Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SKB4

Protein Details
Accession C9SKB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-71TPEEKRKQAEKAQREKEKRAAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-14KPAKAK
51-71PEEKRKQAEKAQREKEKRAAE
263-273KKERLDKKAAE
276-278AKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 8.666, cyto_mito 7.999, mito_nucl 7.999, nucl 7.5, cyto 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG val:VDBG_05241  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKKNIEKPAKAKGAQAVADKTFGMKNKKGGAAQKQIAQLSAMAKSGGTPEEKRKQAEKAQREKEKRAAEEAKRELADLVNKPAQIQKVPFGVDPKTVVCIFFKKGNCEKGKKCKFSHNVEDERKVNKKSLYTDTRAEEDEQKKVETSAEWDEEKLRSVVLSKKGNQKTTTDKVCKFFVEAIEEGKYGWFWVCPNGGDKCMYKHALPPGFVLKTKEQRAAEKALMDKSPLKTLTLEEFLESERHKLTGTLTPVTPESFAKWKKERLDKKAAEEQAKKAKEATGRAMFESGTWKDDDESGDEDDDDNDAWNMEKLRAETEAARERKEAERVAALHGTAVGAMLESTAPVVEASGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.63
3 0.57
4 0.54
5 0.49
6 0.41
7 0.4
8 0.36
9 0.31
10 0.29
11 0.31
12 0.33
13 0.32
14 0.38
15 0.43
16 0.48
17 0.52
18 0.56
19 0.59
20 0.61
21 0.61
22 0.6
23 0.58
24 0.54
25 0.49
26 0.41
27 0.33
28 0.25
29 0.23
30 0.18
31 0.13
32 0.12
33 0.12
34 0.14
35 0.14
36 0.16
37 0.19
38 0.28
39 0.37
40 0.42
41 0.46
42 0.48
43 0.53
44 0.58
45 0.64
46 0.66
47 0.67
48 0.73
49 0.79
50 0.82
51 0.81
52 0.8
53 0.78
54 0.7
55 0.68
56 0.68
57 0.63
58 0.66
59 0.63
60 0.6
61 0.52
62 0.49
63 0.41
64 0.34
65 0.34
66 0.27
67 0.29
68 0.27
69 0.27
70 0.27
71 0.3
72 0.29
73 0.27
74 0.26
75 0.24
76 0.24
77 0.26
78 0.27
79 0.26
80 0.25
81 0.24
82 0.23
83 0.2
84 0.2
85 0.18
86 0.18
87 0.17
88 0.18
89 0.19
90 0.24
91 0.26
92 0.3
93 0.36
94 0.45
95 0.5
96 0.55
97 0.61
98 0.66
99 0.74
100 0.74
101 0.71
102 0.72
103 0.73
104 0.73
105 0.75
106 0.73
107 0.72
108 0.69
109 0.72
110 0.65
111 0.63
112 0.6
113 0.51
114 0.46
115 0.39
116 0.38
117 0.38
118 0.43
119 0.44
120 0.42
121 0.45
122 0.43
123 0.42
124 0.39
125 0.36
126 0.35
127 0.31
128 0.31
129 0.27
130 0.26
131 0.24
132 0.23
133 0.21
134 0.13
135 0.15
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.18
141 0.17
142 0.18
143 0.14
144 0.1
145 0.08
146 0.1
147 0.15
148 0.2
149 0.25
150 0.28
151 0.38
152 0.43
153 0.47
154 0.46
155 0.44
156 0.45
157 0.47
158 0.51
159 0.48
160 0.47
161 0.45
162 0.45
163 0.42
164 0.35
165 0.3
166 0.22
167 0.19
168 0.16
169 0.15
170 0.15
171 0.14
172 0.13
173 0.11
174 0.1
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.19
189 0.21
190 0.18
191 0.21
192 0.27
193 0.28
194 0.28
195 0.27
196 0.28
197 0.28
198 0.28
199 0.28
200 0.27
201 0.31
202 0.33
203 0.38
204 0.35
205 0.37
206 0.4
207 0.41
208 0.36
209 0.32
210 0.31
211 0.28
212 0.26
213 0.25
214 0.25
215 0.22
216 0.25
217 0.23
218 0.21
219 0.19
220 0.21
221 0.23
222 0.21
223 0.2
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.17
228 0.16
229 0.14
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.17
236 0.2
237 0.21
238 0.2
239 0.21
240 0.22
241 0.22
242 0.21
243 0.15
244 0.15
245 0.21
246 0.25
247 0.31
248 0.36
249 0.42
250 0.49
251 0.59
252 0.66
253 0.66
254 0.74
255 0.7
256 0.72
257 0.74
258 0.72
259 0.7
260 0.65
261 0.64
262 0.62
263 0.59
264 0.52
265 0.45
266 0.43
267 0.39
268 0.39
269 0.41
270 0.39
271 0.39
272 0.39
273 0.38
274 0.34
275 0.29
276 0.31
277 0.24
278 0.18
279 0.17
280 0.16
281 0.17
282 0.19
283 0.19
284 0.16
285 0.17
286 0.17
287 0.17
288 0.17
289 0.16
290 0.15
291 0.14
292 0.11
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.14
301 0.14
302 0.16
303 0.18
304 0.2
305 0.2
306 0.27
307 0.35
308 0.35
309 0.37
310 0.36
311 0.38
312 0.41
313 0.44
314 0.39
315 0.33
316 0.37
317 0.36
318 0.39
319 0.38
320 0.32
321 0.26
322 0.23
323 0.19
324 0.13
325 0.12
326 0.07
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.04