FuNGI

C9S6X8

Protein Details

Accession

C9S6X8

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
59-113	VPRGMRRRTASHNVKRVPKRLRNRAMKEMRDDNTPTVTSRRRKPTTTRARIRSET	Hydrophilic
116-140	KLGILAEKRRKRKLKAAKEKAPTDG	Basic
149-191	IQTKITTRPARPKIRRNVLNDPPRPKSKFRKRQLQKTWLPTHL	Hydrophilic
472-494	SASRLPRQKSVNKRKGARIPGTD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
22-87	KRKEAPSSNDASKKGSPAPGAARWPVKRLKMSEDRKIVPRGMRRRTASHNVKRVPKRLRNRAMKEM
97-136	SRRRKPTTTRARIRSETARKLGILAEKRRKRKLKAAKEKA
156-181	RPARPKIRRNVLNDPPRPKSKFRKRQ

Subcellular Location(s)

mito 17.5, cyto_mito 10.5, nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039182 Pop1 IPR009723 Pop1_N
Gene Ontology	GO:0005655 C:nucleolar ribonuclease P complex GO:0000172 C:ribonuclease MRP complex GO:0001682 P:tRNA 5'-leader removal
KEGG	val:VDBG_00697 -
Pfam	View protein in Pfam PF06978 POP1

Amino Acid Sequences

MRCHATECALQKVAGPASAAAKRKEAPSSNDASKKGSPAPGAARWPVKRLKMSEDRKIVPRGMRRRTASHNVKRVPKRLRNRAMKEMRDDNTPTVTSRRRKPTTTRARIRSETARKLGILAEKRRKRKLKAAKEKAPTDGGSMNDAPSIQTKITTRPARPKIRRNVLNDPPRPKSKFRKRQLQKTWLPTHLWHAKRARMTEPAKPLWRFAIPLTPNEKIYRATHRGQGERGAVAWDMSYMSTIGLYGNENGVCQVLRKLGVMQESCWSERGQRWRAGTRHWNGMLSRDTRLGRRLICPATIQWNPQDAEQQQTPGNEDSDPKKRQRQLFIRVHPSSFLELFNELLRLVKMQTPQLFIEDLRFEIGSIEITGPASTEVLLGVLQPYFTDLAKKEPHANIFGGLTSAATPSALPPNSSLAFSTLDPRLRYPPRKLAPPDLSDEGQSRLMSLLSSWPADEGLQPYSIFDRDQRFSASRLPRQKSVNKRKGARIPGTDLDPSPSDPPIPILLHASRSARGAEAQGTWTVLAPFKCIQAHLVQPRALPAGVSGQSKVLPGLNEEGQAPFERGLP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.24
3	0.19
4	0.23
5	0.29
6	0.32
7	0.29
8	0.32
9	0.34
10	0.37
11	0.44
12	0.44
13	0.45
14	0.47
15	0.52
16	0.57
17	0.61
18	0.58
19	0.56
20	0.52
21	0.5
22	0.48
23	0.46
24	0.39
25	0.38
26	0.42
27	0.42
28	0.45
29	0.46
30	0.5
31	0.47
32	0.52
33	0.53
34	0.54
35	0.55
36	0.54
37	0.57
38	0.59
39	0.65
40	0.68
41	0.7
42	0.68
43	0.68
44	0.69
45	0.65
46	0.62
47	0.64
48	0.64
49	0.65
50	0.68
51	0.67
52	0.68
53	0.72
54	0.75
55	0.76
56	0.76
57	0.77
58	0.75
59	0.81
60	0.82
61	0.83
62	0.83
63	0.82
64	0.83
65	0.84
66	0.87
67	0.88
68	0.87
69	0.89
70	0.88
71	0.84
72	0.81
73	0.78
74	0.69
75	0.64
76	0.6
77	0.51
78	0.45
79	0.4
80	0.34
81	0.34
82	0.4
83	0.42
84	0.48
85	0.56
86	0.58
87	0.63
88	0.71
89	0.74
90	0.77
91	0.8
92	0.81
93	0.79
94	0.81
95	0.78
96	0.75
97	0.75
98	0.73
99	0.7
100	0.64
101	0.58
102	0.5
103	0.47
104	0.44
105	0.41
106	0.4
107	0.42
108	0.49
109	0.55
110	0.63
111	0.72
112	0.77
113	0.76
114	0.78
115	0.79
116	0.8
117	0.84
118	0.86
119	0.86
120	0.86
121	0.82
122	0.75
123	0.68
124	0.57
125	0.48
126	0.4
127	0.32
128	0.28
129	0.25
130	0.21
131	0.18
132	0.17
133	0.15
134	0.13
135	0.15
136	0.1
137	0.13
138	0.14
139	0.18
140	0.28
141	0.34
142	0.37
143	0.46
144	0.55
145	0.64
146	0.71
147	0.76
148	0.78
149	0.82
150	0.84
151	0.81
152	0.81
153	0.8
154	0.81
155	0.79
156	0.75
157	0.7
158	0.71
159	0.68
160	0.66
161	0.68
162	0.69
163	0.72
164	0.75
165	0.8
166	0.82
167	0.88
168	0.91
169	0.9
170	0.87
171	0.86
172	0.83
173	0.76
174	0.68
175	0.58
176	0.56
177	0.54
178	0.48
179	0.45
180	0.43
181	0.44
182	0.46
183	0.48
184	0.42
185	0.43
186	0.44
187	0.44
188	0.46
189	0.47
190	0.5
191	0.47
192	0.45
193	0.39
194	0.37
195	0.31
196	0.25
197	0.28
198	0.22
199	0.27
200	0.31
201	0.29
202	0.3
203	0.3
204	0.3
205	0.24
206	0.26
207	0.29
208	0.3
209	0.31
210	0.35
211	0.39
212	0.4
213	0.38
214	0.4
215	0.32
216	0.27
217	0.25
218	0.2
219	0.15
220	0.12
221	0.11
222	0.07
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.04
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.07
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.08
245	0.08
246	0.1
247	0.14
248	0.14
249	0.14
250	0.16
251	0.18
252	0.18
253	0.18
254	0.17
255	0.15
256	0.18
257	0.26
258	0.28
259	0.3
260	0.33
261	0.39
262	0.41
263	0.45
264	0.49
265	0.44
266	0.45
267	0.42
268	0.4
269	0.33
270	0.36
271	0.34
272	0.26
273	0.24
274	0.22
275	0.22
276	0.22
277	0.24
278	0.23
279	0.21
280	0.22
281	0.26
282	0.23
283	0.23
284	0.22
285	0.21
286	0.24
287	0.24
288	0.22
289	0.19
290	0.22
291	0.22
292	0.21
293	0.24
294	0.18
295	0.21
296	0.2
297	0.2
298	0.17
299	0.17
300	0.19
301	0.16
302	0.16
303	0.13
304	0.15
305	0.18
306	0.25
307	0.29
308	0.31
309	0.39
310	0.44
311	0.49
312	0.57
313	0.61
314	0.63
315	0.68
316	0.7
317	0.72
318	0.67
319	0.62
320	0.53
321	0.45
322	0.37
323	0.28
324	0.22
325	0.13
326	0.12
327	0.12
328	0.12
329	0.1
330	0.08
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.1
336	0.11
337	0.16
338	0.18
339	0.2
340	0.2
341	0.21
342	0.21
343	0.18
344	0.19
345	0.15
346	0.13
347	0.11
348	0.11
349	0.09
350	0.09
351	0.09
352	0.06
353	0.06
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.06
373	0.06
374	0.09
375	0.09
376	0.16
377	0.19
378	0.21
379	0.27
380	0.29
381	0.32
382	0.31
383	0.31
384	0.26
385	0.23
386	0.21
387	0.15
388	0.12
389	0.09
390	0.07
391	0.06
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.06
396	0.13
397	0.13
398	0.13
399	0.14
400	0.18
401	0.19
402	0.2
403	0.18
404	0.14
405	0.16
406	0.15
407	0.19
408	0.18
409	0.22
410	0.22
411	0.24
412	0.31
413	0.38
414	0.45
415	0.48
416	0.55
417	0.56
418	0.64
419	0.67
420	0.68
421	0.66
422	0.62
423	0.6
424	0.54
425	0.49
426	0.42
427	0.39
428	0.31
429	0.27
430	0.23
431	0.18
432	0.14
433	0.14
434	0.12
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.12
439	0.12
440	0.11
441	0.12
442	0.12
443	0.14
444	0.12
445	0.11
446	0.13
447	0.13
448	0.13
449	0.15
450	0.15
451	0.14
452	0.17
453	0.22
454	0.22
455	0.24
456	0.28
457	0.28
458	0.3
459	0.38
460	0.42
461	0.45
462	0.53
463	0.57
464	0.58
465	0.64
466	0.71
467	0.74
468	0.76
469	0.77
470	0.76
471	0.78
472	0.81
473	0.83
474	0.83
475	0.8
476	0.75
477	0.72
478	0.66
479	0.63
480	0.56
481	0.47
482	0.41
483	0.34
484	0.3
485	0.25
486	0.23
487	0.19
488	0.17
489	0.19
490	0.2
491	0.19
492	0.18
493	0.21
494	0.22
495	0.24
496	0.28
497	0.28
498	0.24
499	0.25
500	0.25
501	0.21
502	0.2
503	0.2
504	0.19
505	0.18
506	0.19
507	0.18
508	0.18
509	0.17
510	0.16
511	0.15
512	0.17
513	0.15
514	0.17
515	0.18
516	0.21
517	0.22
518	0.21
519	0.23
520	0.24
521	0.33
522	0.37
523	0.42
524	0.4
525	0.39
526	0.41
527	0.41
528	0.36
529	0.27
530	0.2
531	0.21
532	0.23
533	0.24
534	0.22
535	0.21
536	0.22
537	0.23
538	0.23
539	0.18
540	0.15
541	0.17
542	0.21
543	0.21
544	0.21
545	0.22
546	0.21
547	0.21
548	0.21
549	0.21

C9S6X8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer