Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SSD1

Protein Details
Accession C9SSD1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
538-565EEEMERRRKDWKPPKPHVRRGALAKYARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
543-558RRRKDWKPPKPHVRRG
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 11.833, cyto_pero 9.166, nucl 9, pero 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042096  Dihydro-acid_dehy_C  
IPR000581  DiOHA_6PGluconate_deHydtase  
IPR020558  DiOHA_6PGluconate_deHydtase_CS  
IPR037237  IlvD/EDD_N  
Gene Ontology GO:0016836  F:hydro-lyase activity  
GO:0019752  P:carboxylic acid metabolic process  
GO:0044238  P:primary metabolic process  
KEGG val:VDBG_07806  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00920  ILVD_EDD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00886  ILVD_EDD_1  
PS00887  ILVD_EDD_2  
Amino Acid Sequences MASNESKPVRATDAADQQDSPDYLQFESLPAGGKLNRWSQKITRGHDFPGAQAMLYGAGVPDRDTMKNAPHVGIATVWWEGNPCNTHLLDFGKIVKRGVEKQGFLGWQFNTIGVSDAITMGGEGMRFSLQTREIICDSIESVTCAQHHDANISIPGCDKNMPGVVMAAARHNRPFIMIYGGTIMKGHSELLESSINISTCYEASGAYTYGRLNAKCNPGEPGRTSSDVMEDIERHACPGAGACGVMHASASVRPEAIKIVMEKDLRPRKLMTRAAFENALVLTMILGGSTNGVLHFLAMANTADVPLTLDDVDRTSNRVPFLADLAPSGKHYMEDLYKVGGTPAVLKMLVAAQYIDGSIMTVTGRTLAENVADWPSLDPNQQIIRPLSNPIKATGHIRVLRGNLAPGGAVAKITGKEGLSFTGAARVFNKEHELDTALSSGSIKRDDGNLVVIVRYEGPRGGPGMPEQLRASAAIMGAGLTNVALVTDGRYSGASHGFIVGHVVPEAAVGGPIALVRDGDRVTIDAETNRIDMIDVDEEEMERRRKDWKPPKPHVRRGALAKYARLVGDASHGAVTDQADPSW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.4
4 0.36
5 0.38
6 0.35
7 0.29
8 0.22
9 0.2
10 0.19
11 0.2
12 0.19
13 0.15
14 0.16
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.16
19 0.16
20 0.19
21 0.24
22 0.32
23 0.38
24 0.38
25 0.44
26 0.46
27 0.55
28 0.61
29 0.61
30 0.61
31 0.58
32 0.58
33 0.59
34 0.54
35 0.45
36 0.44
37 0.38
38 0.28
39 0.25
40 0.21
41 0.15
42 0.14
43 0.13
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.1
49 0.13
50 0.14
51 0.17
52 0.2
53 0.24
54 0.32
55 0.33
56 0.3
57 0.29
58 0.29
59 0.26
60 0.24
61 0.19
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.1
68 0.15
69 0.16
70 0.16
71 0.19
72 0.19
73 0.2
74 0.21
75 0.24
76 0.2
77 0.2
78 0.25
79 0.28
80 0.29
81 0.29
82 0.3
83 0.32
84 0.35
85 0.43
86 0.43
87 0.38
88 0.39
89 0.44
90 0.41
91 0.37
92 0.36
93 0.27
94 0.23
95 0.23
96 0.2
97 0.16
98 0.15
99 0.15
100 0.1
101 0.11
102 0.08
103 0.08
104 0.07
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.1
116 0.11
117 0.14
118 0.16
119 0.19
120 0.2
121 0.2
122 0.2
123 0.16
124 0.16
125 0.15
126 0.14
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.12
131 0.14
132 0.14
133 0.15
134 0.16
135 0.15
136 0.16
137 0.15
138 0.18
139 0.16
140 0.15
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.12
147 0.14
148 0.14
149 0.12
150 0.12
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.14
155 0.15
156 0.16
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.17
162 0.13
163 0.16
164 0.15
165 0.14
166 0.16
167 0.16
168 0.15
169 0.14
170 0.13
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.05
175 0.06
176 0.07
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.08
189 0.06
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.12
197 0.15
198 0.15
199 0.16
200 0.21
201 0.27
202 0.27
203 0.28
204 0.28
205 0.27
206 0.31
207 0.31
208 0.3
209 0.27
210 0.28
211 0.28
212 0.24
213 0.23
214 0.2
215 0.18
216 0.15
217 0.12
218 0.11
219 0.13
220 0.12
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.24
251 0.31
252 0.31
253 0.32
254 0.32
255 0.33
256 0.41
257 0.47
258 0.4
259 0.38
260 0.39
261 0.39
262 0.37
263 0.32
264 0.24
265 0.17
266 0.14
267 0.08
268 0.06
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.02
273 0.02
274 0.02
275 0.02
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.05
299 0.07
300 0.06
301 0.1
302 0.11
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.15
309 0.13
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.1
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.1
326 0.1
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.09
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.04
344 0.04
345 0.03
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.11
365 0.1
366 0.12
367 0.15
368 0.15
369 0.18
370 0.18
371 0.19
372 0.19
373 0.24
374 0.26
375 0.27
376 0.27
377 0.26
378 0.27
379 0.25
380 0.28
381 0.27
382 0.3
383 0.29
384 0.29
385 0.29
386 0.29
387 0.31
388 0.27
389 0.24
390 0.17
391 0.14
392 0.13
393 0.1
394 0.1
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.07
399 0.07
400 0.08
401 0.09
402 0.08
403 0.1
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.11
408 0.1
409 0.16
410 0.16
411 0.15
412 0.16
413 0.19
414 0.18
415 0.2
416 0.23
417 0.18
418 0.18
419 0.19
420 0.2
421 0.17
422 0.18
423 0.17
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.13
433 0.15
434 0.15
435 0.16
436 0.16
437 0.15
438 0.14
439 0.13
440 0.12
441 0.13
442 0.12
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.11
447 0.13
448 0.13
449 0.13
450 0.14
451 0.22
452 0.22
453 0.24
454 0.24
455 0.23
456 0.23
457 0.22
458 0.21
459 0.13
460 0.12
461 0.09
462 0.08
463 0.07
464 0.07
465 0.06
466 0.05
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.05
474 0.06
475 0.06
476 0.07
477 0.08
478 0.09
479 0.11
480 0.14
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.14
485 0.13
486 0.16
487 0.13
488 0.11
489 0.1
490 0.1
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.05
495 0.05
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.09
505 0.1
506 0.1
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.14
511 0.15
512 0.13
513 0.15
514 0.15
515 0.15
516 0.14
517 0.13
518 0.12
519 0.1
520 0.13
521 0.14
522 0.13
523 0.13
524 0.14
525 0.14
526 0.16
527 0.22
528 0.23
529 0.21
530 0.22
531 0.29
532 0.35
533 0.46
534 0.55
535 0.6
536 0.67
537 0.77
538 0.87
539 0.9
540 0.94
541 0.93
542 0.9
543 0.87
544 0.85
545 0.83
546 0.81
547 0.74
548 0.67
549 0.6
550 0.54
551 0.46
552 0.38
553 0.29
554 0.21
555 0.22
556 0.2
557 0.18
558 0.16
559 0.16
560 0.15
561 0.16
562 0.17
563 0.14