Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SH05

Protein Details
Accession C9SH05    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
458-480TIKFDKLTYHKRKTKKGKAHEVFBasic
912-932LTSNSRTHHKRLKITRDVKGEHydrophilic
970-989VEFRSVKNRSRKPSAREQLPHydrophilic
994-1017TKPFKFPCKVLRRSLDKMKRQTVAHydrophilic
1072-1094FKNTMTLDRQPKRQRPSEPPVEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
468-475KRKTKKGK
1094-1106AASNKRHRHRNKH
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040240  TAF1  
IPR022591  TAF1_HAT_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0004402  F:histone acetyltransferase activity  
GO:0001091  F:RNA polymerase II general transcription initiation factor binding  
GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
KEGG val:VDBG_03708  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12157  DUF3591  
Amino Acid Sequences MSASEDVTPVNGDEMDIIVPDAAPVDAGDSKKEPESDVDWKAQRAADDENIQNLLAKAEEGQGIGINFNDDTPFDQTDKADNAEDYEDISDDDLPEEEEATGATSLSVPGLTDDGGTSNDTDDLFGDGPSSPIEPAADATSPRPHIHDPEDPESYRDLNFNTDPSSLATNQDPDIPLLPRFWRAYQEKAFRVPGPAATTRKQRLIAAELSNLVDCSVPDPEDEDGKEDVEIDFESDSETVGGFTLQDIDMVCDDWAVHIDHTEKEFETKVAAQTEAENVTGHKRAAVDDDQSDDDWDALFLKDDNAVQPRKKVRIPLPAGLPDISRFTAPSFDLFQEMTKRGAKRVVLDMNDPYLLLEETESQRGPKRQRTEKTLIRMASGHSKPDIFQRFNLSNDEAYEALKENHKHKVRATLGNLGVEHSMPALRLAWPYYKVKLDIRGHGYHRPNFRFNKHERQTIKFDKLTYHKRKTKKGKAHEVFQSTKDLGITDNCTAVLFEYCERTPPVLSNFGMGNRVINYYRKRQVDEEEVPPKMDVGESHVLHPEDRSPFAIFGEVKAGQTMPTLHNQMYRAPIFKHQPRSTDFLCVRSSTGVEGSKWYIHNIDHLYVVGQTFPSVEVPGPHSRKVTNASKNRIKMMSYRMMRRSPHSVVNLADITKHIAESTDAQNRQKLKEFLVYAKMDKGQWKLKPGETLMDEAGIRAMVKPEDVCLIDGMQLGMQILEDAGFDPNNVNLDEDNDDVEEEDDDRTAKGGKKAADKNEDKLADKMAPWKTSKAFIDACAGKAMLKLHGEGDPTGHGLGFSFIRTSMKGGYIETVQKGGSHTTAADAMAAHPDAMRKAYNGHAYNVKEQEVMYKKGIHEIWEKQKASLGDGSEKDDSLVVPPPADEDDRFNTHVSQTPAHVDEGASQITGLTSNSRTHHKRLKITRDVKGEDGTIEQRVVILDDPVIIDRYIKRRREKELDELKADPVVEFRSVKNRSRKPSAREQLPPPWNTKPFKFPCKVLRRSLDKMKRQTVATRAAANAKRLEEAKQAVAAATARLKLASQRPAKPAPPTPGLARTNSMPPSKVGGFKNTMTLDRQPKRQRPSEPPVEAASNKRHRHRNKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.08
4 0.08
5 0.07
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.08
13 0.12
14 0.13
15 0.16
16 0.18
17 0.21
18 0.24
19 0.25
20 0.24
21 0.24
22 0.3
23 0.34
24 0.36
25 0.42
26 0.42
27 0.42
28 0.44
29 0.41
30 0.36
31 0.32
32 0.32
33 0.3
34 0.33
35 0.34
36 0.34
37 0.33
38 0.31
39 0.3
40 0.25
41 0.19
42 0.13
43 0.12
44 0.1
45 0.12
46 0.13
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.09
58 0.11
59 0.15
60 0.18
61 0.18
62 0.2
63 0.2
64 0.25
65 0.27
66 0.27
67 0.24
68 0.22
69 0.23
70 0.23
71 0.21
72 0.17
73 0.16
74 0.14
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.09
79 0.1
80 0.09
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.05
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.08
122 0.1
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.15
127 0.21
128 0.24
129 0.24
130 0.27
131 0.28
132 0.32
133 0.37
134 0.41
135 0.42
136 0.45
137 0.5
138 0.46
139 0.45
140 0.42
141 0.37
142 0.31
143 0.26
144 0.21
145 0.21
146 0.22
147 0.22
148 0.22
149 0.21
150 0.21
151 0.2
152 0.23
153 0.18
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.2
158 0.22
159 0.21
160 0.18
161 0.21
162 0.2
163 0.19
164 0.2
165 0.21
166 0.23
167 0.25
168 0.26
169 0.31
170 0.34
171 0.41
172 0.47
173 0.54
174 0.53
175 0.55
176 0.57
177 0.49
178 0.49
179 0.41
180 0.36
181 0.33
182 0.36
183 0.36
184 0.37
185 0.45
186 0.46
187 0.49
188 0.48
189 0.44
190 0.42
191 0.42
192 0.43
193 0.37
194 0.34
195 0.31
196 0.29
197 0.27
198 0.23
199 0.18
200 0.12
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.14
215 0.12
216 0.1
217 0.1
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.08
246 0.1
247 0.12
248 0.14
249 0.16
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.15
254 0.16
255 0.16
256 0.18
257 0.17
258 0.18
259 0.16
260 0.16
261 0.18
262 0.16
263 0.15
264 0.12
265 0.11
266 0.14
267 0.16
268 0.15
269 0.14
270 0.13
271 0.14
272 0.18
273 0.2
274 0.2
275 0.19
276 0.22
277 0.21
278 0.21
279 0.21
280 0.16
281 0.13
282 0.1
283 0.1
284 0.08
285 0.06
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.11
292 0.17
293 0.22
294 0.23
295 0.3
296 0.35
297 0.4
298 0.42
299 0.47
300 0.48
301 0.54
302 0.58
303 0.56
304 0.55
305 0.53
306 0.52
307 0.44
308 0.38
309 0.28
310 0.25
311 0.2
312 0.15
313 0.12
314 0.11
315 0.13
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.15
322 0.16
323 0.18
324 0.19
325 0.2
326 0.23
327 0.23
328 0.24
329 0.28
330 0.27
331 0.26
332 0.33
333 0.35
334 0.32
335 0.33
336 0.33
337 0.3
338 0.28
339 0.24
340 0.17
341 0.12
342 0.1
343 0.08
344 0.07
345 0.08
346 0.1
347 0.12
348 0.12
349 0.13
350 0.18
351 0.25
352 0.31
353 0.36
354 0.44
355 0.52
356 0.58
357 0.66
358 0.7
359 0.7
360 0.71
361 0.69
362 0.6
363 0.52
364 0.46
365 0.39
366 0.4
367 0.34
368 0.28
369 0.22
370 0.22
371 0.21
372 0.29
373 0.34
374 0.27
375 0.28
376 0.33
377 0.34
378 0.35
379 0.38
380 0.31
381 0.24
382 0.23
383 0.23
384 0.16
385 0.14
386 0.13
387 0.11
388 0.11
389 0.15
390 0.17
391 0.18
392 0.27
393 0.32
394 0.33
395 0.34
396 0.43
397 0.44
398 0.49
399 0.49
400 0.47
401 0.44
402 0.43
403 0.41
404 0.32
405 0.26
406 0.19
407 0.16
408 0.08
409 0.07
410 0.05
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.07
415 0.09
416 0.11
417 0.14
418 0.16
419 0.18
420 0.19
421 0.21
422 0.22
423 0.3
424 0.31
425 0.34
426 0.37
427 0.4
428 0.41
429 0.46
430 0.5
431 0.46
432 0.51
433 0.49
434 0.51
435 0.51
436 0.53
437 0.54
438 0.55
439 0.6
440 0.57
441 0.61
442 0.57
443 0.57
444 0.62
445 0.6
446 0.6
447 0.51
448 0.47
449 0.44
450 0.48
451 0.54
452 0.55
453 0.58
454 0.59
455 0.64
456 0.73
457 0.79
458 0.82
459 0.81
460 0.81
461 0.83
462 0.8
463 0.79
464 0.76
465 0.71
466 0.63
467 0.54
468 0.48
469 0.36
470 0.32
471 0.25
472 0.19
473 0.13
474 0.12
475 0.13
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.1
480 0.09
481 0.09
482 0.08
483 0.06
484 0.06
485 0.09
486 0.09
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.11
491 0.13
492 0.15
493 0.16
494 0.16
495 0.16
496 0.16
497 0.15
498 0.16
499 0.14
500 0.12
501 0.09
502 0.11
503 0.1
504 0.15
505 0.18
506 0.24
507 0.31
508 0.32
509 0.34
510 0.34
511 0.37
512 0.4
513 0.4
514 0.4
515 0.38
516 0.36
517 0.34
518 0.32
519 0.28
520 0.19
521 0.15
522 0.09
523 0.1
524 0.16
525 0.16
526 0.17
527 0.19
528 0.19
529 0.19
530 0.19
531 0.17
532 0.13
533 0.13
534 0.14
535 0.12
536 0.12
537 0.12
538 0.15
539 0.11
540 0.1
541 0.12
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.08
547 0.08
548 0.1
549 0.08
550 0.1
551 0.12
552 0.12
553 0.15
554 0.16
555 0.17
556 0.19
557 0.19
558 0.18
559 0.18
560 0.22
561 0.26
562 0.32
563 0.4
564 0.38
565 0.41
566 0.42
567 0.46
568 0.42
569 0.44
570 0.39
571 0.32
572 0.31
573 0.28
574 0.25
575 0.2
576 0.2
577 0.12
578 0.14
579 0.11
580 0.1
581 0.11
582 0.12
583 0.14
584 0.14
585 0.14
586 0.13
587 0.12
588 0.16
589 0.15
590 0.15
591 0.13
592 0.12
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.07
597 0.05
598 0.05
599 0.04
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.05
604 0.06
605 0.11
606 0.19
607 0.21
608 0.22
609 0.23
610 0.23
611 0.25
612 0.31
613 0.35
614 0.37
615 0.42
616 0.5
617 0.55
618 0.57
619 0.58
620 0.52
621 0.45
622 0.4
623 0.39
624 0.39
625 0.37
626 0.41
627 0.43
628 0.46
629 0.46
630 0.45
631 0.46
632 0.4
633 0.41
634 0.37
635 0.34
636 0.3
637 0.32
638 0.29
639 0.22
640 0.19
641 0.14
642 0.13
643 0.11
644 0.11
645 0.07
646 0.06
647 0.07
648 0.1
649 0.15
650 0.21
651 0.23
652 0.24
653 0.28
654 0.3
655 0.31
656 0.35
657 0.31
658 0.26
659 0.3
660 0.31
661 0.3
662 0.34
663 0.33
664 0.28
665 0.28
666 0.27
667 0.23
668 0.25
669 0.27
670 0.27
671 0.28
672 0.33
673 0.35
674 0.36
675 0.38
676 0.35
677 0.35
678 0.29
679 0.29
680 0.23
681 0.2
682 0.18
683 0.14
684 0.13
685 0.08
686 0.07
687 0.05
688 0.07
689 0.05
690 0.06
691 0.06
692 0.07
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.09
697 0.09
698 0.09
699 0.09
700 0.09
701 0.07
702 0.06
703 0.06
704 0.05
705 0.04
706 0.03
707 0.03
708 0.03
709 0.03
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.05
714 0.05
715 0.06
716 0.07
717 0.07
718 0.08
719 0.07
720 0.09
721 0.11
722 0.11
723 0.11
724 0.09
725 0.09
726 0.09
727 0.09
728 0.07
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.1
736 0.13
737 0.16
738 0.2
739 0.24
740 0.32
741 0.39
742 0.46
743 0.52
744 0.52
745 0.51
746 0.55
747 0.53
748 0.46
749 0.41
750 0.36
751 0.28
752 0.26
753 0.3
754 0.27
755 0.29
756 0.29
757 0.32
758 0.31
759 0.35
760 0.35
761 0.33
762 0.29
763 0.26
764 0.32
765 0.29
766 0.28
767 0.24
768 0.23
769 0.17
770 0.18
771 0.18
772 0.13
773 0.13
774 0.13
775 0.13
776 0.15
777 0.16
778 0.14
779 0.14
780 0.12
781 0.12
782 0.12
783 0.1
784 0.08
785 0.07
786 0.08
787 0.07
788 0.07
789 0.07
790 0.07
791 0.09
792 0.09
793 0.11
794 0.11
795 0.13
796 0.13
797 0.13
798 0.14
799 0.16
800 0.19
801 0.18
802 0.17
803 0.15
804 0.15
805 0.16
806 0.15
807 0.13
808 0.11
809 0.1
810 0.1
811 0.11
812 0.1
813 0.09
814 0.08
815 0.08
816 0.09
817 0.09
818 0.08
819 0.07
820 0.09
821 0.09
822 0.11
823 0.11
824 0.1
825 0.12
826 0.17
827 0.25
828 0.26
829 0.28
830 0.32
831 0.35
832 0.4
833 0.4
834 0.36
835 0.28
836 0.26
837 0.32
838 0.31
839 0.32
840 0.28
841 0.3
842 0.29
843 0.35
844 0.36
845 0.31
846 0.33
847 0.37
848 0.45
849 0.5
850 0.51
851 0.45
852 0.48
853 0.44
854 0.41
855 0.36
856 0.28
857 0.25
858 0.26
859 0.3
860 0.27
861 0.26
862 0.23
863 0.2
864 0.18
865 0.14
866 0.17
867 0.13
868 0.13
869 0.12
870 0.14
871 0.16
872 0.17
873 0.16
874 0.16
875 0.21
876 0.25
877 0.27
878 0.26
879 0.25
880 0.25
881 0.29
882 0.28
883 0.24
884 0.22
885 0.25
886 0.25
887 0.25
888 0.23
889 0.18
890 0.17
891 0.18
892 0.17
893 0.12
894 0.1
895 0.1
896 0.09
897 0.1
898 0.08
899 0.08
900 0.1
901 0.14
902 0.17
903 0.26
904 0.31
905 0.38
906 0.47
907 0.52
908 0.6
909 0.66
910 0.74
911 0.77
912 0.8
913 0.8
914 0.8
915 0.75
916 0.68
917 0.6
918 0.5
919 0.4
920 0.36
921 0.3
922 0.23
923 0.19
924 0.16
925 0.14
926 0.13
927 0.13
928 0.1
929 0.09
930 0.07
931 0.08
932 0.09
933 0.09
934 0.1
935 0.09
936 0.11
937 0.16
938 0.26
939 0.34
940 0.41
941 0.5
942 0.56
943 0.65
944 0.73
945 0.74
946 0.75
947 0.77
948 0.76
949 0.7
950 0.65
951 0.56
952 0.48
953 0.43
954 0.32
955 0.23
956 0.18
957 0.18
958 0.18
959 0.19
960 0.26
961 0.32
962 0.4
963 0.49
964 0.55
965 0.6
966 0.7
967 0.76
968 0.74
969 0.79
970 0.81
971 0.79
972 0.79
973 0.77
974 0.77
975 0.77
976 0.73
977 0.67
978 0.66
979 0.65
980 0.63
981 0.6
982 0.6
983 0.61
984 0.68
985 0.67
986 0.66
987 0.69
988 0.73
989 0.77
990 0.75
991 0.76
992 0.74
993 0.77
994 0.81
995 0.8
996 0.8
997 0.82
998 0.8
999 0.76
1000 0.71
1001 0.7
1002 0.66
1003 0.64
1004 0.59
1005 0.53
1006 0.47
1007 0.52
1008 0.52
1009 0.49
1010 0.46
1011 0.39
1012 0.38
1013 0.36
1014 0.37
1015 0.35
1016 0.35
1017 0.33
1018 0.3
1019 0.29
1020 0.25
1021 0.26
1022 0.22
1023 0.18
1024 0.17
1025 0.16
1026 0.14
1027 0.14
1028 0.15
1029 0.2
1030 0.27
1031 0.34
1032 0.39
1033 0.45
1034 0.52
1035 0.59
1036 0.63
1037 0.64
1038 0.64
1039 0.62
1040 0.59
1041 0.56
1042 0.54
1043 0.56
1044 0.55
1045 0.5
1046 0.45
1047 0.41
1048 0.43
1049 0.46
1050 0.44
1051 0.36
1052 0.34
1053 0.38
1054 0.38
1055 0.42
1056 0.38
1057 0.4
1058 0.41
1059 0.41
1060 0.47
1061 0.43
1062 0.42
1063 0.39
1064 0.45
1065 0.48
1066 0.5
1067 0.6
1068 0.63
1069 0.69
1070 0.76
1071 0.8
1072 0.81
1073 0.8
1074 0.83
1075 0.84
1076 0.78
1077 0.73
1078 0.68
1079 0.65
1080 0.59
1081 0.56
1082 0.56
1083 0.55
1084 0.58
1085 0.64
1086 0.7