Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SJQ0

Protein Details
Accession C9SJQ0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
665-686LMTLNKAKYKQKRSLAAPLRLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-268KKSKKKANAYRKAVTKIHKQERGKEKP
615-661KTTKEERVALAKEGKPERGEHKSTQAIRRSKKDAEGKSTTNKEKARQ
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.833, nucl 10.5, cyto 9, mito_nucl 8.166, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
IPR012977  SDA1_N  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG val:VDBG_05773  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08158  NUC130_3NT  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MGKRKVAALEKVDADFASLQYKIRRDPNSYEDNFLQQWGQYESQREVFLVSPTTATPEYTESFHNLVDLIAHVADCYPQHAEAFPGDLKAILLQHHEVIDSTQLLTTLFPILVSSPSKSLRTLLFQKILGDLRNANSKSTNHPLNRTIQTVLYNLITANRASPKAVWAVKLTRELWKRQVWTDAKTVDVMKEACLSDNEKVVVGAVRFFLGGDKEREELEDDSSDEEAIDLQKMKHQIDINKKSKKKANAYRKAVTKIHKQERGKEKPHPLNFSAFHLLHDPQGFAEQVFQKHLQSTKTKMVLEHRILVLQLESVTSFLACLAQATHNLVPPDCLEPLVQKIANEFVSEAAAGEVAAAGLNAIREICARQPLAMEDTLLQDLVQYRKSKDKGTMMAAKGLLSLFREVGADLLAKKDRGKDATIGLKTGEVRKKRFGEQEAGGIEGLELLEQWKEEQRKAKRAAKGLPEEVGEDEKEDEDDGFNSDDWDVESVDSDDSGGWIAVSSDEEEEDEPAPKKRRKSTADDEEADADKEGDDEKDGEDVESEVQRISKLATTSILTPADLQKLQELRMEASVNKAIGTKSNRSKKLEEALARHIDDGLTAEQIEAPARLRKTTKEERVALAKEGKPERGEHKSTQAIRRSKKDAEGKSTTNKEKARQKNFLMTLNKAKYKQKRSLAAPLRLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.24
3 0.19
4 0.17
5 0.15
6 0.17
7 0.22
8 0.26
9 0.3
10 0.38
11 0.43
12 0.46
13 0.53
14 0.57
15 0.62
16 0.61
17 0.6
18 0.54
19 0.53
20 0.47
21 0.41
22 0.34
23 0.24
24 0.25
25 0.24
26 0.25
27 0.23
28 0.27
29 0.29
30 0.32
31 0.31
32 0.28
33 0.26
34 0.24
35 0.23
36 0.21
37 0.18
38 0.16
39 0.15
40 0.2
41 0.18
42 0.17
43 0.17
44 0.18
45 0.19
46 0.2
47 0.22
48 0.21
49 0.22
50 0.21
51 0.2
52 0.16
53 0.14
54 0.13
55 0.12
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.07
61 0.09
62 0.08
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.14
69 0.13
70 0.17
71 0.15
72 0.14
73 0.14
74 0.13
75 0.13
76 0.13
77 0.13
78 0.11
79 0.13
80 0.14
81 0.15
82 0.15
83 0.15
84 0.14
85 0.13
86 0.14
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.11
100 0.13
101 0.14
102 0.16
103 0.2
104 0.21
105 0.22
106 0.24
107 0.23
108 0.29
109 0.35
110 0.38
111 0.38
112 0.38
113 0.38
114 0.39
115 0.39
116 0.33
117 0.28
118 0.24
119 0.22
120 0.3
121 0.3
122 0.27
123 0.29
124 0.3
125 0.34
126 0.39
127 0.45
128 0.4
129 0.45
130 0.48
131 0.51
132 0.53
133 0.48
134 0.42
135 0.36
136 0.34
137 0.29
138 0.27
139 0.2
140 0.16
141 0.14
142 0.14
143 0.13
144 0.11
145 0.14
146 0.15
147 0.16
148 0.16
149 0.17
150 0.17
151 0.23
152 0.25
153 0.23
154 0.24
155 0.28
156 0.3
157 0.35
158 0.34
159 0.36
160 0.39
161 0.42
162 0.45
163 0.47
164 0.46
165 0.43
166 0.51
167 0.46
168 0.46
169 0.47
170 0.41
171 0.35
172 0.34
173 0.33
174 0.23
175 0.23
176 0.2
177 0.14
178 0.17
179 0.16
180 0.15
181 0.16
182 0.18
183 0.16
184 0.18
185 0.17
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.14
190 0.11
191 0.11
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.11
199 0.13
200 0.14
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.18
205 0.16
206 0.16
207 0.15
208 0.13
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.1
213 0.09
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.11
220 0.14
221 0.15
222 0.19
223 0.22
224 0.28
225 0.38
226 0.48
227 0.55
228 0.61
229 0.64
230 0.66
231 0.69
232 0.71
233 0.71
234 0.71
235 0.73
236 0.74
237 0.79
238 0.79
239 0.78
240 0.75
241 0.7
242 0.65
243 0.64
244 0.63
245 0.65
246 0.66
247 0.62
248 0.65
249 0.71
250 0.75
251 0.7
252 0.68
253 0.69
254 0.7
255 0.74
256 0.7
257 0.61
258 0.57
259 0.53
260 0.49
261 0.44
262 0.35
263 0.3
264 0.26
265 0.25
266 0.21
267 0.21
268 0.16
269 0.11
270 0.12
271 0.11
272 0.08
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.15
277 0.16
278 0.15
279 0.18
280 0.2
281 0.21
282 0.22
283 0.25
284 0.29
285 0.32
286 0.32
287 0.32
288 0.35
289 0.39
290 0.38
291 0.36
292 0.3
293 0.26
294 0.25
295 0.23
296 0.17
297 0.1
298 0.08
299 0.05
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.04
307 0.03
308 0.03
309 0.04
310 0.05
311 0.06
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.12
317 0.11
318 0.12
319 0.13
320 0.1
321 0.1
322 0.08
323 0.09
324 0.1
325 0.12
326 0.12
327 0.1
328 0.1
329 0.12
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.02
343 0.02
344 0.02
345 0.02
346 0.02
347 0.02
348 0.02
349 0.02
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.06
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.11
359 0.13
360 0.12
361 0.12
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.06
368 0.08
369 0.1
370 0.13
371 0.13
372 0.15
373 0.23
374 0.25
375 0.27
376 0.3
377 0.34
378 0.34
379 0.38
380 0.44
381 0.37
382 0.38
383 0.36
384 0.3
385 0.25
386 0.21
387 0.16
388 0.09
389 0.09
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.08
399 0.09
400 0.1
401 0.11
402 0.14
403 0.17
404 0.19
405 0.21
406 0.2
407 0.24
408 0.31
409 0.3
410 0.27
411 0.24
412 0.24
413 0.23
414 0.28
415 0.3
416 0.28
417 0.31
418 0.38
419 0.42
420 0.46
421 0.51
422 0.48
423 0.47
424 0.43
425 0.44
426 0.37
427 0.35
428 0.29
429 0.22
430 0.17
431 0.11
432 0.1
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.1
440 0.13
441 0.17
442 0.26
443 0.33
444 0.42
445 0.5
446 0.57
447 0.58
448 0.62
449 0.66
450 0.65
451 0.64
452 0.57
453 0.5
454 0.43
455 0.38
456 0.33
457 0.27
458 0.19
459 0.13
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.07
476 0.06
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.06
483 0.05
484 0.06
485 0.05
486 0.04
487 0.04
488 0.04
489 0.04
490 0.05
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.07
496 0.09
497 0.09
498 0.12
499 0.13
500 0.19
501 0.28
502 0.32
503 0.39
504 0.46
505 0.55
506 0.59
507 0.66
508 0.7
509 0.73
510 0.76
511 0.71
512 0.65
513 0.58
514 0.53
515 0.44
516 0.33
517 0.22
518 0.14
519 0.12
520 0.11
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.09
526 0.1
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.1
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.14
542 0.15
543 0.17
544 0.21
545 0.2
546 0.16
547 0.18
548 0.19
549 0.22
550 0.21
551 0.2
552 0.21
553 0.23
554 0.24
555 0.25
556 0.24
557 0.21
558 0.23
559 0.25
560 0.19
561 0.22
562 0.24
563 0.21
564 0.2
565 0.2
566 0.17
567 0.22
568 0.28
569 0.33
570 0.4
571 0.5
572 0.56
573 0.6
574 0.63
575 0.63
576 0.66
577 0.66
578 0.62
579 0.58
580 0.59
581 0.59
582 0.56
583 0.5
584 0.41
585 0.32
586 0.25
587 0.23
588 0.16
589 0.1
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.11
595 0.09
596 0.11
597 0.16
598 0.17
599 0.22
600 0.24
601 0.3
602 0.38
603 0.48
604 0.55
605 0.58
606 0.61
607 0.62
608 0.68
609 0.64
610 0.61
611 0.58
612 0.51
613 0.5
614 0.5
615 0.49
616 0.43
617 0.45
618 0.47
619 0.48
620 0.51
621 0.47
622 0.51
623 0.56
624 0.61
625 0.65
626 0.67
627 0.68
628 0.7
629 0.74
630 0.73
631 0.69
632 0.71
633 0.73
634 0.72
635 0.71
636 0.7
637 0.68
638 0.7
639 0.74
640 0.72
641 0.7
642 0.67
643 0.67
644 0.7
645 0.75
646 0.75
647 0.75
648 0.74
649 0.76
650 0.76
651 0.76
652 0.71
653 0.67
654 0.68
655 0.67
656 0.68
657 0.63
658 0.68
659 0.69
660 0.73
661 0.76
662 0.75
663 0.76
664 0.76
665 0.82
666 0.82