Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9STD7

Protein Details
Accession C9STD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-273KNKSTTGPPPAARRRRRRRQRASCSLPSEEQHydrophilic
283-305RAWPPIPSWWRPKCRVHQPRSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-263GEKEKNKSTTGPPPAARRRRRRRQR
Subcellular Location(s) pero 11, nucl 9.5, cyto_nucl 6.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007590  Saf4/Yju2  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG val:VDBG_08162  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04502  Saf4_Yju2  
Amino Acid Sequences MQGFNMGRYVPPDLEGTVSGNALHAKLPPGRSAAKPGVQTVRFEMPFAICAAPAPTTQPRSGPSACATLPARHPSRWPPTPGTRPYVVVAGAAKRDTGPAARDGDLVVMTDEERGPPCAPAPLRASRRRSRTARPVAAATDRIDDLEDVARRQWQDPYARNRALRRTFRVGRRERERQAGVDDGVRARIGFDLDLLPATEADATRAALVEFGHHNDDDAGQRAAGHWRSLLVVKARGDGEKEKNKSTTGPPPAARRRRRRRQRASCSLPSEEQASCQSLSATRAWPPIPSWWRPKCRVHQPRSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.19
4 0.16
5 0.15
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.11
12 0.15
13 0.19
14 0.22
15 0.23
16 0.26
17 0.3
18 0.31
19 0.37
20 0.39
21 0.4
22 0.39
23 0.42
24 0.46
25 0.44
26 0.44
27 0.41
28 0.42
29 0.37
30 0.36
31 0.32
32 0.24
33 0.24
34 0.24
35 0.19
36 0.11
37 0.11
38 0.12
39 0.12
40 0.11
41 0.15
42 0.19
43 0.22
44 0.24
45 0.26
46 0.26
47 0.31
48 0.32
49 0.3
50 0.27
51 0.28
52 0.26
53 0.29
54 0.3
55 0.27
56 0.31
57 0.36
58 0.37
59 0.34
60 0.38
61 0.41
62 0.48
63 0.5
64 0.51
65 0.5
66 0.55
67 0.63
68 0.64
69 0.61
70 0.53
71 0.49
72 0.45
73 0.39
74 0.3
75 0.22
76 0.19
77 0.16
78 0.15
79 0.13
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.13
87 0.16
88 0.17
89 0.17
90 0.16
91 0.16
92 0.14
93 0.12
94 0.09
95 0.06
96 0.05
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.14
106 0.14
107 0.18
108 0.22
109 0.28
110 0.35
111 0.42
112 0.49
113 0.52
114 0.58
115 0.63
116 0.64
117 0.64
118 0.67
119 0.69
120 0.66
121 0.61
122 0.56
123 0.49
124 0.45
125 0.39
126 0.29
127 0.21
128 0.16
129 0.14
130 0.12
131 0.1
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.13
140 0.14
141 0.15
142 0.21
143 0.27
144 0.35
145 0.4
146 0.43
147 0.46
148 0.47
149 0.52
150 0.54
151 0.53
152 0.51
153 0.52
154 0.56
155 0.6
156 0.67
157 0.65
158 0.66
159 0.68
160 0.71
161 0.65
162 0.66
163 0.6
164 0.51
165 0.47
166 0.4
167 0.32
168 0.25
169 0.23
170 0.16
171 0.14
172 0.13
173 0.1
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.12
200 0.11
201 0.12
202 0.11
203 0.13
204 0.12
205 0.14
206 0.12
207 0.1
208 0.1
209 0.11
210 0.17
211 0.17
212 0.16
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.17
217 0.19
218 0.17
219 0.21
220 0.21
221 0.24
222 0.25
223 0.24
224 0.27
225 0.3
226 0.35
227 0.4
228 0.43
229 0.44
230 0.44
231 0.45
232 0.45
233 0.45
234 0.45
235 0.44
236 0.47
237 0.48
238 0.56
239 0.65
240 0.72
241 0.76
242 0.77
243 0.81
244 0.85
245 0.92
246 0.93
247 0.94
248 0.95
249 0.96
250 0.96
251 0.94
252 0.92
253 0.87
254 0.81
255 0.71
256 0.62
257 0.54
258 0.43
259 0.36
260 0.3
261 0.26
262 0.21
263 0.19
264 0.19
265 0.17
266 0.2
267 0.2
268 0.2
269 0.21
270 0.25
271 0.26
272 0.27
273 0.27
274 0.34
275 0.38
276 0.44
277 0.5
278 0.56
279 0.65
280 0.7
281 0.78
282 0.78
283 0.82
284 0.86
285 0.85