Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S9F6

Protein Details
Accession C9S9F6    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-69RSELKTSTKKSSSKKKSKKEATPESPTLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-28K
48-59TKKSSSKKKSKK
316-330RRRKGKSGGVLRKER
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG val:VDBG_02128  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSKKSKKSKQEDPADAGDAVQEVADKKKRRMSRSHDDEDDRSELKTSTKKSSSKKKSKKEATPESPTLPSLHLGCTSRSIPPPNHDTHFSHKPSPSSCPSTPSAGLAPCTAAATQHLQPMVNRYVPVLGGVLLGFRNVAVSERPGREDAATSDSDVCKLGAIDEFAVGFGWVTADVDLFVPKRGAWMEGSINLESEGHVGVVCWGKFNASIESARLPPAWRWVHLGTDETAATSAYDDTVSNFTAEEQHGAVRQIHATGYWVDEAGQKVKGRVRFRIKAFDVGVSGDHGYLSLEGTMLDAAGEAEARQRDAQQELRRRKGKSGGVLRKERRYVPDFSITKFGEVENEEEKALAQEVWEHTEPAKDTTETAQDGEYAGLSHEAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.6
3 0.49
4 0.39
5 0.28
6 0.2
7 0.13
8 0.1
9 0.09
10 0.16
11 0.25
12 0.29
13 0.35
14 0.44
15 0.52
16 0.58
17 0.67
18 0.69
19 0.72
20 0.77
21 0.8
22 0.79
23 0.77
24 0.72
25 0.66
26 0.62
27 0.51
28 0.42
29 0.35
30 0.28
31 0.28
32 0.32
33 0.31
34 0.36
35 0.43
36 0.5
37 0.58
38 0.69
39 0.74
40 0.79
41 0.85
42 0.86
43 0.89
44 0.92
45 0.93
46 0.92
47 0.92
48 0.9
49 0.88
50 0.82
51 0.75
52 0.66
53 0.57
54 0.47
55 0.37
56 0.3
57 0.23
58 0.2
59 0.2
60 0.19
61 0.19
62 0.22
63 0.22
64 0.25
65 0.28
66 0.32
67 0.32
68 0.36
69 0.42
70 0.43
71 0.44
72 0.45
73 0.44
74 0.46
75 0.52
76 0.5
77 0.5
78 0.48
79 0.49
80 0.47
81 0.5
82 0.49
83 0.47
84 0.44
85 0.42
86 0.41
87 0.41
88 0.39
89 0.34
90 0.3
91 0.24
92 0.24
93 0.19
94 0.17
95 0.13
96 0.13
97 0.11
98 0.08
99 0.09
100 0.12
101 0.13
102 0.15
103 0.16
104 0.16
105 0.16
106 0.22
107 0.23
108 0.2
109 0.19
110 0.17
111 0.17
112 0.16
113 0.16
114 0.11
115 0.08
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.09
128 0.14
129 0.15
130 0.18
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.19
135 0.17
136 0.16
137 0.15
138 0.14
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.12
144 0.08
145 0.08
146 0.08
147 0.06
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.04
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.1
174 0.1
175 0.12
176 0.15
177 0.13
178 0.13
179 0.12
180 0.11
181 0.09
182 0.09
183 0.06
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.09
194 0.11
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.2
206 0.2
207 0.19
208 0.23
209 0.23
210 0.24
211 0.24
212 0.24
213 0.16
214 0.17
215 0.16
216 0.11
217 0.1
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.09
236 0.11
237 0.12
238 0.13
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.11
251 0.12
252 0.13
253 0.16
254 0.15
255 0.19
256 0.23
257 0.3
258 0.31
259 0.39
260 0.47
261 0.51
262 0.54
263 0.61
264 0.58
265 0.58
266 0.55
267 0.47
268 0.39
269 0.32
270 0.28
271 0.2
272 0.18
273 0.11
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.03
291 0.07
292 0.08
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.15
297 0.2
298 0.28
299 0.34
300 0.43
301 0.51
302 0.61
303 0.66
304 0.66
305 0.67
306 0.68
307 0.66
308 0.66
309 0.68
310 0.68
311 0.71
312 0.79
313 0.8
314 0.79
315 0.77
316 0.72
317 0.69
318 0.63
319 0.59
320 0.54
321 0.58
322 0.51
323 0.49
324 0.52
325 0.45
326 0.41
327 0.37
328 0.31
329 0.25
330 0.25
331 0.26
332 0.2
333 0.21
334 0.2
335 0.19
336 0.19
337 0.15
338 0.15
339 0.11
340 0.08
341 0.12
342 0.14
343 0.21
344 0.22
345 0.22
346 0.21
347 0.26
348 0.27
349 0.25
350 0.27
351 0.21
352 0.22
353 0.25
354 0.3
355 0.27
356 0.26
357 0.23
358 0.2
359 0.2
360 0.19
361 0.15
362 0.1
363 0.09