Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4QX96

Protein Details
Accession C4QX96    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-32TGKGLKGVIRKRKLAKRNSNNSSVKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-23LKGVIRKRKLAKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 11, cyto_nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003618  TFIIS_cen_dom  
IPR036575  TFIIS_cen_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG ppa:PAS_chr1-4_0038  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07500  TFIIS_M  
Amino Acid Sequences MAKSPTTGKGLKGVIRKRKLAKRNSNNSSVKTDAELEIEVARVRSACSHKIEEALRTRITDAQKRLILKKENEGSLGGVSYDITGIATAYERELYSKHNRDLKNYRTTFRKNLIAIKNQDIAFILDLLNGRICIKSFVNYSVEDLLSVKQKSIHKKLNQENLKHAISKRILPETINEIKSSFVVEKWGVSKSASAIED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.6
3 0.67
4 0.7
5 0.75
6 0.79
7 0.81
8 0.83
9 0.83
10 0.87
11 0.86
12 0.86
13 0.82
14 0.76
15 0.71
16 0.62
17 0.52
18 0.43
19 0.39
20 0.29
21 0.25
22 0.21
23 0.16
24 0.14
25 0.14
26 0.12
27 0.1
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.13
32 0.17
33 0.21
34 0.25
35 0.28
36 0.29
37 0.34
38 0.35
39 0.36
40 0.38
41 0.37
42 0.33
43 0.31
44 0.31
45 0.32
46 0.35
47 0.36
48 0.33
49 0.35
50 0.37
51 0.4
52 0.43
53 0.45
54 0.46
55 0.42
56 0.46
57 0.44
58 0.42
59 0.4
60 0.36
61 0.3
62 0.23
63 0.2
64 0.12
65 0.07
66 0.06
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.11
82 0.19
83 0.24
84 0.28
85 0.34
86 0.35
87 0.42
88 0.5
89 0.51
90 0.53
91 0.51
92 0.5
93 0.5
94 0.54
95 0.52
96 0.49
97 0.47
98 0.39
99 0.45
100 0.47
101 0.47
102 0.46
103 0.44
104 0.44
105 0.38
106 0.36
107 0.29
108 0.24
109 0.17
110 0.15
111 0.11
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.09
121 0.1
122 0.12
123 0.13
124 0.16
125 0.18
126 0.18
127 0.19
128 0.19
129 0.18
130 0.15
131 0.14
132 0.13
133 0.17
134 0.16
135 0.15
136 0.19
137 0.25
138 0.34
139 0.42
140 0.5
141 0.51
142 0.61
143 0.7
144 0.74
145 0.77
146 0.71
147 0.7
148 0.67
149 0.62
150 0.57
151 0.49
152 0.47
153 0.42
154 0.43
155 0.41
156 0.4
157 0.39
158 0.35
159 0.37
160 0.37
161 0.42
162 0.38
163 0.33
164 0.28
165 0.28
166 0.27
167 0.27
168 0.2
169 0.13
170 0.16
171 0.17
172 0.19
173 0.21
174 0.23
175 0.2
176 0.2
177 0.21
178 0.18