Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SPQ4

Protein Details
Accession C9SPQ4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-249ADENQKRRRREYRQAQRNRFKRPSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-248KRRRREYRQAQRNRFKRP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG val:VDBG_06879  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MPKSLANFGPQELETDISDSPPGQRVENFLCAVLGLLLNRKQDVKPGHYMRALEDAISSHKNQWPRAWEGKSPLSGGVTFNDMNNVQRLKILRALILWSLSASEAIKAIIIKSYKQNRHEDDMNQPLSVQPWGSDSDKRRYFLVEGLDDTAFRVYREGNPASFNRVWISVAGSIEELNALAEKLQTKDGGPKAKKLAQQMLAAVPRFEATEEVSYQARPAISFSAADENQKRRRREYRQAQRNRFKRPSPGFSLYEGRTRGKRVKYTYSDEEDGSFTDSTRRSTRNTGTHTPTELAGPLTTASGRQVRAPNRLEAEGTSSAAPSVQGDDPEDGGVNANGRPRRSAAVNYAGNGRARGSRSRGYSADETDDEGDLVEPDLGDDEEEADDHQPEESEEDDDDHVDEDEAMVEDDLEDRPRQELIVELKVKRPNPKDGATATNLTPSPEGKEEVRHEKPDDQKVPTPKSLQTERTPEPEIVALPGPTSLAFRGSPEKSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.19
3 0.18
4 0.15
5 0.16
6 0.14
7 0.15
8 0.2
9 0.2
10 0.2
11 0.22
12 0.27
13 0.31
14 0.36
15 0.34
16 0.28
17 0.27
18 0.24
19 0.23
20 0.18
21 0.13
22 0.09
23 0.13
24 0.17
25 0.19
26 0.21
27 0.24
28 0.23
29 0.3
30 0.36
31 0.37
32 0.44
33 0.48
34 0.53
35 0.53
36 0.54
37 0.48
38 0.48
39 0.42
40 0.32
41 0.27
42 0.22
43 0.22
44 0.25
45 0.24
46 0.22
47 0.26
48 0.31
49 0.34
50 0.39
51 0.4
52 0.45
53 0.53
54 0.52
55 0.53
56 0.54
57 0.57
58 0.53
59 0.48
60 0.41
61 0.34
62 0.3
63 0.27
64 0.21
65 0.19
66 0.17
67 0.16
68 0.18
69 0.17
70 0.17
71 0.21
72 0.21
73 0.17
74 0.2
75 0.22
76 0.22
77 0.27
78 0.27
79 0.22
80 0.22
81 0.24
82 0.22
83 0.21
84 0.18
85 0.12
86 0.12
87 0.1
88 0.1
89 0.08
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.11
97 0.12
98 0.14
99 0.23
100 0.33
101 0.39
102 0.46
103 0.54
104 0.55
105 0.61
106 0.64
107 0.58
108 0.56
109 0.58
110 0.52
111 0.43
112 0.38
113 0.32
114 0.28
115 0.25
116 0.17
117 0.08
118 0.09
119 0.12
120 0.15
121 0.21
122 0.25
123 0.34
124 0.38
125 0.39
126 0.38
127 0.37
128 0.36
129 0.34
130 0.34
131 0.26
132 0.23
133 0.24
134 0.23
135 0.2
136 0.19
137 0.17
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.12
143 0.19
144 0.2
145 0.2
146 0.23
147 0.24
148 0.3
149 0.29
150 0.26
151 0.21
152 0.2
153 0.2
154 0.16
155 0.18
156 0.13
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.06
170 0.07
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.17
175 0.22
176 0.3
177 0.3
178 0.34
179 0.39
180 0.44
181 0.47
182 0.45
183 0.47
184 0.42
185 0.42
186 0.38
187 0.37
188 0.34
189 0.31
190 0.25
191 0.18
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.08
196 0.07
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.11
203 0.11
204 0.09
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.13
212 0.13
213 0.17
214 0.2
215 0.26
216 0.35
217 0.42
218 0.43
219 0.45
220 0.54
221 0.6
222 0.66
223 0.71
224 0.73
225 0.76
226 0.85
227 0.88
228 0.88
229 0.86
230 0.85
231 0.8
232 0.72
233 0.71
234 0.67
235 0.62
236 0.6
237 0.59
238 0.51
239 0.47
240 0.5
241 0.41
242 0.39
243 0.35
244 0.29
245 0.26
246 0.28
247 0.32
248 0.32
249 0.37
250 0.37
251 0.44
252 0.47
253 0.52
254 0.54
255 0.52
256 0.49
257 0.43
258 0.39
259 0.3
260 0.25
261 0.21
262 0.15
263 0.1
264 0.12
265 0.13
266 0.15
267 0.19
268 0.2
269 0.21
270 0.27
271 0.33
272 0.37
273 0.43
274 0.46
275 0.48
276 0.48
277 0.46
278 0.41
279 0.35
280 0.28
281 0.22
282 0.16
283 0.1
284 0.09
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.1
291 0.11
292 0.15
293 0.21
294 0.25
295 0.33
296 0.35
297 0.36
298 0.36
299 0.36
300 0.32
301 0.26
302 0.27
303 0.2
304 0.19
305 0.15
306 0.13
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.06
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.1
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.08
324 0.13
325 0.15
326 0.16
327 0.17
328 0.18
329 0.21
330 0.23
331 0.25
332 0.26
333 0.32
334 0.33
335 0.32
336 0.33
337 0.33
338 0.31
339 0.27
340 0.23
341 0.18
342 0.2
343 0.24
344 0.26
345 0.29
346 0.33
347 0.37
348 0.37
349 0.39
350 0.39
351 0.37
352 0.35
353 0.3
354 0.28
355 0.24
356 0.23
357 0.17
358 0.14
359 0.12
360 0.08
361 0.08
362 0.06
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.06
370 0.05
371 0.06
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.07
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.08
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.09
401 0.09
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.11
406 0.11
407 0.16
408 0.19
409 0.27
410 0.32
411 0.33
412 0.39
413 0.46
414 0.5
415 0.54
416 0.54
417 0.54
418 0.56
419 0.58
420 0.58
421 0.56
422 0.58
423 0.53
424 0.51
425 0.41
426 0.4
427 0.36
428 0.31
429 0.29
430 0.23
431 0.23
432 0.23
433 0.25
434 0.21
435 0.29
436 0.34
437 0.42
438 0.48
439 0.48
440 0.5
441 0.55
442 0.62
443 0.65
444 0.64
445 0.61
446 0.63
447 0.67
448 0.7
449 0.68
450 0.64
451 0.58
452 0.6
453 0.61
454 0.61
455 0.59
456 0.61
457 0.59
458 0.61
459 0.59
460 0.51
461 0.46
462 0.4
463 0.33
464 0.28
465 0.25
466 0.2
467 0.16
468 0.16
469 0.14
470 0.12
471 0.14
472 0.11
473 0.12
474 0.12
475 0.15
476 0.23