Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S8W0

Protein Details
Accession C9S8W0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-52GGGGHNRKRRYREDDEQDYRQQRRRHEPPPLPVRIRKQLBasic
272-295LGRGRCLWRRSRPWRSSRTPRSTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-23GGGGGGHNRKRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10.5, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
KEGG val:VDBG_00144  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MGDYDRRRNGGGGGGGGHNRKRRYREDDEQDYRQQRRRHEPPPLPVRIRKQLLNIAESPLRRWHEEVQSIAHIVADNVDDTELRENFIDLVLQLAVEQPLKTPFTAAVILFINTLRPEIVEDILGRLSIATETKIREGHWRDAKLLLKLFACLQSCLGGDGIFPILEELLGRALDLQTASSEDTIGTELVKIILLTIPYIMAAHPEQWQHKAAQLMGSTEIIASEPHPLQALIDPFIPEAEGAATGSASIISLLQRSYNPRLLMGGNWLACLGRGRCLWRRSRPWRSSRTPRSTTCQSLLFPKRPCWGHGPLSRSALSSVYARSGHSLLCPPAPDLRFFSGSGEALRGLDPTFLTLTAMPRLGSWPDVRLPLFRIQRLGRGAKPFLDWFAHHLSNFGFTWKWTEWVNDVFLPDIHPSKAFIRGALDKEIRLSFAQRIKNTLPEEYQSLISPDTEKDVPDFKFSDETTPFSAEGRELAALLKRKVPDEEFQPVLDRIHAAATEHSLDALVTSTDVFVTAVCWVGSKSLSHVLACIERVKDRLLDIGAASEAARAQIITAVMAYWRAQPGVAISIIEKLLNYSILTPLSVIEWSLVYNHSEREGDALAEAHVFELVSNTVTKVTGRVRQIMTAPELDADAEASKELDKKAMRDLFTSLKDALSSWKAGIKDEMLDEPNSEERKAHLQRWGARWLRVFERKSAIEEAFLLDVKNTAQNPFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.33
4 0.37
5 0.38
6 0.43
7 0.49
8 0.54
9 0.6
10 0.65
11 0.69
12 0.74
13 0.77
14 0.81
15 0.81
16 0.8
17 0.8
18 0.8
19 0.78
20 0.75
21 0.7
22 0.68
23 0.71
24 0.74
25 0.74
26 0.76
27 0.77
28 0.8
29 0.85
30 0.86
31 0.82
32 0.81
33 0.8
34 0.79
35 0.76
36 0.69
37 0.65
38 0.64
39 0.6
40 0.58
41 0.51
42 0.46
43 0.46
44 0.42
45 0.39
46 0.39
47 0.38
48 0.35
49 0.37
50 0.39
51 0.43
52 0.48
53 0.47
54 0.44
55 0.42
56 0.4
57 0.36
58 0.29
59 0.21
60 0.15
61 0.14
62 0.1
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.09
68 0.15
69 0.14
70 0.14
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.14
76 0.07
77 0.09
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.14
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.16
92 0.18
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.16
97 0.15
98 0.15
99 0.13
100 0.11
101 0.12
102 0.09
103 0.08
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.13
112 0.1
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.11
119 0.13
120 0.16
121 0.18
122 0.19
123 0.27
124 0.32
125 0.4
126 0.45
127 0.45
128 0.44
129 0.49
130 0.52
131 0.48
132 0.45
133 0.38
134 0.3
135 0.29
136 0.29
137 0.28
138 0.25
139 0.21
140 0.19
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.15
145 0.1
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.05
186 0.06
187 0.05
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.11
192 0.15
193 0.17
194 0.2
195 0.22
196 0.2
197 0.22
198 0.23
199 0.21
200 0.21
201 0.19
202 0.18
203 0.17
204 0.17
205 0.14
206 0.11
207 0.11
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.09
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.13
218 0.14
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.11
223 0.11
224 0.11
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.04
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.08
243 0.14
244 0.18
245 0.23
246 0.23
247 0.22
248 0.24
249 0.23
250 0.22
251 0.21
252 0.19
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.12
257 0.12
258 0.15
259 0.11
260 0.11
261 0.13
262 0.18
263 0.25
264 0.32
265 0.4
266 0.45
267 0.56
268 0.62
269 0.72
270 0.76
271 0.78
272 0.81
273 0.82
274 0.85
275 0.85
276 0.84
277 0.79
278 0.73
279 0.72
280 0.68
281 0.63
282 0.54
283 0.46
284 0.37
285 0.4
286 0.44
287 0.43
288 0.39
289 0.39
290 0.42
291 0.41
292 0.43
293 0.39
294 0.38
295 0.4
296 0.42
297 0.43
298 0.4
299 0.42
300 0.4
301 0.34
302 0.29
303 0.21
304 0.17
305 0.14
306 0.12
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.13
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.16
320 0.17
321 0.17
322 0.17
323 0.19
324 0.2
325 0.19
326 0.2
327 0.16
328 0.16
329 0.14
330 0.12
331 0.1
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.1
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.13
355 0.13
356 0.13
357 0.16
358 0.21
359 0.23
360 0.22
361 0.25
362 0.24
363 0.28
364 0.32
365 0.32
366 0.29
367 0.3
368 0.3
369 0.27
370 0.28
371 0.24
372 0.21
373 0.19
374 0.16
375 0.15
376 0.19
377 0.19
378 0.17
379 0.18
380 0.16
381 0.17
382 0.17
383 0.14
384 0.09
385 0.08
386 0.13
387 0.13
388 0.14
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.16
393 0.18
394 0.14
395 0.14
396 0.13
397 0.12
398 0.12
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.11
404 0.12
405 0.18
406 0.16
407 0.15
408 0.17
409 0.21
410 0.22
411 0.26
412 0.26
413 0.2
414 0.22
415 0.22
416 0.2
417 0.17
418 0.17
419 0.16
420 0.22
421 0.28
422 0.26
423 0.31
424 0.3
425 0.36
426 0.36
427 0.33
428 0.28
429 0.24
430 0.25
431 0.22
432 0.22
433 0.16
434 0.15
435 0.13
436 0.12
437 0.12
438 0.1
439 0.12
440 0.11
441 0.11
442 0.12
443 0.17
444 0.17
445 0.19
446 0.2
447 0.17
448 0.2
449 0.2
450 0.24
451 0.21
452 0.23
453 0.22
454 0.22
455 0.21
456 0.18
457 0.18
458 0.13
459 0.12
460 0.1
461 0.08
462 0.07
463 0.08
464 0.11
465 0.15
466 0.16
467 0.19
468 0.19
469 0.2
470 0.23
471 0.25
472 0.25
473 0.26
474 0.3
475 0.28
476 0.27
477 0.29
478 0.27
479 0.24
480 0.21
481 0.16
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.09
486 0.08
487 0.1
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.08
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.05
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.06
508 0.06
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.1
513 0.15
514 0.16
515 0.16
516 0.16
517 0.17
518 0.18
519 0.19
520 0.2
521 0.16
522 0.16
523 0.18
524 0.19
525 0.18
526 0.17
527 0.19
528 0.16
529 0.15
530 0.14
531 0.13
532 0.12
533 0.11
534 0.1
535 0.07
536 0.07
537 0.06
538 0.06
539 0.04
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.06
545 0.06
546 0.06
547 0.07
548 0.08
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.09
553 0.1
554 0.11
555 0.12
556 0.12
557 0.1
558 0.09
559 0.11
560 0.12
561 0.12
562 0.1
563 0.08
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.08
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.1
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.08
576 0.07
577 0.06
578 0.07
579 0.08
580 0.09
581 0.1
582 0.11
583 0.12
584 0.13
585 0.14
586 0.13
587 0.15
588 0.15
589 0.13
590 0.13
591 0.12
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.07
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.06
600 0.06
601 0.07
602 0.07
603 0.08
604 0.09
605 0.09
606 0.1
607 0.13
608 0.18
609 0.24
610 0.27
611 0.34
612 0.35
613 0.37
614 0.4
615 0.39
616 0.37
617 0.32
618 0.28
619 0.22
620 0.2
621 0.17
622 0.15
623 0.12
624 0.09
625 0.07
626 0.07
627 0.07
628 0.09
629 0.12
630 0.12
631 0.18
632 0.2
633 0.22
634 0.31
635 0.37
636 0.36
637 0.35
638 0.39
639 0.4
640 0.41
641 0.42
642 0.33
643 0.28
644 0.26
645 0.25
646 0.26
647 0.22
648 0.21
649 0.19
650 0.22
651 0.22
652 0.23
653 0.26
654 0.22
655 0.21
656 0.22
657 0.25
658 0.24
659 0.24
660 0.23
661 0.23
662 0.28
663 0.28
664 0.26
665 0.22
666 0.23
667 0.33
668 0.38
669 0.39
670 0.4
671 0.46
672 0.53
673 0.58
674 0.65
675 0.6
676 0.59
677 0.6
678 0.58
679 0.6
680 0.61
681 0.58
682 0.54
683 0.57
684 0.54
685 0.53
686 0.53
687 0.44
688 0.36
689 0.35
690 0.31
691 0.25
692 0.23
693 0.19
694 0.14
695 0.14
696 0.13
697 0.18
698 0.17