Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SSA5

Protein Details
Accession C9SSA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-36NITLRWCKDNKDKPENNLICHydrophilic
75-94TTCRGHPKRLVIWRHPNRAIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.833, cyto 5, pero 4, cyto_mito 3.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
KEGG val:VDBG_07780  -  
Amino Acid Sequences MCLSKCDDPADERFFINITLRWCKDNKDKPENNLICTVNELDNTDYNVVDLVKLLIAWALRSEAVYANTFEDLITTCRGHPKRLVIWRHPNRAIFPAAGKAGDVLLDGNMEYRQPLALLRKSCITAGLAIHPVTHDVRRGAIRGVFEIGRGLGIDSGRELARQVAGHSLSSFAAGVTDEYIGPSHIDHYSLRINAHTSNQSRNNTNEKKRALPYDLESNLTWSEGQTSSKRKHSRQEITDTCQSMGLDPKVVRHRETASKKLNSTQHWAAAINERQEQDAMDALTAHAPPGKQINEASEGTEKGKSSSITNPRNPFTHPKSFDSCNLIDIPQDGPVSSAARSEADIINDSLEDIIIQADDDAEQDATEQDALDAMPEIPLESDSVLTSDRKQFVTYFSSVNTYLHQTATSKSPAIMPTTIGSKDLPDRKVFACRNKFCSRVFNRSAAFEQHLKTCDPPKNDALVCTNCSKLFKTEKSLKGHLDQKICDFGQKLCPYRHECGDDTVFTGRGTLEKHYDDKHRGWVNRNCPVRSCPRHTQTFNKITDLKGHLKRMHKDILTDDAIADWLPTPRGRINENKNSRTNIKKSLEKCAEKSTKKSTETTVANDSDEDRIVYDTGAEGETESEGSFSTMTETEDEDDHENDWSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.29
3 0.28
4 0.24
5 0.24
6 0.31
7 0.32
8 0.36
9 0.38
10 0.44
11 0.51
12 0.58
13 0.62
14 0.64
15 0.7
16 0.71
17 0.81
18 0.77
19 0.7
20 0.67
21 0.58
22 0.47
23 0.43
24 0.39
25 0.3
26 0.27
27 0.26
28 0.21
29 0.22
30 0.24
31 0.22
32 0.19
33 0.17
34 0.17
35 0.15
36 0.12
37 0.1
38 0.08
39 0.07
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.11
50 0.12
51 0.14
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.14
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.14
62 0.14
63 0.15
64 0.25
65 0.28
66 0.31
67 0.35
68 0.41
69 0.47
70 0.55
71 0.63
72 0.63
73 0.73
74 0.78
75 0.82
76 0.8
77 0.74
78 0.68
79 0.63
80 0.56
81 0.46
82 0.38
83 0.33
84 0.28
85 0.25
86 0.22
87 0.17
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.07
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.07
102 0.1
103 0.17
104 0.23
105 0.25
106 0.27
107 0.29
108 0.3
109 0.3
110 0.28
111 0.22
112 0.19
113 0.18
114 0.19
115 0.19
116 0.18
117 0.18
118 0.16
119 0.18
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.15
124 0.19
125 0.2
126 0.22
127 0.22
128 0.23
129 0.22
130 0.2
131 0.23
132 0.19
133 0.17
134 0.16
135 0.13
136 0.11
137 0.1
138 0.09
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.14
152 0.15
153 0.16
154 0.15
155 0.15
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.06
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.12
176 0.16
177 0.17
178 0.18
179 0.17
180 0.18
181 0.18
182 0.23
183 0.26
184 0.25
185 0.31
186 0.38
187 0.41
188 0.42
189 0.45
190 0.52
191 0.54
192 0.59
193 0.6
194 0.55
195 0.58
196 0.59
197 0.59
198 0.53
199 0.47
200 0.42
201 0.43
202 0.41
203 0.37
204 0.33
205 0.3
206 0.26
207 0.23
208 0.19
209 0.1
210 0.12
211 0.11
212 0.14
213 0.17
214 0.23
215 0.28
216 0.37
217 0.44
218 0.45
219 0.53
220 0.61
221 0.65
222 0.65
223 0.71
224 0.67
225 0.66
226 0.67
227 0.59
228 0.49
229 0.41
230 0.35
231 0.26
232 0.24
233 0.18
234 0.16
235 0.15
236 0.21
237 0.26
238 0.28
239 0.28
240 0.27
241 0.31
242 0.37
243 0.43
244 0.47
245 0.48
246 0.51
247 0.5
248 0.54
249 0.56
250 0.49
251 0.5
252 0.43
253 0.36
254 0.33
255 0.33
256 0.27
257 0.28
258 0.28
259 0.23
260 0.24
261 0.22
262 0.21
263 0.21
264 0.19
265 0.13
266 0.12
267 0.1
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.11
278 0.12
279 0.12
280 0.12
281 0.15
282 0.17
283 0.18
284 0.19
285 0.16
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.15
290 0.12
291 0.14
292 0.13
293 0.14
294 0.21
295 0.29
296 0.35
297 0.41
298 0.44
299 0.44
300 0.44
301 0.45
302 0.45
303 0.43
304 0.44
305 0.42
306 0.42
307 0.44
308 0.45
309 0.45
310 0.42
311 0.35
312 0.27
313 0.25
314 0.2
315 0.17
316 0.15
317 0.13
318 0.1
319 0.1
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.08
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.06
338 0.05
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.02
345 0.03
346 0.03
347 0.03
348 0.04
349 0.03
350 0.03
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.03
357 0.04
358 0.04
359 0.03
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.04
369 0.05
370 0.04
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.09
375 0.14
376 0.16
377 0.16
378 0.18
379 0.18
380 0.2
381 0.24
382 0.23
383 0.19
384 0.18
385 0.19
386 0.19
387 0.19
388 0.17
389 0.15
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.12
394 0.13
395 0.16
396 0.17
397 0.14
398 0.14
399 0.16
400 0.17
401 0.19
402 0.17
403 0.15
404 0.14
405 0.17
406 0.16
407 0.15
408 0.13
409 0.12
410 0.19
411 0.24
412 0.25
413 0.24
414 0.27
415 0.27
416 0.37
417 0.4
418 0.44
419 0.48
420 0.5
421 0.57
422 0.6
423 0.62
424 0.55
425 0.6
426 0.57
427 0.56
428 0.55
429 0.53
430 0.48
431 0.48
432 0.48
433 0.4
434 0.37
435 0.31
436 0.29
437 0.27
438 0.27
439 0.25
440 0.26
441 0.31
442 0.33
443 0.33
444 0.37
445 0.36
446 0.41
447 0.4
448 0.4
449 0.38
450 0.35
451 0.34
452 0.31
453 0.3
454 0.25
455 0.27
456 0.25
457 0.26
458 0.31
459 0.32
460 0.38
461 0.46
462 0.52
463 0.57
464 0.6
465 0.57
466 0.56
467 0.59
468 0.57
469 0.53
470 0.47
471 0.43
472 0.44
473 0.4
474 0.36
475 0.3
476 0.27
477 0.31
478 0.36
479 0.38
480 0.35
481 0.42
482 0.45
483 0.48
484 0.52
485 0.47
486 0.42
487 0.43
488 0.43
489 0.37
490 0.33
491 0.3
492 0.25
493 0.2
494 0.19
495 0.13
496 0.12
497 0.13
498 0.14
499 0.17
500 0.19
501 0.23
502 0.27
503 0.34
504 0.38
505 0.39
506 0.45
507 0.48
508 0.51
509 0.57
510 0.61
511 0.62
512 0.65
513 0.7
514 0.62
515 0.58
516 0.6
517 0.61
518 0.61
519 0.61
520 0.62
521 0.62
522 0.7
523 0.72
524 0.75
525 0.75
526 0.75
527 0.69
528 0.65
529 0.6
530 0.51
531 0.54
532 0.5
533 0.49
534 0.47
535 0.52
536 0.53
537 0.59
538 0.64
539 0.63
540 0.65
541 0.57
542 0.53
543 0.48
544 0.49
545 0.43
546 0.37
547 0.31
548 0.22
549 0.21
550 0.18
551 0.15
552 0.09
553 0.08
554 0.1
555 0.11
556 0.14
557 0.18
558 0.22
559 0.26
560 0.35
561 0.44
562 0.52
563 0.62
564 0.66
565 0.68
566 0.71
567 0.73
568 0.73
569 0.69
570 0.69
571 0.66
572 0.67
573 0.65
574 0.69
575 0.72
576 0.69
577 0.67
578 0.67
579 0.7
580 0.68
581 0.72
582 0.71
583 0.7
584 0.67
585 0.66
586 0.61
587 0.59
588 0.58
589 0.56
590 0.52
591 0.45
592 0.42
593 0.39
594 0.36
595 0.29
596 0.25
597 0.2
598 0.14
599 0.14
600 0.14
601 0.12
602 0.11
603 0.1
604 0.1
605 0.1
606 0.09
607 0.08
608 0.08
609 0.09
610 0.09
611 0.08
612 0.07
613 0.07
614 0.08
615 0.08
616 0.07
617 0.09
618 0.1
619 0.11
620 0.12
621 0.14
622 0.15
623 0.16
624 0.18
625 0.18
626 0.18
627 0.18