Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SNQ6

Protein Details
Accession C9SNQ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
155-179VPAAGGPRGRRRRRRSRASGRICAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-182GGPRGRRRRRRSRASGRICAAPRG
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034627  Irc6  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG val:VDBG_06531  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10199  Adaptin_binding  
Amino Acid Sequences MAMEIANPKRILALAAHDRQDDLARFLGALTGTTPEPSTAASATPSLAGTSHVLPLTTSYYTATVPVWLDLVADATATATDTDGADADADEDWAATFLAPEARESSTRSAVSSSCCLWRAASRLRGGSSSRSVASSGRASGGGGGTGSGSLSVSVPAAGGPRGRRRRRRSRASGRICAAPRGWKKMGIHRVLEALEANDWDQGDIPSDLEDELGGLEDGRDDPESLDFGVDRADFEGLRQAIWGLDTEPRAEGDGEARGSGAQAEPLDEAAEVEKLESMMRKLQAVRDMSAGLPEEQRKKMAAKAVNEVMKDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.32
3 0.35
4 0.34
5 0.34
6 0.34
7 0.37
8 0.31
9 0.24
10 0.21
11 0.18
12 0.18
13 0.17
14 0.18
15 0.13
16 0.11
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.11
21 0.11
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.11
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.12
42 0.14
43 0.16
44 0.14
45 0.13
46 0.12
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.12
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.08
56 0.09
57 0.07
58 0.08
59 0.06
60 0.05
61 0.05
62 0.04
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.04
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.03
83 0.03
84 0.04
85 0.07
86 0.07
87 0.08
88 0.1
89 0.11
90 0.13
91 0.15
92 0.18
93 0.2
94 0.2
95 0.2
96 0.19
97 0.18
98 0.2
99 0.2
100 0.18
101 0.16
102 0.17
103 0.17
104 0.16
105 0.18
106 0.21
107 0.25
108 0.29
109 0.29
110 0.3
111 0.3
112 0.31
113 0.3
114 0.28
115 0.25
116 0.22
117 0.19
118 0.18
119 0.18
120 0.16
121 0.18
122 0.15
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.06
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.07
147 0.1
148 0.19
149 0.3
150 0.38
151 0.48
152 0.58
153 0.69
154 0.77
155 0.85
156 0.86
157 0.88
158 0.9
159 0.89
160 0.86
161 0.77
162 0.73
163 0.63
164 0.54
165 0.44
166 0.42
167 0.37
168 0.37
169 0.36
170 0.34
171 0.35
172 0.42
173 0.49
174 0.45
175 0.43
176 0.36
177 0.37
178 0.33
179 0.31
180 0.22
181 0.14
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.06
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.03
204 0.04
205 0.04
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.07
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.15
224 0.13
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.07
232 0.1
233 0.11
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.11
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.08
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.09
256 0.09
257 0.07
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.09
264 0.1
265 0.12
266 0.17
267 0.18
268 0.22
269 0.23
270 0.28
271 0.34
272 0.35
273 0.34
274 0.31
275 0.31
276 0.27
277 0.28
278 0.25
279 0.2
280 0.22
281 0.27
282 0.32
283 0.33
284 0.35
285 0.35
286 0.36
287 0.39
288 0.42
289 0.42
290 0.4
291 0.46
292 0.52
293 0.54