Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SH93

Protein Details
Accession C9SH93    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
251-272RSASRAAPQRRRRRMIHKQEVIHydrophilic
415-434TFSVTRRRGLRRPQGLAPRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
237-265KIREEDREGREKASRSASRAAPQRRRRRM
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
KEGG val:VDBG_03796  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MATKRPRSPGQALIPNPFIKKRNLEWALDVPDDDAQPTHRQAADDDDDDDNAAQPAPPTAAAIESGSATITNHAAHFSAVLAGAALDPWPRAAPRLPVAAYAALYTSCLGAPSGAHFVVHQHDHPVAGTHYDLRLQINGASSASWAVMYGLPGDPGSARLGRNATETRVHCLWNHLVETASRATGSLLVWDTGTYEVLGRRSKSAPEIDPDSERSEDGAEDGRTEQEKLRDAFAERKIREEDREGREKASRSASRAAPQRRRRRMIHKQEVIVETSEEIDSSSSEKEEDEELDDDVLDAREVVSEEESKPLTGPANLSQAMRQEVEELEDAQVRATNAYPGAKNTIGSVHQRRWYLSMDRAASGFVKKRRGGGVKKLFLELEDEQSRGRRHSDIPFYVHGPEVERSLITGVSVVTFSVTRRRGLRRPQGLAPRTALSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.6
3 0.57
4 0.54
5 0.48
6 0.46
7 0.49
8 0.48
9 0.54
10 0.54
11 0.53
12 0.52
13 0.55
14 0.54
15 0.47
16 0.43
17 0.33
18 0.3
19 0.27
20 0.23
21 0.16
22 0.14
23 0.18
24 0.2
25 0.24
26 0.23
27 0.24
28 0.24
29 0.31
30 0.32
31 0.29
32 0.3
33 0.26
34 0.25
35 0.25
36 0.24
37 0.17
38 0.12
39 0.11
40 0.09
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.1
50 0.09
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.09
63 0.09
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.1
79 0.13
80 0.18
81 0.21
82 0.26
83 0.26
84 0.26
85 0.27
86 0.26
87 0.23
88 0.18
89 0.15
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.08
100 0.11
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.12
105 0.15
106 0.17
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.16
111 0.16
112 0.16
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.12
121 0.13
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.06
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.07
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.12
147 0.14
148 0.14
149 0.19
150 0.19
151 0.19
152 0.23
153 0.24
154 0.27
155 0.28
156 0.28
157 0.24
158 0.27
159 0.27
160 0.23
161 0.23
162 0.17
163 0.16
164 0.15
165 0.17
166 0.14
167 0.11
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.09
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.1
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.2
191 0.23
192 0.21
193 0.22
194 0.26
195 0.24
196 0.25
197 0.26
198 0.25
199 0.21
200 0.19
201 0.16
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.12
214 0.16
215 0.16
216 0.17
217 0.17
218 0.19
219 0.24
220 0.3
221 0.36
222 0.32
223 0.34
224 0.36
225 0.37
226 0.37
227 0.37
228 0.38
229 0.36
230 0.43
231 0.4
232 0.4
233 0.42
234 0.41
235 0.38
236 0.38
237 0.34
238 0.31
239 0.35
240 0.35
241 0.37
242 0.44
243 0.5
244 0.52
245 0.6
246 0.67
247 0.71
248 0.76
249 0.77
250 0.79
251 0.81
252 0.82
253 0.83
254 0.78
255 0.71
256 0.7
257 0.64
258 0.55
259 0.44
260 0.33
261 0.22
262 0.17
263 0.14
264 0.09
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.1
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.09
292 0.09
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.14
301 0.14
302 0.19
303 0.2
304 0.2
305 0.2
306 0.21
307 0.23
308 0.21
309 0.18
310 0.15
311 0.14
312 0.16
313 0.15
314 0.13
315 0.12
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.11
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.15
326 0.15
327 0.15
328 0.2
329 0.19
330 0.19
331 0.18
332 0.2
333 0.2
334 0.27
335 0.33
336 0.34
337 0.39
338 0.41
339 0.41
340 0.41
341 0.43
342 0.4
343 0.39
344 0.4
345 0.37
346 0.36
347 0.35
348 0.33
349 0.3
350 0.3
351 0.31
352 0.29
353 0.36
354 0.36
355 0.4
356 0.48
357 0.55
358 0.57
359 0.61
360 0.66
361 0.65
362 0.65
363 0.63
364 0.55
365 0.46
366 0.44
367 0.35
368 0.32
369 0.27
370 0.26
371 0.25
372 0.3
373 0.32
374 0.29
375 0.3
376 0.26
377 0.29
378 0.38
379 0.46
380 0.46
381 0.49
382 0.5
383 0.49
384 0.47
385 0.43
386 0.35
387 0.29
388 0.25
389 0.22
390 0.19
391 0.17
392 0.16
393 0.16
394 0.15
395 0.11
396 0.1
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.1
404 0.18
405 0.2
406 0.24
407 0.32
408 0.4
409 0.48
410 0.58
411 0.68
412 0.69
413 0.73
414 0.77
415 0.81
416 0.77
417 0.73
418 0.67