Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SMD0

Protein Details
Accession C9SMD0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-66LTEKKATRDGQPPKRRGPKPDSKPAMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-69KKATRDGQPPKRRGPKPDSKPAMTRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004827  bZIP  
IPR046347  bZIP_sf  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
KEGG val:VDBG_06054  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50217  BZIP  
CDD cd14688  bZIP_YAP  
Amino Acid Sequences MSSSLPSDQQGNPSSRHARSSSAEQDNGPLSNLNLGFLKGLTEKKATRDGQPPKRRGPKPDSKPAMTRRQELNRQAQRTHRERKELYIKALEDEVLRLKEVFSNMSQDKDKVAEENKQLRQLLTQHGIPLSSVGLDDSVSNPSGGYTASASPSGYSHTHGSRSIFTPPLTSKSTTASVSPSYAPNSGSSHGNTPSGQQQQQYPQHGTSQHLQGQYGFPCEDGVNGSRIRQLRGTVRPMATWELSKADLGTLLALSKRLNLDGEITPVMAWGMVMAHSRFYEMKAEDFAKLTEELSTKIRCYGFGAVLEEFEIRDALENVMGAYP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.43
3 0.47
4 0.42
5 0.42
6 0.43
7 0.49
8 0.51
9 0.5
10 0.5
11 0.45
12 0.46
13 0.43
14 0.39
15 0.31
16 0.22
17 0.16
18 0.19
19 0.19
20 0.17
21 0.15
22 0.15
23 0.14
24 0.13
25 0.15
26 0.13
27 0.16
28 0.18
29 0.23
30 0.25
31 0.28
32 0.38
33 0.37
34 0.41
35 0.48
36 0.56
37 0.61
38 0.69
39 0.72
40 0.74
41 0.82
42 0.81
43 0.8
44 0.79
45 0.79
46 0.78
47 0.82
48 0.8
49 0.74
50 0.78
51 0.77
52 0.78
53 0.71
54 0.68
55 0.66
56 0.68
57 0.71
58 0.7
59 0.73
60 0.7
61 0.7
62 0.68
63 0.67
64 0.67
65 0.67
66 0.7
67 0.65
68 0.66
69 0.63
70 0.68
71 0.7
72 0.65
73 0.61
74 0.57
75 0.51
76 0.44
77 0.42
78 0.34
79 0.24
80 0.21
81 0.2
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.14
88 0.14
89 0.12
90 0.18
91 0.18
92 0.21
93 0.22
94 0.2
95 0.21
96 0.2
97 0.2
98 0.17
99 0.19
100 0.22
101 0.28
102 0.36
103 0.38
104 0.41
105 0.41
106 0.38
107 0.38
108 0.35
109 0.33
110 0.27
111 0.25
112 0.21
113 0.21
114 0.2
115 0.17
116 0.15
117 0.09
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.12
144 0.13
145 0.15
146 0.16
147 0.17
148 0.16
149 0.17
150 0.18
151 0.17
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.2
156 0.2
157 0.2
158 0.18
159 0.19
160 0.21
161 0.19
162 0.19
163 0.17
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.13
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.21
182 0.24
183 0.24
184 0.22
185 0.25
186 0.32
187 0.38
188 0.41
189 0.36
190 0.32
191 0.35
192 0.35
193 0.35
194 0.3
195 0.29
196 0.29
197 0.27
198 0.27
199 0.24
200 0.26
201 0.24
202 0.22
203 0.17
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.12
212 0.13
213 0.17
214 0.18
215 0.2
216 0.19
217 0.22
218 0.27
219 0.33
220 0.38
221 0.39
222 0.39
223 0.37
224 0.38
225 0.37
226 0.31
227 0.26
228 0.22
229 0.18
230 0.17
231 0.17
232 0.15
233 0.11
234 0.1
235 0.09
236 0.08
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.15
248 0.16
249 0.19
250 0.17
251 0.16
252 0.14
253 0.14
254 0.13
255 0.09
256 0.07
257 0.04
258 0.04
259 0.05
260 0.08
261 0.08
262 0.1
263 0.1
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.2
268 0.18
269 0.2
270 0.23
271 0.25
272 0.24
273 0.25
274 0.24
275 0.2
276 0.19
277 0.17
278 0.16
279 0.16
280 0.17
281 0.21
282 0.23
283 0.21
284 0.26
285 0.26
286 0.23
287 0.26
288 0.29
289 0.27
290 0.28
291 0.3
292 0.25
293 0.25
294 0.25
295 0.21
296 0.16
297 0.13
298 0.1
299 0.07
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1