FuNGI

C9SGD0

Protein Details

Accession

C9SGD0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-47	ATPSSQSKAQTKKKAAFDPRAE	Hydrophilic
106-129	SDDGRDSKQNKKKVVKKAASSPSD	Hydrophilic
236-257	EEPTKKSKKASTKKTARKEATP	Hydrophilic
483-505	SSQKSSKKASTTTKKAKRKAAEV	Hydrophilic
517-541	EEEAALKKKKSKKQKRSVEDTPTST	Hydrophilic
597-627	VSTPTVKKEKKSKSSSATPKPKSKQARPPSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
240-253	KKSKKASTKKTARK
496-501	KKAKRK
523-532	KKKKSKKQKR
561-569	KSGKKSKKA
602-627	VKKEKKSKSSSATPKPKSKQARPPSP

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 12.333, mito_nucl 11.666, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
KEGG	val:VDBG_03579 -
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MSKRRNLDGVASLRGFLAKAGDDLDATPSSQSKAQTKKKAAFDPRAEDSDSESEAASNSDSDSDAALPDPASWNRLNKSTSTPTSQKGIAPSKRTPRSNREEVADSDDGRDSKQNKKKVVKKAASSPSDSSSDSSSDSSSEPVASSDSSDSEDEAPAKKITRKPASKEKEDTSSSDSSSPAASGSDSDSDSGSDDNANSKKAAKSLMNGKAAPSKKAASTSSSASSSASGSESEAEEPTKKSKKASTKKTARKEATPEESSGSEESEAEEPTSAFETQKEPEKVTESLAVAPQPKKTATNGFQGENFVLRPVQGDEDGKDVQDFFAQAKREGKQLWYFTAPASVPINVIEQLEIPIHKIRNGEPVFKHDGADYGVNVSNEAANPTYQVLIPNKKGVRYEPLAQNVDQVMRIKRIIQVPSPANAEVATLPLASSKGARPQPKGLKARYHPIGVPADEDMGQIGSESGDEAEDVEMTQAPELPSSSQKSSKKASTTTKKAKRKAAEVDEEAASSQLVGEEEAALKKKKSKKQKRSVEDTPTSTPAAPSQELQTPSQPELPAPKSGKKSKKATLPAPASSQASKKETPILPPAVPHRASVSTPTVKKEKKSKSSSATPKPKSKQARPPSP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.26
3	0.18
4	0.16
5	0.1
6	0.11
7	0.12
8	0.12
9	0.12
10	0.12
11	0.16
12	0.14
13	0.14
14	0.14
15	0.14
16	0.16
17	0.18
18	0.23
19	0.28
20	0.38
21	0.47
22	0.56
23	0.64
24	0.7
25	0.76
26	0.81
27	0.82
28	0.82
29	0.8
30	0.77
31	0.73
32	0.68
33	0.61
34	0.52
35	0.47
36	0.41
37	0.34
38	0.27
39	0.22
40	0.18
41	0.17
42	0.17
43	0.12
44	0.09
45	0.08
46	0.08
47	0.09
48	0.09
49	0.1
50	0.09
51	0.09
52	0.09
53	0.1
54	0.09
55	0.09
56	0.14
57	0.14
58	0.18
59	0.2
60	0.25
61	0.28
62	0.33
63	0.34
64	0.32
65	0.39
66	0.44
67	0.45
68	0.48
69	0.49
70	0.46
71	0.49
72	0.48
73	0.43
74	0.42
75	0.48
76	0.47
77	0.49
78	0.54
79	0.6
80	0.67
81	0.73
82	0.73
83	0.73
84	0.75
85	0.77
86	0.73
87	0.68
88	0.64
89	0.58
90	0.57
91	0.49
92	0.41
93	0.34
94	0.33
95	0.28
96	0.25
97	0.29
98	0.25
99	0.32
100	0.4
101	0.46
102	0.52
103	0.62
104	0.7
105	0.74
106	0.82
107	0.8
108	0.78
109	0.81
110	0.81
111	0.75
112	0.71
113	0.63
114	0.55
115	0.5
116	0.44
117	0.35
118	0.27
119	0.24
120	0.21
121	0.19
122	0.16
123	0.14
124	0.14
125	0.14
126	0.12
127	0.12
128	0.1
129	0.1
130	0.11
131	0.09
132	0.1
133	0.1
134	0.1
135	0.12
136	0.12
137	0.13
138	0.13
139	0.14
140	0.14
141	0.15
142	0.16
143	0.16
144	0.19
145	0.24
146	0.28
147	0.37
148	0.45
149	0.51
150	0.56
151	0.66
152	0.71
153	0.72
154	0.74
155	0.68
156	0.65
157	0.59
158	0.55
159	0.5
160	0.44
161	0.37
162	0.32
163	0.28
164	0.21
165	0.19
166	0.16
167	0.1
168	0.09
169	0.07
170	0.07
171	0.08
172	0.09
173	0.09
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.08
180	0.07
181	0.07
182	0.12
183	0.13
184	0.14
185	0.14
186	0.17
187	0.18
188	0.19
189	0.23
190	0.19
191	0.22
192	0.31
193	0.38
194	0.39
195	0.38
196	0.38
197	0.42
198	0.42
199	0.39
200	0.32
201	0.26
202	0.23
203	0.27
204	0.27
205	0.22
206	0.24
207	0.25
208	0.24
209	0.24
210	0.22
211	0.19
212	0.18
213	0.15
214	0.13
215	0.1
216	0.08
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.09
223	0.1
224	0.12
225	0.18
226	0.23
227	0.24
228	0.26
229	0.33
230	0.43
231	0.51
232	0.6
233	0.64
234	0.69
235	0.78
236	0.85
237	0.88
238	0.8
239	0.76
240	0.72
241	0.69
242	0.65
243	0.57
244	0.49
245	0.4
246	0.37
247	0.33
248	0.26
249	0.19
250	0.11
251	0.09
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.09
260	0.08
261	0.07
262	0.08
263	0.1
264	0.11
265	0.19
266	0.2
267	0.19
268	0.2
269	0.23
270	0.23
271	0.22
272	0.23
273	0.16
274	0.16
275	0.16
276	0.16
277	0.17
278	0.17
279	0.17
280	0.16
281	0.16
282	0.16
283	0.18
284	0.24
285	0.23
286	0.3
287	0.31
288	0.3
289	0.3
290	0.29
291	0.27
292	0.2
293	0.17
294	0.1
295	0.07
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.07
300	0.07
301	0.08
302	0.08
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.1
307	0.09
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.06
312	0.09
313	0.1
314	0.12
315	0.16
316	0.16
317	0.19
318	0.19
319	0.21
320	0.23
321	0.24
322	0.24
323	0.22
324	0.22
325	0.19
326	0.22
327	0.18
328	0.15
329	0.14
330	0.12
331	0.1
332	0.11
333	0.11
334	0.09
335	0.09
336	0.07
337	0.06
338	0.07
339	0.08
340	0.07
341	0.08
342	0.11
343	0.11
344	0.13
345	0.14
346	0.14
347	0.23
348	0.25
349	0.29
350	0.27
351	0.32
352	0.37
353	0.36
354	0.35
355	0.25
356	0.25
357	0.2
358	0.2
359	0.14
360	0.11
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.1
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.08
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.07
374	0.11
375	0.15
376	0.2
377	0.21
378	0.28
379	0.28
380	0.3
381	0.31
382	0.3
383	0.31
384	0.3
385	0.35
386	0.34
387	0.4
388	0.4
389	0.39
390	0.38
391	0.33
392	0.29
393	0.24
394	0.21
395	0.17
396	0.17
397	0.17
398	0.16
399	0.2
400	0.25
401	0.26
402	0.25
403	0.3
404	0.3
405	0.33
406	0.34
407	0.29
408	0.24
409	0.21
410	0.19
411	0.12
412	0.11
413	0.09
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.07
418	0.06
419	0.08
420	0.08
421	0.16
422	0.22
423	0.27
424	0.31
425	0.4
426	0.49
427	0.57
428	0.63
429	0.6
430	0.64
431	0.62
432	0.67
433	0.62
434	0.56
435	0.47
436	0.45
437	0.43
438	0.34
439	0.31
440	0.23
441	0.2
442	0.18
443	0.17
444	0.12
445	0.08
446	0.07
447	0.06
448	0.05
449	0.04
450	0.04
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.06
462	0.07
463	0.08
464	0.08
465	0.09
466	0.1
467	0.11
468	0.15
469	0.19
470	0.23
471	0.29
472	0.33
473	0.37
474	0.43
475	0.47
476	0.47
477	0.5
478	0.57
479	0.6
480	0.66
481	0.72
482	0.77
483	0.81
484	0.83
485	0.85
486	0.81
487	0.79
488	0.78
489	0.76
490	0.74
491	0.67
492	0.63
493	0.55
494	0.48
495	0.39
496	0.29
497	0.2
498	0.12
499	0.08
500	0.06
501	0.05
502	0.05
503	0.05
504	0.06
505	0.08
506	0.11
507	0.15
508	0.16
509	0.18
510	0.26
511	0.35
512	0.43
513	0.53
514	0.62
515	0.7
516	0.78
517	0.88
518	0.9
519	0.9
520	0.91
521	0.89
522	0.85
523	0.8
524	0.73
525	0.65
526	0.57
527	0.48
528	0.39
529	0.32
530	0.29
531	0.25
532	0.22
533	0.22
534	0.27
535	0.29
536	0.3
537	0.33
538	0.31
539	0.33
540	0.36
541	0.33
542	0.29
543	0.34
544	0.35
545	0.38
546	0.39
547	0.44
548	0.48
549	0.58
550	0.66
551	0.67
552	0.73
553	0.72
554	0.77
555	0.79
556	0.78
557	0.78
558	0.75
559	0.7
560	0.66
561	0.62
562	0.55
563	0.49
564	0.46
565	0.42
566	0.41
567	0.39
568	0.37
569	0.42
570	0.41
571	0.43
572	0.47
573	0.46
574	0.41
575	0.44
576	0.48
577	0.47
578	0.46
579	0.41
580	0.38
581	0.35
582	0.35
583	0.36
584	0.38
585	0.39
586	0.41
587	0.46
588	0.52
589	0.54
590	0.61
591	0.66
592	0.68
593	0.7
594	0.76
595	0.79
596	0.78
597	0.84
598	0.86
599	0.87
600	0.87
601	0.86
602	0.87
603	0.85
604	0.86
605	0.86
606	0.85
607	0.85

C9SGD0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer