3
77 0.29
78 0.28
79 0.23
80 0.24
81 0.25
82 0.25
83 0.26
84 0.26
85 0.26
86 0.24
87 0.23
88 0.2
89 0.18
90 0.19
91 0.17
92 0.15
93 0.14
94 0.15
95 0.13
96 0.14
97 0.14
98 0.15
99 0.17
100 0.17
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.2
105 0.18
106 0.16
107 0.13
108 0.14
109 0.11
110 0.14
111 0.14
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.09
119 0.11
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.18
127 0.18
128 0.21
129 0.21
130 0.21
131 0.2
132 0.21
133 0.21
134 0.15
135 0.14
136 0.12
137 0.13
138 0.11
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.11
146 0.13
147 0.14
148 0.15
149 0.16
150 0.16
151 0.18
152 0.17
153 0.23
154 0.28
155 0.34
156 0.34
157 0.37
158 0.45
159 0.48
160 0.56
161 0.59
162 0.55
163 0.53
164 0.58
165 0.55
166 0.49
167 0.47
168 0.4
169 0.36
170 0.39
171 0.38
172 0.33
173 0.32
174 0.31
175 0.34
176 0.4
177 0.42
178 0.39
179 0.38
180 0.41
181 0.43
182 0.43
183 0.39
184 0.31
185 0.23
186 0.21
187 0.18
188 0.16
189 0.14
190 0.12
191 0.09
192 0.09
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.04
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.11
206 0.09
207 0.11
208 0.13
209 0.17
210 0.18
211 0.21
212 0.26
213 0.3
214 0.3
215 0.29
216 0.28
217 0.23
218 0.23
219 0.2
220 0.15
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.07
231 0.07
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.15
248 0.15
249 0.14
250 0.19
251 0.19
252 0.22
253 0.23
254 0.21
255 0.2
256 0.21
257 0.28
258 0.3
259 0.37
260 0.36
261 0.39
262 0.42
263 0.43
264 0.49
265 0.46
266 0.4
267 0.34
268 0.33
269 0.3
270 0.34
271 0.33
272 0.26
273 0.23
274 0.22
275 0.26
276 0.24
277 0.23
278 0.19
279 0.21
280 0.23
281 0.23
282 0.23
283 0.2
284 0.19
285 0.19
286 0.18
287 0.17
288 0.14
289 0.13
290 0.12
291 0.15
292 0.19
293 0.18
294 0.18
295 0.19
296 0.26
297 0.28
298 0.32
299 0.33
300 0.3
301 0.3
302 0.3
303 0.29
304 0.23
305 0.28
306 0.25
307 0.22
308 0.26
309 0.27
310 0.34
311 0.44
312 0.52
313 0.51
314 0.56
315 0.64
316 0.68
317 0.77
318 0.79
319 0.78
320 0.72
321 0.73
322 0.74
323 0.69
324 0.59
325 0.5
326 0.44
327 0.38
328 0.35
329 0.29
330 0.23
331 0.21
332 0.22
333 0.26
334 0.26
335 0.27
336 0.27
337 0.27
338 0.26
339 0.24
340 0.25
341 0.23
342 0.22
343 0.2
344 0.19
345 0.2
346 0.28
347 0.36
348 0.42
349 0.45
350 0.52
351 0.57
352 0.66
353 0.71
354 0.72
355 0.72
356 0.69
357 0.74
358 0.73
359 0.65
360 0.58
361 0.52
362 0.42
363 0.34
364 0.3
365 0.21
366 0.14
367 0.18