Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SKJ9

Protein Details
Accession C9SKJ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-232VQLLEKKKREYERLRDQKRRFELEMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 3, mito 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR033133  PUM-HD  
IPR033712  Pumilio_RNA-bd  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG val:VDBG_05326  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
CDD cd07920  Pumilio  
Amino Acid Sequences MSAFGHMRDGNERIPPVRSIGLRAAPPTLGLTGRSSRTTLGSASALPFVSLLGFRFLGSRARESPIITPNGPRPKTPPPPTRHSANAERKTTREETDKPLQTESERKRKFQEPFSDDLNEKKMDDLRFRSQQSPRNEATMNNLVSPPRNGNTRMPNPVQTHDLRTTLPRRFTTDSGRVPTLSSITSLRSPMAGPDPSQYENSYSNSQVQLLEKKKREYERLRDQKRRFELEMQKLEQVQRREEMELLKMQDDLQRAGHQSEPTTPPEYHDSSGFPSMFSRPNRYSTSSLTSPPGLFGRPGRSGSNLASPQSGIMQQSARMAFDEHHLPSRSVPASRRNSDEDEKEEAVRQDPSSHRSSNALPTPKNLESRFMADKEGRGSVDNSYNRYSMPVTRSRTGLYGADLDQTGTARFLFGEDDNAGDAKYVQALTDDQFPTLVRAEGQMLSASSAALDLALSPSPAPDASSSTNGWGHINRHRARQSLSSINAQLNGSSSADGSVIGSRPSSVRHSLDLKYFSENPSDSNSVVSPTSNGNMTTPPKLQSSFSANSVPTVKNALGANNHAQQHFHNHNASIGRIPAGAAPPRHSRELSSDSNIGSGQQSGNFPSIQSALHGNAAPFGPTNGLNGLNQNAAPFGGNNGNNQQTNGLNNVGQAGVSGPNGAGQNGISQGFNPYGNGPVNMYNPQNNGQLNGAYGVPLLAMQNLNLNGGSAYPPQNFTGYGSLYTPAIPAHSAPRDSQARVIQHRRQQDNDAMQRYQNLPLEHVGGQIYELCKDQHGCRYLQKKLEERNPDQVHMIWLETNQHVIELMTDPFGNYLCQKLLEYCNDDERTVLIQNAAQDMVRIALNQHGTRALQKMIEFVTTSIQVQMIIDALRYRVVELIQDLNGNHVIQKCLNKLSAPDAQFIFDAVGNHCVDVGTHRHGCCVLQRCIDHADGAQKVWLIGKITEHAPVLVQDPFGNYVVQYIIDLNEPAFTEPVVGMFRNRICQLSRHKFSSNVIEKLLRCSQAQGRDMIVDELLQPGEMDRLLRDSYANYVIQTALEYATPEGKHRMVEVIRPFLPAVRSTPYGRRIQAKVQAYDSRGSATSSGQITPADNTQGQIPLRPGQNRAMVNNASIVQPGAPLPSGFGNGSARNGAAQGKTLLPSSSFQHGDAATT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.31
4 0.33
5 0.31
6 0.31
7 0.35
8 0.37
9 0.37
10 0.37
11 0.35
12 0.3
13 0.29
14 0.26
15 0.21
16 0.17
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.26
21 0.27
22 0.27
23 0.26
24 0.28
25 0.28
26 0.24
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.21
31 0.21
32 0.19
33 0.17
34 0.15
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.15
44 0.2
45 0.23
46 0.27
47 0.27
48 0.32
49 0.33
50 0.34
51 0.39
52 0.4
53 0.42
54 0.38
55 0.4
56 0.45
57 0.54
58 0.53
59 0.49
60 0.48
61 0.53
62 0.62
63 0.67
64 0.68
65 0.65
66 0.72
67 0.75
68 0.75
69 0.72
70 0.69
71 0.7
72 0.71
73 0.72
74 0.72
75 0.7
76 0.66
77 0.65
78 0.62
79 0.56
80 0.53
81 0.5
82 0.5
83 0.57
84 0.61
85 0.56
86 0.54
87 0.51
88 0.48
89 0.53
90 0.54
91 0.55
92 0.53
93 0.54
94 0.59
95 0.65
96 0.68
97 0.67
98 0.68
99 0.63
100 0.63
101 0.64
102 0.63
103 0.55
104 0.52
105 0.47
106 0.38
107 0.31
108 0.3
109 0.31
110 0.31
111 0.38
112 0.4
113 0.44
114 0.5
115 0.54
116 0.59
117 0.61
118 0.64
119 0.64
120 0.65
121 0.58
122 0.56
123 0.53
124 0.45
125 0.46
126 0.46
127 0.39
128 0.33
129 0.33
130 0.29
131 0.31
132 0.33
133 0.3
134 0.25
135 0.29
136 0.31
137 0.37
138 0.46
139 0.5
140 0.55
141 0.54
142 0.58
143 0.57
144 0.57
145 0.55
146 0.48
147 0.47
148 0.43
149 0.41
150 0.34
151 0.39
152 0.43
153 0.44
154 0.48
155 0.43
156 0.47
157 0.5
158 0.52
159 0.53
160 0.55
161 0.55
162 0.54
163 0.53
164 0.47
165 0.43
166 0.4
167 0.33
168 0.24
169 0.19
170 0.15
171 0.16
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.16
176 0.15
177 0.17
178 0.21
179 0.2
180 0.19
181 0.21
182 0.25
183 0.26
184 0.28
185 0.26
186 0.23
187 0.25
188 0.28
189 0.27
190 0.25
191 0.27
192 0.26
193 0.26
194 0.25
195 0.26
196 0.31
197 0.35
198 0.43
199 0.45
200 0.49
201 0.56
202 0.61
203 0.67
204 0.68
205 0.71
206 0.73
207 0.78
208 0.83
209 0.86
210 0.86
211 0.85
212 0.83
213 0.8
214 0.73
215 0.72
216 0.71
217 0.71
218 0.73
219 0.65
220 0.6
221 0.56
222 0.57
223 0.52
224 0.46
225 0.39
226 0.34
227 0.34
228 0.33
229 0.32
230 0.29
231 0.27
232 0.27
233 0.26
234 0.23
235 0.21
236 0.2
237 0.21
238 0.21
239 0.19
240 0.17
241 0.18
242 0.2
243 0.21
244 0.24
245 0.22
246 0.21
247 0.26
248 0.27
249 0.28
250 0.3
251 0.28
252 0.28
253 0.32
254 0.34
255 0.29
256 0.27
257 0.25
258 0.24
259 0.29
260 0.26
261 0.21
262 0.19
263 0.21
264 0.27
265 0.28
266 0.32
267 0.3
268 0.36
269 0.4
270 0.43
271 0.43
272 0.41
273 0.45
274 0.4
275 0.39
276 0.36
277 0.34
278 0.29
279 0.28
280 0.25
281 0.18
282 0.18
283 0.19
284 0.22
285 0.23
286 0.25
287 0.25
288 0.26
289 0.28
290 0.28
291 0.33
292 0.3
293 0.27
294 0.25
295 0.24
296 0.21
297 0.2
298 0.19
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.16
304 0.16
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.12
309 0.15
310 0.18
311 0.16
312 0.21
313 0.22
314 0.22
315 0.22
316 0.28
317 0.27
318 0.26
319 0.29
320 0.33
321 0.4
322 0.43
323 0.46
324 0.45
325 0.49
326 0.5
327 0.5
328 0.45
329 0.42
330 0.4
331 0.36
332 0.35
333 0.3
334 0.26
335 0.24
336 0.2
337 0.2
338 0.22
339 0.26
340 0.28
341 0.28
342 0.27
343 0.28
344 0.3
345 0.32
346 0.36
347 0.38
348 0.34
349 0.35
350 0.41
351 0.41
352 0.45
353 0.38
354 0.35
355 0.3
356 0.35
357 0.36
358 0.3
359 0.3
360 0.25
361 0.27
362 0.25
363 0.25
364 0.2
365 0.17
366 0.18
367 0.17
368 0.24
369 0.24
370 0.25
371 0.26
372 0.26
373 0.24
374 0.25
375 0.24
376 0.2
377 0.23
378 0.28
379 0.31
380 0.32
381 0.34
382 0.33
383 0.32
384 0.3
385 0.25
386 0.19
387 0.16
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.12
392 0.1
393 0.1
394 0.09
395 0.07
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.05
400 0.07
401 0.07
402 0.09
403 0.08
404 0.09
405 0.09
406 0.09
407 0.09
408 0.07
409 0.07
410 0.04
411 0.06
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.14
418 0.14
419 0.13
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.14
424 0.13
425 0.07
426 0.08
427 0.09
428 0.09
429 0.1
430 0.08
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.07
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.05
450 0.09
451 0.11
452 0.13
453 0.14
454 0.15
455 0.16
456 0.16
457 0.17
458 0.16
459 0.17
460 0.21
461 0.3
462 0.3
463 0.37
464 0.39
465 0.4
466 0.41
467 0.42
468 0.41
469 0.38
470 0.39
471 0.35
472 0.34
473 0.31
474 0.3
475 0.25
476 0.2
477 0.15
478 0.14
479 0.11
480 0.09
481 0.08
482 0.07
483 0.07
484 0.07
485 0.06
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.07
492 0.09
493 0.12
494 0.14
495 0.15
496 0.18
497 0.22
498 0.24
499 0.27
500 0.28
501 0.26
502 0.26
503 0.25
504 0.23
505 0.22
506 0.21
507 0.18
508 0.19
509 0.2
510 0.16
511 0.16
512 0.15
513 0.13
514 0.13
515 0.12
516 0.09
517 0.08
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.08
522 0.11
523 0.13
524 0.15
525 0.16
526 0.17
527 0.18
528 0.19
529 0.19
530 0.18
531 0.23
532 0.21
533 0.22
534 0.23
535 0.21
536 0.22
537 0.24
538 0.21
539 0.15
540 0.16
541 0.14
542 0.14
543 0.14
544 0.14
545 0.13
546 0.15
547 0.17
548 0.2
549 0.21
550 0.18
551 0.19
552 0.17
553 0.23
554 0.24
555 0.23
556 0.2
557 0.19
558 0.21
559 0.21
560 0.21
561 0.15
562 0.12
563 0.1
564 0.09
565 0.09
566 0.07
567 0.09
568 0.11
569 0.11
570 0.14
571 0.19
572 0.22
573 0.23
574 0.23
575 0.22
576 0.25
577 0.3
578 0.29
579 0.27
580 0.26
581 0.24
582 0.24
583 0.23
584 0.18
585 0.11
586 0.1
587 0.07
588 0.07
589 0.08
590 0.08
591 0.1
592 0.09
593 0.09
594 0.09
595 0.09
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.08
600 0.09
601 0.1
602 0.09
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.07
607 0.07
608 0.07
609 0.06
610 0.07
611 0.07
612 0.08
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.09
617 0.09
618 0.08
619 0.07
620 0.06
621 0.06
622 0.05
623 0.06
624 0.1
625 0.11
626 0.12
627 0.15
628 0.17
629 0.17
630 0.18
631 0.17
632 0.13
633 0.14
634 0.14
635 0.13
636 0.1
637 0.1
638 0.1
639 0.09
640 0.08
641 0.06
642 0.06
643 0.05
644 0.05
645 0.05
646 0.04
647 0.07
648 0.07
649 0.07
650 0.06
651 0.06
652 0.07
653 0.08
654 0.08
655 0.06
656 0.06
657 0.08
658 0.09
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.1
663 0.11
664 0.11
665 0.11
666 0.12
667 0.14
668 0.16
669 0.17
670 0.16
671 0.17
672 0.2
673 0.22
674 0.2
675 0.19
676 0.17
677 0.16
678 0.14
679 0.13
680 0.1
681 0.07
682 0.07
683 0.05
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.04
688 0.04
689 0.05
690 0.07
691 0.07
692 0.08
693 0.07
694 0.07
695 0.06
696 0.07
697 0.08
698 0.08
699 0.11
700 0.11
701 0.13
702 0.14
703 0.14
704 0.14
705 0.14
706 0.15
707 0.13
708 0.13
709 0.12
710 0.12
711 0.11
712 0.11
713 0.1
714 0.07
715 0.07
716 0.06
717 0.07
718 0.11
719 0.13
720 0.15
721 0.15
722 0.22
723 0.24
724 0.25
725 0.29
726 0.29
727 0.32
728 0.38
729 0.46
730 0.46
731 0.49
732 0.57
733 0.56
734 0.54
735 0.53
736 0.52
737 0.53
738 0.54
739 0.52
740 0.44
741 0.41
742 0.41
743 0.38
744 0.35
745 0.3
746 0.23
747 0.2
748 0.2
749 0.23
750 0.2
751 0.19
752 0.15
753 0.11
754 0.11
755 0.11
756 0.1
757 0.08
758 0.09
759 0.08
760 0.1
761 0.12
762 0.14
763 0.19
764 0.22
765 0.23
766 0.3
767 0.37
768 0.41
769 0.46
770 0.5
771 0.5
772 0.56
773 0.62
774 0.63
775 0.6
776 0.65
777 0.61
778 0.56
779 0.5
780 0.42
781 0.36
782 0.27
783 0.24
784 0.14
785 0.12
786 0.13
787 0.12
788 0.13
789 0.1
790 0.1
791 0.09
792 0.09
793 0.09
794 0.08
795 0.08
796 0.08
797 0.08
798 0.08
799 0.08
800 0.08
801 0.08
802 0.07
803 0.09
804 0.08
805 0.09
806 0.1
807 0.13
808 0.17
809 0.2
810 0.24
811 0.23
812 0.3
813 0.31
814 0.3
815 0.27
816 0.24
817 0.22
818 0.19
819 0.18
820 0.11
821 0.11
822 0.12
823 0.13
824 0.12
825 0.09
826 0.08
827 0.08
828 0.09
829 0.08
830 0.07
831 0.06
832 0.1
833 0.14
834 0.14
835 0.15
836 0.16
837 0.16
838 0.19
839 0.21
840 0.18
841 0.17
842 0.17
843 0.18
844 0.17
845 0.18
846 0.15
847 0.13
848 0.14
849 0.13
850 0.13
851 0.11
852 0.11
853 0.1
854 0.09
855 0.09
856 0.07
857 0.06
858 0.06
859 0.06
860 0.07
861 0.08
862 0.08
863 0.09
864 0.09
865 0.09
866 0.1
867 0.11
868 0.14
869 0.13
870 0.14
871 0.14
872 0.15
873 0.16
874 0.15
875 0.15
876 0.14
877 0.15
878 0.17
879 0.22
880 0.23
881 0.25
882 0.26
883 0.25
884 0.25
885 0.28
886 0.32
887 0.29
888 0.29
889 0.26
890 0.26
891 0.25
892 0.24
893 0.19
894 0.14
895 0.13
896 0.11
897 0.15
898 0.14
899 0.14
900 0.13
901 0.12
902 0.11
903 0.12
904 0.16
905 0.18
906 0.23
907 0.23
908 0.24
909 0.25
910 0.26
911 0.3
912 0.34
913 0.33
914 0.34
915 0.34
916 0.36
917 0.39
918 0.38
919 0.32
920 0.26
921 0.26
922 0.21
923 0.21
924 0.2
925 0.16
926 0.16
927 0.16
928 0.16
929 0.13
930 0.13
931 0.14
932 0.16
933 0.16
934 0.19
935 0.17
936 0.16
937 0.14
938 0.14
939 0.15
940 0.13
941 0.13
942 0.11
943 0.12
944 0.14
945 0.14
946 0.13
947 0.11
948 0.11
949 0.11
950 0.1
951 0.09
952 0.08
953 0.08
954 0.09
955 0.09
956 0.08
957 0.09
958 0.09
959 0.1
960 0.09
961 0.08
962 0.09
963 0.08
964 0.1
965 0.11
966 0.11
967 0.11
968 0.16
969 0.18
970 0.22
971 0.24
972 0.25
973 0.25
974 0.32
975 0.42
976 0.47
977 0.52
978 0.52
979 0.53
980 0.54
981 0.56
982 0.59
983 0.56
984 0.48
985 0.45
986 0.45
987 0.43
988 0.47
989 0.48
990 0.4
991 0.32
992 0.35
993 0.38
994 0.41
995 0.42
996 0.37
997 0.33
998 0.32
999 0.33
1000 0.28
1001 0.22
1002 0.14
1003 0.12
1004 0.12
1005 0.1
1006 0.09
1007 0.08
1008 0.07
1009 0.08
1010 0.08
1011 0.09
1012 0.07
1013 0.11
1014 0.12
1015 0.12
1016 0.13
1017 0.13
1018 0.16
1019 0.2
1020 0.2
1021 0.17
1022 0.17
1023 0.17
1024 0.16
1025 0.16
1026 0.13
1027 0.09
1028 0.09
1029 0.09
1030 0.1
1031 0.15
1032 0.15
1033 0.17
1034 0.21
1035 0.21
1036 0.22
1037 0.22
1038 0.28
1039 0.25
1040 0.32
1041 0.36
1042 0.38
1043 0.37
1044 0.38
1045 0.37
1046 0.33
1047 0.34
1048 0.28
1049 0.26
1050 0.24
1051 0.27
1052 0.3
1053 0.37
1054 0.41
1055 0.46
1056 0.49
1057 0.53
1058 0.52
1059 0.56
1060 0.61
1061 0.61
1062 0.57
1063 0.57
1064 0.58
1065 0.53
1066 0.51
1067 0.44
1068 0.38
1069 0.31
1070 0.29
1071 0.23
1072 0.19
1073 0.21
1074 0.2
1075 0.2
1076 0.18
1077 0.19
1078 0.18
1079 0.2
1080 0.21
1081 0.2
1082 0.19
1083 0.19
1084 0.2
1085 0.25
1086 0.24
1087 0.25
1088 0.26
1089 0.28
1090 0.34
1091 0.37
1092 0.38
1093 0.39
1094 0.46
1095 0.46
1096 0.45
1097 0.46
1098 0.41
1099 0.38
1100 0.38
1101 0.32
1102 0.25
1103 0.22
1104 0.2
1105 0.13
1106 0.13
1107 0.12
1108 0.11
1109 0.11
1110 0.11
1111 0.12
1112 0.13
1113 0.16
1114 0.15
1115 0.17
1116 0.19
1117 0.2
1118 0.22
1119 0.22
1120 0.2
1121 0.18
1122 0.2
1123 0.2
1124 0.17
1125 0.18
1126 0.18
1127 0.19
1128 0.21
1129 0.22
1130 0.21
1131 0.19
1132 0.21
1133 0.22
1134 0.27
1135 0.26
1136 0.25
1137 0.28