Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SHC7

Protein Details
Accession C9SHC7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-295ETYVRTRKKGKHVMQKMSLKKDKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-19RKS
21-30EAFRSRRAAK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000048  IQ_motif_EF-hand-BS  
IPR044159  IQM  
Gene Ontology GO:0015629  C:actin cytoskeleton  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006996  P:organelle organization  
KEGG val:VDBG_03830  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50096  IQ  
Amino Acid Sequences MPRPTSEQSSLRSQPRRKSIEAFRSRRAAKVIQRSYRGYRSRRESKGLELAASTRWVAAIQEAQFRETTKPRAREAMAPETGEAPTMLSREDDGKHLRHRAPRRPTPAWSTARDMPPTPEPEVDANDSRSESSIESALEADRAAKYATPEVDDEKPHRKVMHVSASTIFNKMLRKSVRKNTWIFVADTNFRLYVGIKSSGAFQHSSFLQGSRISSAGLIKVKDGKIKSLSPLSGHYRPPTSNFRAFIRSLRESRVDVSHVSISKSYAVLVGLETYVRTRKKGKHVMQKMSLKKDKLVAPEAVARREEEERDKSESAAREREILEAEAAREQQEREENSAAVKLMRKLHIAPTDEDDDKDASTGNNAQPSPGERVDEGDVSTQGGTTARTRTAT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.74
3 0.76
4 0.72
5 0.73
6 0.74
7 0.75
8 0.79
9 0.76
10 0.73
11 0.75
12 0.72
13 0.67
14 0.62
15 0.6
16 0.58
17 0.62
18 0.65
19 0.64
20 0.68
21 0.7
22 0.72
23 0.73
24 0.73
25 0.69
26 0.68
27 0.7
28 0.74
29 0.74
30 0.75
31 0.68
32 0.66
33 0.69
34 0.61
35 0.52
36 0.43
37 0.38
38 0.32
39 0.3
40 0.22
41 0.13
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.11
46 0.14
47 0.15
48 0.22
49 0.22
50 0.23
51 0.24
52 0.26
53 0.29
54 0.29
55 0.37
56 0.39
57 0.44
58 0.45
59 0.51
60 0.52
61 0.53
62 0.55
63 0.54
64 0.48
65 0.43
66 0.41
67 0.35
68 0.33
69 0.26
70 0.19
71 0.11
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.09
77 0.12
78 0.13
79 0.17
80 0.2
81 0.25
82 0.31
83 0.38
84 0.42
85 0.49
86 0.57
87 0.62
88 0.68
89 0.73
90 0.76
91 0.73
92 0.73
93 0.71
94 0.71
95 0.67
96 0.6
97 0.57
98 0.54
99 0.53
100 0.5
101 0.44
102 0.38
103 0.38
104 0.38
105 0.34
106 0.28
107 0.25
108 0.25
109 0.26
110 0.27
111 0.24
112 0.21
113 0.2
114 0.2
115 0.18
116 0.17
117 0.16
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.11
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.16
138 0.18
139 0.2
140 0.23
141 0.27
142 0.29
143 0.3
144 0.3
145 0.28
146 0.3
147 0.34
148 0.4
149 0.33
150 0.32
151 0.32
152 0.36
153 0.35
154 0.31
155 0.25
156 0.17
157 0.19
158 0.18
159 0.23
160 0.25
161 0.31
162 0.38
163 0.47
164 0.52
165 0.56
166 0.58
167 0.52
168 0.53
169 0.48
170 0.42
171 0.34
172 0.29
173 0.24
174 0.23
175 0.22
176 0.16
177 0.14
178 0.13
179 0.11
180 0.1
181 0.1
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.12
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.12
205 0.11
206 0.11
207 0.16
208 0.17
209 0.21
210 0.21
211 0.21
212 0.23
213 0.24
214 0.26
215 0.25
216 0.25
217 0.22
218 0.26
219 0.29
220 0.3
221 0.31
222 0.3
223 0.29
224 0.29
225 0.33
226 0.37
227 0.37
228 0.37
229 0.37
230 0.37
231 0.38
232 0.39
233 0.38
234 0.37
235 0.36
236 0.33
237 0.34
238 0.34
239 0.31
240 0.32
241 0.3
242 0.25
243 0.2
244 0.21
245 0.22
246 0.2
247 0.2
248 0.18
249 0.17
250 0.16
251 0.15
252 0.13
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.13
263 0.14
264 0.17
265 0.24
266 0.31
267 0.42
268 0.53
269 0.6
270 0.65
271 0.74
272 0.8
273 0.82
274 0.84
275 0.81
276 0.8
277 0.78
278 0.68
279 0.61
280 0.58
281 0.53
282 0.49
283 0.46
284 0.37
285 0.34
286 0.4
287 0.4
288 0.37
289 0.33
290 0.28
291 0.26
292 0.28
293 0.29
294 0.28
295 0.31
296 0.32
297 0.37
298 0.37
299 0.35
300 0.38
301 0.4
302 0.38
303 0.38
304 0.35
305 0.33
306 0.33
307 0.34
308 0.3
309 0.25
310 0.22
311 0.17
312 0.18
313 0.16
314 0.16
315 0.16
316 0.16
317 0.15
318 0.18
319 0.24
320 0.25
321 0.28
322 0.3
323 0.28
324 0.28
325 0.29
326 0.25
327 0.22
328 0.23
329 0.23
330 0.27
331 0.29
332 0.31
333 0.31
334 0.39
335 0.43
336 0.42
337 0.4
338 0.39
339 0.42
340 0.41
341 0.39
342 0.33
343 0.27
344 0.24
345 0.21
346 0.17
347 0.11
348 0.14
349 0.19
350 0.2
351 0.25
352 0.25
353 0.25
354 0.27
355 0.31
356 0.34
357 0.3
358 0.3
359 0.24
360 0.28
361 0.3
362 0.29
363 0.26
364 0.22
365 0.2
366 0.19
367 0.18
368 0.14
369 0.12
370 0.11
371 0.12
372 0.13
373 0.17