Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHQ1

Protein Details
Accession C9SHQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
306-328NQGRRDNREREPREPKEPREPKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
300-327GRQRGGNQGRRDNREREPREPKEPREPK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11.333, nucl 10, cyto 8.5, cyto_mito 7.332, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045237  COPS7/eIF3m  
KEGG val:VDBG_04583  -  
Amino Acid Sequences MAAGSTTQNAQPQLLFVDGTFPELAGEMADYLHIADEVKPLLEDESKRDEALAKLVRSSSALTSVPEKEFTAASNLMIHLVMQSNEPKKHLPALCQAFSKPIATSPINGVGLSLNALTTVFNLIDPKNPIRFNVFSAILKFLKAHGMFDTIEPYLKHIPTWFDDWNTGEEYQRNMYVDISEVAAEAGQDGQSYEYLLKALRTFDADDKEELASEEAQELSLRAVKEALLSPTHLLFTDVRSIPSVQNLSETHPVCTKGLNEVLRKEEANAKAQKEREVQELERKLQGAGLEGGSGGGAGGRQRGGNQGRRDNREREPREPKEPREPKLRTDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.11
4 0.15
5 0.14
6 0.17
7 0.15
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.07
13 0.08
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.06
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.12
29 0.16
30 0.17
31 0.2
32 0.27
33 0.28
34 0.28
35 0.28
36 0.29
37 0.25
38 0.32
39 0.33
40 0.26
41 0.27
42 0.27
43 0.27
44 0.26
45 0.26
46 0.19
47 0.17
48 0.17
49 0.16
50 0.2
51 0.23
52 0.23
53 0.22
54 0.22
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.15
60 0.15
61 0.14
62 0.14
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.16
71 0.21
72 0.23
73 0.25
74 0.26
75 0.26
76 0.34
77 0.34
78 0.32
79 0.36
80 0.41
81 0.42
82 0.42
83 0.41
84 0.35
85 0.34
86 0.31
87 0.22
88 0.17
89 0.19
90 0.18
91 0.19
92 0.18
93 0.22
94 0.21
95 0.2
96 0.19
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.1
101 0.05
102 0.04
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.07
110 0.08
111 0.11
112 0.15
113 0.18
114 0.22
115 0.22
116 0.23
117 0.26
118 0.27
119 0.25
120 0.26
121 0.25
122 0.21
123 0.22
124 0.25
125 0.2
126 0.19
127 0.17
128 0.13
129 0.17
130 0.16
131 0.16
132 0.13
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.17
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.15
146 0.15
147 0.2
148 0.18
149 0.15
150 0.17
151 0.18
152 0.18
153 0.18
154 0.16
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.11
190 0.14
191 0.18
192 0.18
193 0.18
194 0.19
195 0.18
196 0.16
197 0.15
198 0.13
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.06
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.09
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.1
213 0.12
214 0.13
215 0.11
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.11
221 0.12
222 0.1
223 0.11
224 0.18
225 0.17
226 0.18
227 0.19
228 0.21
229 0.19
230 0.24
231 0.23
232 0.16
233 0.19
234 0.2
235 0.22
236 0.28
237 0.28
238 0.25
239 0.27
240 0.29
241 0.25
242 0.26
243 0.22
244 0.2
245 0.25
246 0.29
247 0.3
248 0.32
249 0.35
250 0.35
251 0.35
252 0.32
253 0.33
254 0.31
255 0.35
256 0.38
257 0.38
258 0.42
259 0.43
260 0.48
261 0.46
262 0.46
263 0.44
264 0.44
265 0.44
266 0.48
267 0.52
268 0.48
269 0.45
270 0.43
271 0.37
272 0.32
273 0.29
274 0.22
275 0.18
276 0.15
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.09
281 0.08
282 0.05
283 0.03
284 0.04
285 0.05
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.19
291 0.27
292 0.35
293 0.42
294 0.51
295 0.59
296 0.67
297 0.73
298 0.71
299 0.73
300 0.76
301 0.74
302 0.74
303 0.76
304 0.75
305 0.79
306 0.82
307 0.79
308 0.8
309 0.82
310 0.78
311 0.78
312 0.75
313 0.72
314 0.73