FuNGI

C9SBI1

Protein Details

Accession

C9SBI1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-40	VEPAAKRSKSQSNKARQHQNSHIDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
KEGG	val:VDBG_01824 -
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MASKRDYADSASDNSVEPAAKRSKSQSNKARQHQNSHIDPTWGQKYVFGNHDGATTVPVDPELDFEDDGDAMAYLKSVRQEANGIPHLLVAPKIPIGPQLPTDFQHWTSDDEPKEGEEDRHMDRGLYDEGTGDFRGRYVDGAYIGAPESWDEDAAYGDDEDGAACDGDAAEQDEDDASDAAIHEAYFASLLSHYSALRTLLHSKPPEEAVQNLSRTHSPFVGHFGPRSATFKIWDHRLRTADPSPVQVASMDKDSVLRVLRVLLSGSFLRRGGEIAERTSRWVWALLARLPDRGELNHVEMSWIRDLGRRAVLMNQSLADMANLREALEGDLGVHDAIDDSSDDDAVLEDMEVDENDGEVVDAGDAGDAEDATADQDDQAIHRREGRGTEQTEQGETDDGDNNKVPESEPLEPAAEPRVEPRRKDTKDDDVQSEPMDCSEDGEASEEQVPRDPQAPRSEAENPESLEAMRSRILAELDTVEVQGAEEEATEIQAAEDRWRARTNMRATLNMILTVAGDFYGQRDLLEFREPFTGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.25
3	0.2
4	0.18
5	0.21
6	0.26
7	0.27
8	0.3
9	0.36
10	0.45
11	0.53
12	0.63
13	0.66
14	0.7
15	0.78
16	0.84
17	0.88
18	0.85
19	0.85
20	0.84
21	0.83
22	0.79
23	0.76
24	0.69
25	0.61
26	0.55
27	0.53
28	0.49
29	0.42
30	0.36
31	0.32
32	0.34
33	0.36
34	0.39
35	0.35
36	0.31
37	0.29
38	0.3
39	0.25
40	0.22
41	0.18
42	0.15
43	0.12
44	0.1
45	0.1
46	0.1
47	0.09
48	0.11
49	0.12
50	0.13
51	0.12
52	0.12
53	0.13
54	0.12
55	0.12
56	0.1
57	0.07
58	0.06
59	0.06
60	0.06
61	0.05
62	0.07
63	0.09
64	0.11
65	0.12
66	0.13
67	0.17
68	0.2
69	0.28
70	0.3
71	0.29
72	0.27
73	0.26
74	0.25
75	0.22
76	0.2
77	0.13
78	0.1
79	0.1
80	0.11
81	0.1
82	0.14
83	0.15
84	0.17
85	0.19
86	0.22
87	0.23
88	0.24
89	0.27
90	0.26
91	0.26
92	0.28
93	0.25
94	0.26
95	0.26
96	0.32
97	0.3
98	0.28
99	0.27
100	0.24
101	0.25
102	0.22
103	0.21
104	0.17
105	0.2
106	0.21
107	0.25
108	0.24
109	0.22
110	0.2
111	0.23
112	0.21
113	0.17
114	0.14
115	0.12
116	0.12
117	0.14
118	0.15
119	0.12
120	0.1
121	0.09
122	0.11
123	0.1
124	0.1
125	0.09
126	0.1
127	0.1
128	0.11
129	0.1
130	0.1
131	0.1
132	0.09
133	0.08
134	0.07
135	0.08
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.06
140	0.07
141	0.07
142	0.08
143	0.06
144	0.05
145	0.05
146	0.05
147	0.05
148	0.04
149	0.04
150	0.04
151	0.03
152	0.03
153	0.03
154	0.03
155	0.04
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.05
162	0.06
163	0.06
164	0.04
165	0.04
166	0.04
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.04
171	0.04
172	0.04
173	0.04
174	0.04
175	0.04
176	0.04
177	0.05
178	0.06
179	0.07
180	0.07
181	0.07
182	0.08
183	0.08
184	0.09
185	0.11
186	0.15
187	0.17
188	0.24
189	0.25
190	0.25
191	0.26
192	0.27
193	0.27
194	0.23
195	0.22
196	0.21
197	0.24
198	0.24
199	0.23
200	0.23
201	0.22
202	0.23
203	0.22
204	0.19
205	0.15
206	0.14
207	0.19
208	0.21
209	0.2
210	0.19
211	0.19
212	0.19
213	0.19
214	0.22
215	0.18
216	0.14
217	0.16
218	0.2
219	0.22
220	0.29
221	0.32
222	0.32
223	0.35
224	0.37
225	0.36
226	0.38
227	0.37
228	0.34
229	0.3
230	0.29
231	0.25
232	0.23
233	0.21
234	0.16
235	0.15
236	0.1
237	0.11
238	0.09
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.1
243	0.1
244	0.09
245	0.07
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.08
250	0.06
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.08
258	0.09
259	0.08
260	0.12
261	0.12
262	0.13
263	0.16
264	0.16
265	0.18
266	0.18
267	0.17
268	0.13
269	0.13
270	0.11
271	0.11
272	0.14
273	0.13
274	0.17
275	0.18
276	0.18
277	0.18
278	0.18
279	0.17
280	0.14
281	0.16
282	0.13
283	0.15
284	0.15
285	0.14
286	0.14
287	0.14
288	0.16
289	0.13
290	0.12
291	0.1
292	0.12
293	0.13
294	0.15
295	0.16
296	0.14
297	0.14
298	0.18
299	0.2
300	0.17
301	0.17
302	0.15
303	0.13
304	0.13
305	0.12
306	0.08
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.04
322	0.03
323	0.03
324	0.03
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.04
334	0.04
335	0.03
336	0.03
337	0.03
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.03
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.04
364	0.05
365	0.06
366	0.14
367	0.16
368	0.17
369	0.21
370	0.23
371	0.24
372	0.28
373	0.32
374	0.32
375	0.33
376	0.35
377	0.36
378	0.35
379	0.34
380	0.31
381	0.26
382	0.2
383	0.17
384	0.15
385	0.16
386	0.15
387	0.17
388	0.18
389	0.18
390	0.17
391	0.17
392	0.16
393	0.15
394	0.2
395	0.21
396	0.21
397	0.22
398	0.23
399	0.22
400	0.23
401	0.22
402	0.17
403	0.14
404	0.19
405	0.28
406	0.31
407	0.33
408	0.41
409	0.48
410	0.51
411	0.59
412	0.59
413	0.59
414	0.64
415	0.68
416	0.64
417	0.57
418	0.54
419	0.47
420	0.42
421	0.32
422	0.23
423	0.2
424	0.15
425	0.13
426	0.12
427	0.12
428	0.1
429	0.13
430	0.13
431	0.12
432	0.17
433	0.16
434	0.16
435	0.2
436	0.21
437	0.19
438	0.25
439	0.25
440	0.27
441	0.34
442	0.36
443	0.32
444	0.37
445	0.43
446	0.41
447	0.42
448	0.41
449	0.34
450	0.32
451	0.32
452	0.26
453	0.23
454	0.2
455	0.19
456	0.16
457	0.15
458	0.14
459	0.16
460	0.17
461	0.13
462	0.14
463	0.13
464	0.14
465	0.14
466	0.13
467	0.11
468	0.1
469	0.1
470	0.08
471	0.07
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.09
481	0.09
482	0.12
483	0.17
484	0.19
485	0.23
486	0.26
487	0.28
488	0.31
489	0.39
490	0.43
491	0.47
492	0.49
493	0.49
494	0.48
495	0.52
496	0.48
497	0.4
498	0.33
499	0.23
500	0.2
501	0.16
502	0.14
503	0.07
504	0.06
505	0.06
506	0.07
507	0.11
508	0.1
509	0.1
510	0.12
511	0.14
512	0.16
513	0.24
514	0.23
515	0.21

C9SBI1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer