Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S7N0

Protein Details
Accession C9S7N0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-315AEETRRKREEWEANQRRRAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-314RREEEDKAAKAELERRKAEETRRKREEWEANQRRRA
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, cyto 5, cysk 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG val:VDBG_01356  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MDEFIDARFERVEKALASLVESVSKYHPYAKQALDLQEADKELSRGLELVQQHQNNHLRLQELRTTSSALDAQIRETLSTLASTRRDITTTHITVHGDEDHYPIKYEELLNYARRISKTTLPPAGVTNGVMFEPATSEDPPAGAVTNGVQSAVTSAAPTPSGAPTPGAPTPGAQTPAAPTPTPQQLPDPSGLNGAPSQPPEQPGAAPGDNPSGAPLGITTALPSGLRDHLDANHGTIFLPWPNEYQIGGGALAACQDLSERGIDPRGYDPVAVAAEAKRREEEDKAAKAELERRKAEETRRKREEWEANQRRRAAEAAQKPEPSATSPAPRRGQECAVPVY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.2
4 0.21
5 0.2
6 0.19
7 0.19
8 0.19
9 0.18
10 0.18
11 0.21
12 0.2
13 0.25
14 0.29
15 0.3
16 0.37
17 0.37
18 0.41
19 0.43
20 0.46
21 0.43
22 0.4
23 0.36
24 0.32
25 0.31
26 0.25
27 0.22
28 0.18
29 0.14
30 0.14
31 0.13
32 0.1
33 0.1
34 0.14
35 0.14
36 0.2
37 0.27
38 0.29
39 0.3
40 0.38
41 0.44
42 0.41
43 0.42
44 0.38
45 0.32
46 0.32
47 0.36
48 0.34
49 0.3
50 0.31
51 0.29
52 0.29
53 0.27
54 0.27
55 0.23
56 0.18
57 0.2
58 0.17
59 0.18
60 0.19
61 0.19
62 0.16
63 0.16
64 0.15
65 0.11
66 0.12
67 0.11
68 0.13
69 0.14
70 0.16
71 0.18
72 0.18
73 0.19
74 0.18
75 0.24
76 0.28
77 0.27
78 0.27
79 0.27
80 0.27
81 0.26
82 0.28
83 0.23
84 0.16
85 0.15
86 0.16
87 0.16
88 0.15
89 0.16
90 0.14
91 0.13
92 0.13
93 0.14
94 0.12
95 0.14
96 0.17
97 0.18
98 0.19
99 0.21
100 0.22
101 0.22
102 0.24
103 0.24
104 0.28
105 0.33
106 0.38
107 0.4
108 0.37
109 0.38
110 0.36
111 0.34
112 0.26
113 0.2
114 0.14
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.07
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.12
159 0.14
160 0.11
161 0.1
162 0.11
163 0.13
164 0.15
165 0.13
166 0.12
167 0.14
168 0.18
169 0.19
170 0.18
171 0.18
172 0.19
173 0.21
174 0.22
175 0.2
176 0.16
177 0.17
178 0.16
179 0.14
180 0.12
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.13
185 0.12
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.14
191 0.16
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.12
217 0.15
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.12
225 0.1
226 0.12
227 0.11
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.1
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.05
241 0.04
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.09
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.16
253 0.18
254 0.18
255 0.17
256 0.16
257 0.15
258 0.15
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.17
263 0.19
264 0.2
265 0.19
266 0.21
267 0.24
268 0.26
269 0.33
270 0.35
271 0.4
272 0.41
273 0.4
274 0.39
275 0.38
276 0.44
277 0.43
278 0.42
279 0.39
280 0.4
281 0.46
282 0.51
283 0.59
284 0.61
285 0.64
286 0.67
287 0.72
288 0.7
289 0.69
290 0.73
291 0.73
292 0.73
293 0.74
294 0.74
295 0.76
296 0.8
297 0.79
298 0.7
299 0.62
300 0.54
301 0.49
302 0.48
303 0.48
304 0.49
305 0.51
306 0.51
307 0.5
308 0.49
309 0.44
310 0.37
311 0.34
312 0.31
313 0.35
314 0.41
315 0.5
316 0.54
317 0.57
318 0.56
319 0.56
320 0.57
321 0.53