Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SRR8

Protein Details
Accession C9SRR8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MQLSQKIRRRKKPAGVPPIDYLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-12RRRKK
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 7, cyto_nucl 6.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037796  TAF6  
IPR011442  TAF6_C  
IPR046344  TAF6_C_sf  
IPR004823  TAF_TATA-bd_Histone-like_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0046695  C:SLIK (SAGA-like) complex  
GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0016251  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG val:VDBG_07593  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02969  TAF  
PF07571  TAF6_C  
CDD cd08050  TAF6C  
Amino Acid Sequences MQLSQKIRRRKKPAGVPPIDYLVENVPWFNSVAITVLLVIFTTTKRGSSSVRAMYRATRNQHLGNSSRIINAAAMAQPAQPETKLLWNPENVKDVAESVGISSLNEDALRVLTQDAEYRIGQVVIEALRFMRAARRTTLTVGDIAQALRVLDVEPLYGYESTRPLRYGEASLGPGQPLYYLEDEEVDFEKLINAPLPKVPRDMSFTAHWLAIEGVQPSIPQNPTHRRVPKPGVATERALIENTNLFLDPYANAIAAPVLTCLLGRKLGADDATKDQYELREFSASLLGKIALRYAASNHLLRPKLVRTCLKFFMDPDKLPAAHYGAITGLAAAGGPEAVRVLVLKYLRAARANGVNGGPAATQTAELKEFIGPILGERIAGLGNKRLVEQVLEARTIQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.87
3 0.81
4 0.75
5 0.69
6 0.6
7 0.49
8 0.4
9 0.31
10 0.27
11 0.22
12 0.19
13 0.14
14 0.14
15 0.15
16 0.13
17 0.1
18 0.08
19 0.09
20 0.09
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.11
30 0.11
31 0.12
32 0.14
33 0.17
34 0.2
35 0.26
36 0.34
37 0.39
38 0.42
39 0.43
40 0.44
41 0.49
42 0.54
43 0.55
44 0.51
45 0.49
46 0.51
47 0.52
48 0.55
49 0.53
50 0.47
51 0.44
52 0.42
53 0.36
54 0.32
55 0.29
56 0.25
57 0.19
58 0.17
59 0.14
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.1
68 0.1
69 0.11
70 0.18
71 0.21
72 0.24
73 0.27
74 0.31
75 0.36
76 0.39
77 0.41
78 0.34
79 0.32
80 0.28
81 0.25
82 0.21
83 0.16
84 0.12
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.07
100 0.07
101 0.1
102 0.11
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.13
108 0.12
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.12
119 0.15
120 0.18
121 0.21
122 0.24
123 0.25
124 0.27
125 0.29
126 0.23
127 0.2
128 0.18
129 0.16
130 0.14
131 0.12
132 0.1
133 0.08
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.13
152 0.15
153 0.16
154 0.16
155 0.14
156 0.15
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.14
161 0.13
162 0.11
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.1
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.07
181 0.08
182 0.1
183 0.13
184 0.13
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.21
189 0.21
190 0.21
191 0.2
192 0.21
193 0.2
194 0.2
195 0.17
196 0.12
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.17
209 0.25
210 0.3
211 0.38
212 0.45
213 0.45
214 0.52
215 0.57
216 0.56
217 0.53
218 0.53
219 0.5
220 0.46
221 0.44
222 0.37
223 0.33
224 0.27
225 0.23
226 0.18
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.14
258 0.17
259 0.2
260 0.19
261 0.18
262 0.18
263 0.19
264 0.2
265 0.19
266 0.17
267 0.16
268 0.16
269 0.17
270 0.22
271 0.19
272 0.17
273 0.16
274 0.15
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.08
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.15
283 0.17
284 0.19
285 0.21
286 0.27
287 0.28
288 0.28
289 0.31
290 0.32
291 0.35
292 0.41
293 0.46
294 0.45
295 0.5
296 0.55
297 0.55
298 0.5
299 0.46
300 0.48
301 0.47
302 0.41
303 0.39
304 0.38
305 0.35
306 0.34
307 0.34
308 0.27
309 0.22
310 0.21
311 0.17
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.1
316 0.07
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.09
330 0.1
331 0.11
332 0.15
333 0.19
334 0.23
335 0.25
336 0.26
337 0.26
338 0.33
339 0.34
340 0.33
341 0.29
342 0.26
343 0.24
344 0.24
345 0.19
346 0.12
347 0.12
348 0.09
349 0.1
350 0.1
351 0.13
352 0.13
353 0.14
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.13
359 0.1
360 0.1
361 0.14
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.14
368 0.15
369 0.17
370 0.21
371 0.21
372 0.22
373 0.23
374 0.23
375 0.23
376 0.25
377 0.27
378 0.27