Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SLA5

Protein Details
Accession C9SLA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-35IDFTLRRQFKKQSFRPQQREIITHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, mito 7, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR004589  DNA_helicase_ATP-dep_RecQ  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR032284  RecQ_Zn-bd  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0004386  F:helicase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
KEGG val:VDBG_05582  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF16124  RecQ_Zn_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
CDD cd17920  DEXHc_RecQ  
Amino Acid Sequences MAPLSRSNSCVDIDFTLRRQFKKQSFRPQQREIITAALDGNDVFVQAATSFGKSLCFQLPACIDQGITIVVSPLLSLMMNQVEQLQAAGIKASSYNSNTRPEEKDRINRDLASGHPRTRLLYVTPELCSSESFRNRLKLVHQQCELARVAIDEAHCISEWGHDFRKDFKRLSWFRETFPTVPITCLTATANPLVRDDILMTLGLSATPERLKSFVMSAHRPNLHLEISREDLQRVQNMVSKGSRDGSNSDAQLRSLQRLALYCENTSLCRHAEICSYFGETAIPSCDYACDWHKDAQDLKRRLARGLASEEWVSTQAQHGEYDGDPYYDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.36
4 0.4
5 0.41
6 0.45
7 0.52
8 0.57
9 0.64
10 0.7
11 0.72
12 0.78
13 0.86
14 0.89
15 0.87
16 0.86
17 0.79
18 0.72
19 0.62
20 0.54
21 0.43
22 0.35
23 0.27
24 0.19
25 0.15
26 0.12
27 0.11
28 0.08
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.08
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.09
39 0.11
40 0.11
41 0.15
42 0.15
43 0.17
44 0.17
45 0.21
46 0.24
47 0.23
48 0.24
49 0.21
50 0.18
51 0.15
52 0.16
53 0.11
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.06
80 0.09
81 0.12
82 0.17
83 0.2
84 0.27
85 0.29
86 0.33
87 0.37
88 0.41
89 0.45
90 0.47
91 0.53
92 0.53
93 0.56
94 0.54
95 0.49
96 0.44
97 0.39
98 0.35
99 0.33
100 0.31
101 0.27
102 0.27
103 0.28
104 0.28
105 0.27
106 0.26
107 0.19
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.21
112 0.2
113 0.19
114 0.18
115 0.17
116 0.15
117 0.21
118 0.22
119 0.25
120 0.27
121 0.3
122 0.3
123 0.31
124 0.32
125 0.34
126 0.37
127 0.41
128 0.39
129 0.38
130 0.38
131 0.4
132 0.36
133 0.26
134 0.19
135 0.12
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.23
152 0.3
153 0.32
154 0.31
155 0.31
156 0.4
157 0.41
158 0.47
159 0.5
160 0.43
161 0.41
162 0.46
163 0.47
164 0.37
165 0.36
166 0.32
167 0.22
168 0.22
169 0.2
170 0.16
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.09
175 0.1
176 0.12
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.13
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.09
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.14
202 0.18
203 0.22
204 0.25
205 0.31
206 0.32
207 0.32
208 0.33
209 0.31
210 0.28
211 0.26
212 0.25
213 0.21
214 0.25
215 0.29
216 0.28
217 0.25
218 0.26
219 0.26
220 0.27
221 0.25
222 0.22
223 0.22
224 0.22
225 0.24
226 0.23
227 0.22
228 0.2
229 0.22
230 0.22
231 0.2
232 0.21
233 0.22
234 0.25
235 0.25
236 0.27
237 0.24
238 0.23
239 0.27
240 0.26
241 0.25
242 0.22
243 0.21
244 0.19
245 0.2
246 0.25
247 0.26
248 0.27
249 0.24
250 0.26
251 0.26
252 0.26
253 0.27
254 0.24
255 0.18
256 0.18
257 0.19
258 0.18
259 0.23
260 0.23
261 0.23
262 0.22
263 0.24
264 0.21
265 0.2
266 0.2
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.13
271 0.1
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.15
276 0.19
277 0.21
278 0.23
279 0.29
280 0.31
281 0.35
282 0.41
283 0.46
284 0.52
285 0.51
286 0.55
287 0.56
288 0.56
289 0.52
290 0.52
291 0.46
292 0.42
293 0.45
294 0.4
295 0.37
296 0.36
297 0.34
298 0.3
299 0.27
300 0.21
301 0.15
302 0.17
303 0.17
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.19
308 0.19
309 0.22
310 0.19