Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SVN0

Protein Details
Accession C9SVN0    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-46RQSPPFRCLRRTKGKGAPAVCHydrophilic
86-110VKPLDEAPKQRKKKVTSRPALKGLSHydrophilic
179-198FHNSNPRKRRRVGESKDRAABasic
207-228EDDGPGKRWKKKTLRGKGMSFVBasic
434-456DSDEEERKKKREKKKKLGASGVSBasic
659-680AVSEWNPRKKRQSYKLPHLWLFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
95-99QRKKK
186-189KRRR
212-222GKRWKKKTLRG
440-451RKKKREKKKKLG
Subcellular Location(s) mito 13.5, cyto_mito 11, cyto 7.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR022783  GCFC_dom  
IPR022159  STIP/TFIP11_N  
IPR045211  TFP11/STIP/Ntr1  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
KEGG val:VDBG_08955  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF07842  GCFC  
PF12457  TIP_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MCDRSCSAKEKQACFLRRPELGTAARQSPPFRCLRRTKGKGAPAVCLPAHASAHATLAHDNYMSRMTAWAENASQFNTAPSSLTDVKPLDEAPKQRKKKVTSRPALKGLSQRHLVYAPLLAQHTSDGAKESATMSAFPMFDPSRLTKKSAAAQYSSDSEEDNDDEFTTSIVDPAAGDDFHNSNPRKRRRVGESKDRAALGIFASDSEDDGPGKRWKKKTLRGKGMSFVSTGTMANAQDEKEYSDDSDRNGPPAAEDDDEEEEEEEAAGVGLGFRSATYGGLGFAPATKDEDTEMQGQDGTPYKPSFVKTKFDGRNPLGRGFVPSSARQPVLTNFEDDEKPKKPTIARPSAFAPSRDGKGNTSKPNPKSFGARMMAKMGYVEGTGLGKESQGRNVIIEANLRPQGVGLGAVKEKSVSERREEKRQAELRGEVVIDSDEEERKKKREKKKKLGASGVSSGTSTPRRQKTAFITAEEIKRTAPGLHIPDAFAPILDMTGPGNKLLTSASGLLTPTSAAAPESAEAIEARKIVRRAHADLAAFSEEWRSLEERKSWVELELRQHEQETADLAADLERMQVFAGIVTNELPVPPSGKTGSDVFKRPSMPLALPLWYPKARGGIRDWDVYDPAPLLAVLEAWNSLLPAFVRAQFLQDVVRKLETAVSEWNPRKKRQSYKLPHLWLFPWLQYLPSYHLDPKSTGLVADVRRKFRQLVDVWEFDRGVVPGLTQWRDVLGSQWQPLIMSHVLPSMGRYLRENFRVDPGDQEPYLPMLTGTLKWSSVLGSKVLAEVIVAEVFPLWHDKLGEWLQLEEVNLEEVYAWYEWWRDQVFPKELATLPVITKEFDKGSLTIERALERM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.67
3 0.65
4 0.6
5 0.6
6 0.54
7 0.53
8 0.5
9 0.51
10 0.48
11 0.46
12 0.46
13 0.46
14 0.46
15 0.42
16 0.45
17 0.47
18 0.47
19 0.52
20 0.58
21 0.65
22 0.72
23 0.76
24 0.79
25 0.79
26 0.81
27 0.8
28 0.73
29 0.67
30 0.6
31 0.58
32 0.48
33 0.4
34 0.34
35 0.3
36 0.28
37 0.23
38 0.21
39 0.16
40 0.18
41 0.18
42 0.17
43 0.15
44 0.16
45 0.16
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.12
52 0.13
53 0.15
54 0.17
55 0.19
56 0.2
57 0.2
58 0.22
59 0.23
60 0.23
61 0.21
62 0.18
63 0.18
64 0.17
65 0.15
66 0.13
67 0.12
68 0.18
69 0.2
70 0.21
71 0.25
72 0.24
73 0.25
74 0.25
75 0.26
76 0.24
77 0.26
78 0.34
79 0.4
80 0.49
81 0.56
82 0.62
83 0.7
84 0.73
85 0.78
86 0.8
87 0.81
88 0.82
89 0.84
90 0.85
91 0.85
92 0.79
93 0.74
94 0.71
95 0.67
96 0.63
97 0.58
98 0.5
99 0.44
100 0.42
101 0.37
102 0.3
103 0.25
104 0.19
105 0.17
106 0.18
107 0.15
108 0.14
109 0.14
110 0.15
111 0.13
112 0.12
113 0.12
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.11
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.18
126 0.17
127 0.17
128 0.21
129 0.24
130 0.29
131 0.31
132 0.35
133 0.34
134 0.38
135 0.45
136 0.48
137 0.47
138 0.41
139 0.41
140 0.4
141 0.38
142 0.35
143 0.28
144 0.21
145 0.18
146 0.18
147 0.17
148 0.15
149 0.13
150 0.11
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.11
166 0.13
167 0.22
168 0.23
169 0.29
170 0.39
171 0.49
172 0.54
173 0.59
174 0.65
175 0.67
176 0.76
177 0.78
178 0.8
179 0.8
180 0.77
181 0.75
182 0.67
183 0.57
184 0.46
185 0.37
186 0.26
187 0.17
188 0.12
189 0.08
190 0.09
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.13
198 0.2
199 0.27
200 0.35
201 0.4
202 0.5
203 0.6
204 0.69
205 0.75
206 0.79
207 0.83
208 0.83
209 0.81
210 0.77
211 0.71
212 0.62
213 0.51
214 0.4
215 0.3
216 0.23
217 0.19
218 0.13
219 0.11
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.15
231 0.16
232 0.17
233 0.25
234 0.24
235 0.24
236 0.25
237 0.23
238 0.19
239 0.21
240 0.21
241 0.13
242 0.13
243 0.14
244 0.16
245 0.16
246 0.16
247 0.13
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.07
252 0.04
253 0.04
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.02
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.05
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.13
279 0.15
280 0.15
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.14
285 0.15
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.15
290 0.17
291 0.19
292 0.25
293 0.26
294 0.3
295 0.3
296 0.41
297 0.44
298 0.47
299 0.53
300 0.48
301 0.53
302 0.51
303 0.49
304 0.41
305 0.35
306 0.34
307 0.28
308 0.28
309 0.23
310 0.21
311 0.23
312 0.24
313 0.24
314 0.21
315 0.21
316 0.2
317 0.23
318 0.22
319 0.2
320 0.18
321 0.21
322 0.22
323 0.22
324 0.24
325 0.21
326 0.24
327 0.23
328 0.26
329 0.27
330 0.34
331 0.42
332 0.48
333 0.46
334 0.45
335 0.47
336 0.5
337 0.47
338 0.4
339 0.34
340 0.27
341 0.28
342 0.28
343 0.27
344 0.23
345 0.3
346 0.36
347 0.38
348 0.43
349 0.49
350 0.51
351 0.56
352 0.57
353 0.5
354 0.49
355 0.44
356 0.44
357 0.4
358 0.38
359 0.32
360 0.31
361 0.3
362 0.23
363 0.22
364 0.14
365 0.1
366 0.08
367 0.07
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.08
375 0.08
376 0.1
377 0.12
378 0.13
379 0.13
380 0.13
381 0.14
382 0.12
383 0.14
384 0.12
385 0.13
386 0.14
387 0.13
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.08
392 0.09
393 0.06
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.11
401 0.17
402 0.17
403 0.22
404 0.32
405 0.35
406 0.45
407 0.49
408 0.47
409 0.5
410 0.54
411 0.51
412 0.44
413 0.42
414 0.33
415 0.29
416 0.27
417 0.17
418 0.12
419 0.09
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.08
424 0.09
425 0.12
426 0.14
427 0.19
428 0.28
429 0.36
430 0.46
431 0.56
432 0.66
433 0.75
434 0.83
435 0.87
436 0.86
437 0.85
438 0.78
439 0.71
440 0.63
441 0.53
442 0.42
443 0.33
444 0.25
445 0.2
446 0.19
447 0.18
448 0.23
449 0.26
450 0.3
451 0.31
452 0.36
453 0.39
454 0.46
455 0.45
456 0.38
457 0.38
458 0.38
459 0.39
460 0.35
461 0.29
462 0.19
463 0.17
464 0.16
465 0.13
466 0.1
467 0.12
468 0.15
469 0.17
470 0.17
471 0.18
472 0.17
473 0.18
474 0.17
475 0.12
476 0.09
477 0.06
478 0.06
479 0.05
480 0.05
481 0.04
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.07
492 0.07
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.05
500 0.05
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.07
511 0.08
512 0.08
513 0.11
514 0.14
515 0.15
516 0.21
517 0.24
518 0.27
519 0.3
520 0.33
521 0.3
522 0.28
523 0.29
524 0.24
525 0.19
526 0.15
527 0.13
528 0.1
529 0.09
530 0.11
531 0.1
532 0.11
533 0.15
534 0.18
535 0.2
536 0.22
537 0.24
538 0.23
539 0.24
540 0.25
541 0.25
542 0.29
543 0.32
544 0.33
545 0.31
546 0.31
547 0.29
548 0.26
549 0.22
550 0.16
551 0.11
552 0.09
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.06
566 0.05
567 0.06
568 0.06
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.08
575 0.08
576 0.1
577 0.1
578 0.11
579 0.13
580 0.16
581 0.21
582 0.24
583 0.28
584 0.29
585 0.32
586 0.33
587 0.31
588 0.31
589 0.29
590 0.25
591 0.25
592 0.24
593 0.22
594 0.21
595 0.22
596 0.24
597 0.22
598 0.22
599 0.19
600 0.25
601 0.24
602 0.27
603 0.29
604 0.32
605 0.35
606 0.37
607 0.37
608 0.3
609 0.31
610 0.28
611 0.25
612 0.16
613 0.13
614 0.1
615 0.08
616 0.07
617 0.05
618 0.05
619 0.05
620 0.05
621 0.05
622 0.05
623 0.05
624 0.05
625 0.05
626 0.06
627 0.05
628 0.07
629 0.09
630 0.11
631 0.14
632 0.14
633 0.16
634 0.16
635 0.17
636 0.19
637 0.22
638 0.22
639 0.21
640 0.22
641 0.2
642 0.2
643 0.22
644 0.18
645 0.16
646 0.19
647 0.2
648 0.29
649 0.34
650 0.43
651 0.45
652 0.51
653 0.58
654 0.62
655 0.69
656 0.71
657 0.76
658 0.78
659 0.83
660 0.88
661 0.86
662 0.79
663 0.72
664 0.62
665 0.55
666 0.47
667 0.37
668 0.31
669 0.23
670 0.22
671 0.2
672 0.2
673 0.21
674 0.21
675 0.24
676 0.24
677 0.27
678 0.28
679 0.28
680 0.29
681 0.27
682 0.24
683 0.21
684 0.18
685 0.21
686 0.24
687 0.33
688 0.36
689 0.39
690 0.41
691 0.44
692 0.44
693 0.42
694 0.46
695 0.4
696 0.44
697 0.44
698 0.46
699 0.45
700 0.45
701 0.41
702 0.32
703 0.3
704 0.21
705 0.16
706 0.12
707 0.11
708 0.12
709 0.18
710 0.19
711 0.18
712 0.18
713 0.17
714 0.18
715 0.18
716 0.17
717 0.19
718 0.21
719 0.22
720 0.22
721 0.21
722 0.21
723 0.21
724 0.23
725 0.17
726 0.14
727 0.13
728 0.14
729 0.14
730 0.14
731 0.15
732 0.16
733 0.18
734 0.18
735 0.21
736 0.26
737 0.32
738 0.38
739 0.41
740 0.36
741 0.41
742 0.43
743 0.41
744 0.4
745 0.37
746 0.37
747 0.33
748 0.32
749 0.26
750 0.24
751 0.23
752 0.18
753 0.14
754 0.1
755 0.12
756 0.13
757 0.15
758 0.14
759 0.15
760 0.15
761 0.15
762 0.15
763 0.17
764 0.17
765 0.16
766 0.15
767 0.15
768 0.16
769 0.15
770 0.13
771 0.09
772 0.08
773 0.08
774 0.07
775 0.06
776 0.06
777 0.06
778 0.06
779 0.07
780 0.1
781 0.1
782 0.11
783 0.12
784 0.13
785 0.2
786 0.23
787 0.26
788 0.23
789 0.23
790 0.23
791 0.23
792 0.24
793 0.17
794 0.14
795 0.12
796 0.11
797 0.1
798 0.09
799 0.08
800 0.1
801 0.09
802 0.09
803 0.09
804 0.11
805 0.11
806 0.17
807 0.18
808 0.19
809 0.26
810 0.35
811 0.39
812 0.4
813 0.4
814 0.39
815 0.38
816 0.38
817 0.34
818 0.27
819 0.24
820 0.27
821 0.27
822 0.23
823 0.23
824 0.24
825 0.23
826 0.23
827 0.25
828 0.19
829 0.23
830 0.28
831 0.28
832 0.29
833 0.3