Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9SQL6

Protein Details
Accession C9SQL6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
265-299RGPDSKLPRVTRREKKEIKRQKKEAKKAAKLTAKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-305KLPRVTRREKKEIKRQKKEAKKAAKLTAKEEKRQKK
Subcellular Location(s) plas 15, E.R. 8, vacu 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG val:VDBG_07251  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MSGSTTATNVPSATSAAAEPSCTTAVPGKYGSVPYDACNSNYNFEPDFAANCAFAVLFGLTLGAHLVQAVTWKKQKQIYAILGQLFFLLAPLWMNALVYMTVSRLVYYVLPDRSIWNLKATQLTKLFVWIDVLCFLVQAGGGSLLSGDDMEMMRIGQYIYVAGCAAQLFFIVIFCALMGRLYVRMREAQRFDLRMTLVKSLFWALLAVLVLIMIRIVFRLYEFKPGSDFDSEILTNEYYALGLDALPMLLGLLLLNAVHPGWVLRGPDSKLPRVTRREKKEIKRQKKEAKKAAKLTAKEEKRQKKAMNMLHVKEAQRSSDTFEMNEASERGDAQVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.13
7 0.15
8 0.15
9 0.13
10 0.15
11 0.18
12 0.19
13 0.21
14 0.21
15 0.2
16 0.22
17 0.25
18 0.25
19 0.22
20 0.22
21 0.21
22 0.27
23 0.26
24 0.25
25 0.29
26 0.28
27 0.27
28 0.29
29 0.31
30 0.25
31 0.24
32 0.26
33 0.22
34 0.21
35 0.2
36 0.19
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.1
41 0.08
42 0.08
43 0.06
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.05
49 0.05
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.04
55 0.1
56 0.12
57 0.17
58 0.23
59 0.26
60 0.31
61 0.36
62 0.39
63 0.4
64 0.46
65 0.46
66 0.45
67 0.47
68 0.44
69 0.39
70 0.36
71 0.3
72 0.21
73 0.15
74 0.1
75 0.06
76 0.04
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.16
100 0.2
101 0.23
102 0.22
103 0.2
104 0.2
105 0.21
106 0.27
107 0.27
108 0.28
109 0.26
110 0.26
111 0.23
112 0.25
113 0.23
114 0.16
115 0.18
116 0.13
117 0.11
118 0.1
119 0.11
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.04
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.02
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.02
161 0.02
162 0.03
163 0.02
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.06
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.14
172 0.16
173 0.22
174 0.24
175 0.27
176 0.3
177 0.32
178 0.31
179 0.29
180 0.27
181 0.25
182 0.24
183 0.22
184 0.18
185 0.16
186 0.16
187 0.15
188 0.14
189 0.1
190 0.09
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.02
201 0.02
202 0.02
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.09
207 0.1
208 0.19
209 0.2
210 0.2
211 0.22
212 0.23
213 0.25
214 0.22
215 0.21
216 0.13
217 0.16
218 0.15
219 0.14
220 0.15
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.09
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.02
237 0.03
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.04
248 0.05
249 0.08
250 0.09
251 0.12
252 0.16
253 0.19
254 0.26
255 0.31
256 0.35
257 0.4
258 0.45
259 0.51
260 0.56
261 0.65
262 0.68
263 0.73
264 0.78
265 0.81
266 0.85
267 0.87
268 0.89
269 0.9
270 0.91
271 0.92
272 0.92
273 0.93
274 0.94
275 0.93
276 0.93
277 0.91
278 0.88
279 0.87
280 0.85
281 0.77
282 0.74
283 0.74
284 0.7
285 0.69
286 0.71
287 0.72
288 0.71
289 0.77
290 0.75
291 0.74
292 0.77
293 0.76
294 0.76
295 0.75
296 0.7
297 0.68
298 0.69
299 0.61
300 0.57
301 0.52
302 0.44
303 0.38
304 0.36
305 0.35
306 0.36
307 0.35
308 0.29
309 0.29
310 0.28
311 0.26
312 0.28
313 0.21
314 0.17
315 0.16
316 0.16