Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SBP3

Protein Details
Accession C9SBP3    Localization Confidence High Confidence Score 25.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-111AKTLKASKRKQTDGDKTRKPKEGRREKKRSRADEDEABasic
116-139FDESRPSRKSRRGAEPRPRAQKPSBasic
160-185RTLDGVFKKPTKRRKRKDEEDLEDEIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-105KASKRKQTDGDKTRKPKEGRREKKRSR
120-138RPSRKSRRGAEPRPRAQKP
167-176KKPTKRRKRK
422-426KAKKR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG val:VDBG_01886  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDIESLPGSPAAVGQDTVDDVEEPHEGVDGATAEDLSDVESDALSEIDENQFEDYDPETANIEDRPVAVDEDVAKTLKASKRKQTDGDKTRKPKEGRREKKRSRADEDEAADGDFDESRPSRKSRRGAEPRPRAQKPSPQPENEDHLSPEERRQRAIDRTLDGVFKKPTKRRKRKDEEDLEDEIDDHIASLKLRMEGACESDNKAREAGQPAVHKLKLLPEVTALLNRTTVQHAVLDPDTNFLQHVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDIFTALCNLTLEKEVLLSSGIGKVVLFYKHSKRPEVSIKRMADRLLGEWSRPLLKRTDDYRKRQIETRDYDYDAHKASLRNANSQYTLAQRPSISARDAERERFLANGVKSNRARPGGLPASYSIAPVSTFDPTTAPDHRPIGASGAEAFRKMTQKAKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.11
4 0.11
5 0.12
6 0.11
7 0.09
8 0.08
9 0.1
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.09
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.06
32 0.05
33 0.06
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.15
60 0.16
61 0.14
62 0.13
63 0.13
64 0.2
65 0.24
66 0.31
67 0.36
68 0.44
69 0.53
70 0.6
71 0.68
72 0.71
73 0.77
74 0.78
75 0.81
76 0.81
77 0.82
78 0.83
79 0.83
80 0.79
81 0.77
82 0.78
83 0.79
84 0.8
85 0.82
86 0.86
87 0.87
88 0.91
89 0.92
90 0.9
91 0.87
92 0.85
93 0.79
94 0.76
95 0.68
96 0.6
97 0.5
98 0.41
99 0.32
100 0.23
101 0.18
102 0.1
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.12
107 0.16
108 0.2
109 0.27
110 0.35
111 0.43
112 0.48
113 0.59
114 0.67
115 0.74
116 0.81
117 0.84
118 0.85
119 0.87
120 0.81
121 0.77
122 0.71
123 0.71
124 0.69
125 0.7
126 0.68
127 0.62
128 0.64
129 0.61
130 0.62
131 0.54
132 0.46
133 0.36
134 0.31
135 0.3
136 0.26
137 0.3
138 0.31
139 0.3
140 0.3
141 0.32
142 0.35
143 0.38
144 0.43
145 0.4
146 0.34
147 0.36
148 0.36
149 0.36
150 0.31
151 0.28
152 0.25
153 0.26
154 0.32
155 0.37
156 0.46
157 0.55
158 0.65
159 0.72
160 0.8
161 0.86
162 0.88
163 0.92
164 0.92
165 0.87
166 0.82
167 0.74
168 0.63
169 0.52
170 0.42
171 0.31
172 0.21
173 0.13
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.07
181 0.08
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.12
186 0.13
187 0.12
188 0.15
189 0.18
190 0.19
191 0.18
192 0.17
193 0.16
194 0.17
195 0.2
196 0.2
197 0.21
198 0.21
199 0.24
200 0.27
201 0.26
202 0.23
203 0.19
204 0.21
205 0.22
206 0.21
207 0.18
208 0.15
209 0.17
210 0.17
211 0.19
212 0.15
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.14
241 0.16
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.12
246 0.12
247 0.13
248 0.12
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.09
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.09
278 0.1
279 0.12
280 0.16
281 0.23
282 0.31
283 0.35
284 0.39
285 0.38
286 0.44
287 0.52
288 0.57
289 0.58
290 0.59
291 0.59
292 0.58
293 0.59
294 0.52
295 0.44
296 0.36
297 0.3
298 0.28
299 0.25
300 0.22
301 0.21
302 0.23
303 0.25
304 0.25
305 0.25
306 0.22
307 0.25
308 0.31
309 0.38
310 0.47
311 0.51
312 0.58
313 0.67
314 0.7
315 0.69
316 0.69
317 0.7
318 0.69
319 0.66
320 0.65
321 0.59
322 0.55
323 0.54
324 0.5
325 0.45
326 0.37
327 0.31
328 0.27
329 0.24
330 0.27
331 0.33
332 0.33
333 0.36
334 0.38
335 0.39
336 0.38
337 0.37
338 0.34
339 0.32
340 0.34
341 0.28
342 0.28
343 0.25
344 0.26
345 0.29
346 0.3
347 0.26
348 0.25
349 0.26
350 0.32
351 0.36
352 0.37
353 0.36
354 0.35
355 0.33
356 0.3
357 0.29
358 0.28
359 0.25
360 0.3
361 0.29
362 0.37
363 0.39
364 0.43
365 0.48
366 0.44
367 0.44
368 0.37
369 0.44
370 0.42
371 0.41
372 0.38
373 0.32
374 0.34
375 0.32
376 0.31
377 0.22
378 0.15
379 0.14
380 0.14
381 0.15
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.14
386 0.16
387 0.21
388 0.24
389 0.26
390 0.28
391 0.3
392 0.31
393 0.32
394 0.3
395 0.28
396 0.24
397 0.22
398 0.2
399 0.23
400 0.23
401 0.21
402 0.22
403 0.23
404 0.28
405 0.29
406 0.35