Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SPG4

Protein Details
Accession C9SPG4    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-61SLSMKTSNKMRRKQMFIEDKKVKDKQRHEERHRRRKEEAKNPELREARBasic
133-160DEERQAKLEEKKEKKKRAKRDDSMAPSTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-27RRKQ
29-65FIEDKKVKDKQRHEERHRRRKEEAKNPELREARLAKN
141-152EEKKEKKKRAKR
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG val:VDBG_06789  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MGSQKAGNRSSGASLSMKTSNKMRRKQMFIEDKKVKDKQRHEERHRRRKEEAKNPELREARLAKNKPQTLETKRVWDDVDDDSLGAIVDVEKLKRRRLEEEERAANEAMEVDEEEDDEDDDNDSMLDSGDEDDEERQAKLEEKKEKKKRAKRDDSMAPSTTSTNLDLTPSSLSTKFPTLFTDIPPPPPKILITTSLNSTLHHEADIFCTLFPNSNYIRRTQHHYGHKYSLREISRFAANREYTAVVMLREDQKVLTGLTVVHLPSGPTFTFSVTNFMEGKKLPGHGNPTNHYPELLLNNFKTPLGMLTAKLFQTLFPPQPEFVGRQVLTVHNQRDYLFWRRHRYVFRDKRTTEKNITTAEGKDLEGVEGIRVGLQEVGPRFTLKLRRVDKGVGRAGSEGEDALQWEWKARWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.3
4 0.3
5 0.3
6 0.37
7 0.44
8 0.51
9 0.59
10 0.66
11 0.68
12 0.74
13 0.79
14 0.81
15 0.82
16 0.8
17 0.82
18 0.8
19 0.77
20 0.78
21 0.78
22 0.75
23 0.74
24 0.76
25 0.76
26 0.78
27 0.84
28 0.86
29 0.89
30 0.93
31 0.94
32 0.94
33 0.9
34 0.88
35 0.87
36 0.87
37 0.86
38 0.86
39 0.85
40 0.84
41 0.81
42 0.81
43 0.74
44 0.65
45 0.62
46 0.56
47 0.54
48 0.55
49 0.55
50 0.55
51 0.61
52 0.64
53 0.58
54 0.58
55 0.59
56 0.57
57 0.63
58 0.57
59 0.56
60 0.54
61 0.54
62 0.49
63 0.41
64 0.36
65 0.29
66 0.29
67 0.2
68 0.18
69 0.15
70 0.14
71 0.13
72 0.1
73 0.07
74 0.04
75 0.06
76 0.08
77 0.1
78 0.18
79 0.21
80 0.27
81 0.32
82 0.36
83 0.41
84 0.48
85 0.57
86 0.59
87 0.65
88 0.66
89 0.62
90 0.61
91 0.54
92 0.45
93 0.34
94 0.25
95 0.16
96 0.09
97 0.08
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.14
126 0.19
127 0.27
128 0.35
129 0.44
130 0.55
131 0.65
132 0.74
133 0.8
134 0.84
135 0.87
136 0.89
137 0.9
138 0.87
139 0.86
140 0.85
141 0.81
142 0.77
143 0.68
144 0.57
145 0.47
146 0.4
147 0.33
148 0.24
149 0.17
150 0.13
151 0.11
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.18
166 0.18
167 0.19
168 0.26
169 0.24
170 0.29
171 0.32
172 0.31
173 0.27
174 0.27
175 0.26
176 0.2
177 0.21
178 0.2
179 0.2
180 0.19
181 0.2
182 0.22
183 0.22
184 0.2
185 0.22
186 0.19
187 0.15
188 0.14
189 0.13
190 0.11
191 0.13
192 0.14
193 0.1
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.1
198 0.1
199 0.12
200 0.12
201 0.18
202 0.19
203 0.21
204 0.26
205 0.27
206 0.35
207 0.37
208 0.43
209 0.47
210 0.51
211 0.52
212 0.55
213 0.57
214 0.51
215 0.47
216 0.47
217 0.4
218 0.35
219 0.32
220 0.27
221 0.29
222 0.28
223 0.27
224 0.27
225 0.25
226 0.25
227 0.25
228 0.23
229 0.17
230 0.17
231 0.16
232 0.09
233 0.09
234 0.11
235 0.12
236 0.11
237 0.12
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.18
260 0.15
261 0.18
262 0.17
263 0.17
264 0.18
265 0.15
266 0.18
267 0.15
268 0.18
269 0.17
270 0.2
271 0.27
272 0.3
273 0.35
274 0.35
275 0.39
276 0.41
277 0.39
278 0.36
279 0.29
280 0.27
281 0.27
282 0.27
283 0.26
284 0.22
285 0.24
286 0.24
287 0.23
288 0.2
289 0.15
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.12
294 0.14
295 0.18
296 0.18
297 0.18
298 0.17
299 0.13
300 0.16
301 0.21
302 0.22
303 0.23
304 0.25
305 0.24
306 0.26
307 0.28
308 0.27
309 0.24
310 0.28
311 0.25
312 0.24
313 0.25
314 0.26
315 0.29
316 0.33
317 0.34
318 0.28
319 0.29
320 0.29
321 0.3
322 0.33
323 0.36
324 0.38
325 0.43
326 0.5
327 0.54
328 0.61
329 0.66
330 0.69
331 0.71
332 0.73
333 0.76
334 0.77
335 0.74
336 0.76
337 0.76
338 0.76
339 0.72
340 0.68
341 0.64
342 0.56
343 0.57
344 0.51
345 0.45
346 0.4
347 0.34
348 0.27
349 0.23
350 0.21
351 0.18
352 0.16
353 0.15
354 0.11
355 0.1
356 0.1
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.13
363 0.14
364 0.17
365 0.17
366 0.18
367 0.19
368 0.24
369 0.32
370 0.33
371 0.42
372 0.45
373 0.5
374 0.53
375 0.6
376 0.61
377 0.61
378 0.63
379 0.55
380 0.51
381 0.46
382 0.43
383 0.37
384 0.3
385 0.21
386 0.14
387 0.12
388 0.12
389 0.12
390 0.15
391 0.13
392 0.16