Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C9S8N2

Protein Details
Accession C9S8N2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
487-507ALKECRPTWPRPKAHGCNKVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
570-572RRR
579-627PPPRAKALARTARPSLSSGAEARRRRCDAQGGGPRREVTGADRAGKRRK
Subcellular Location(s) nucl 11, cyto 6, extr 4, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008429  CLPTM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG val:VDBG_00100  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05602  CLPTM1  
Amino Acid Sequences MPHVDALAAVGGAGPAPAGAPQQQQQPQQQGNHRDSALTNLGLHHEHHPEAPLRLRHLGRHELRRQLFPQEARRRGHPRSPIPTARSTPSPPNLGGIPPYVLRPKTLADGATFDPNPARIAPMWPLDSHIDIIVTLSDSPRPEPLAKTPADKIVLRETNFHLGNYSDKRSADATFTVPASVQHNVTLWGHFYLALTGEQPDPYVAGFDVASAYHFAYPLTQYLPKKKVSKTRSLLDGGDADADNALLDDAPSGPVIASYYHPNITLSTIPDSGTPKLTVPDPMLFVNKFWQLRTHMTLLNDTVTELPIHIDLGNLRYWQMGLMSSIELSSKETARQAAFATPPPARARHRGRDAQGDPSSTPTPICSPSRAAMGILIELWKITTVVNVRVTTADAGALFPYRIAFEDKHKLSDTEEKTKEYDEIAFKYMYMAGVPPAHRLCRLLARLRRGTKSVVLVTSSATLVGSGLRPTGFLMDGGPPPLHQLPALKECRPTWPRPKAHGCNKVPSTTLHPTTFFWPFTNQGCPILARPSPTFRRRRSFFLRLHSYQRLGPTRPDYFARSTSFGPGRRRRNEDEADPPPRAKALARTARPSLSSGAEARRRRCDAQGGGPRREVTGADRAGKRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.03
3 0.03
4 0.04
5 0.06
6 0.1
7 0.14
8 0.18
9 0.27
10 0.34
11 0.4
12 0.47
13 0.54
14 0.58
15 0.62
16 0.67
17 0.68
18 0.66
19 0.65
20 0.58
21 0.51
22 0.45
23 0.43
24 0.38
25 0.3
26 0.26
27 0.22
28 0.24
29 0.23
30 0.25
31 0.23
32 0.23
33 0.23
34 0.23
35 0.27
36 0.27
37 0.3
38 0.36
39 0.36
40 0.37
41 0.43
42 0.44
43 0.45
44 0.49
45 0.55
46 0.55
47 0.62
48 0.64
49 0.66
50 0.68
51 0.69
52 0.65
53 0.62
54 0.61
55 0.58
56 0.62
57 0.62
58 0.67
59 0.63
60 0.7
61 0.71
62 0.7
63 0.71
64 0.7
65 0.69
66 0.7
67 0.75
68 0.75
69 0.71
70 0.72
71 0.68
72 0.62
73 0.58
74 0.55
75 0.54
76 0.51
77 0.5
78 0.42
79 0.41
80 0.38
81 0.33
82 0.3
83 0.23
84 0.2
85 0.17
86 0.2
87 0.23
88 0.22
89 0.22
90 0.22
91 0.22
92 0.24
93 0.26
94 0.24
95 0.19
96 0.23
97 0.23
98 0.28
99 0.26
100 0.22
101 0.21
102 0.21
103 0.21
104 0.17
105 0.18
106 0.12
107 0.15
108 0.18
109 0.21
110 0.22
111 0.21
112 0.23
113 0.23
114 0.23
115 0.21
116 0.17
117 0.13
118 0.11
119 0.11
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.13
128 0.16
129 0.18
130 0.2
131 0.26
132 0.3
133 0.31
134 0.33
135 0.34
136 0.35
137 0.37
138 0.35
139 0.31
140 0.34
141 0.38
142 0.35
143 0.37
144 0.35
145 0.39
146 0.38
147 0.35
148 0.27
149 0.22
150 0.28
151 0.29
152 0.3
153 0.25
154 0.25
155 0.27
156 0.27
157 0.28
158 0.24
159 0.21
160 0.19
161 0.17
162 0.18
163 0.16
164 0.14
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.14
172 0.14
173 0.14
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.09
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.16
208 0.18
209 0.27
210 0.31
211 0.36
212 0.42
213 0.47
214 0.54
215 0.55
216 0.62
217 0.6
218 0.6
219 0.6
220 0.56
221 0.5
222 0.42
223 0.36
224 0.26
225 0.22
226 0.17
227 0.11
228 0.08
229 0.08
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.02
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.09
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.14
258 0.16
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.15
272 0.14
273 0.16
274 0.18
275 0.17
276 0.16
277 0.18
278 0.2
279 0.23
280 0.26
281 0.26
282 0.24
283 0.24
284 0.25
285 0.22
286 0.19
287 0.15
288 0.12
289 0.1
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.06
310 0.05
311 0.05
312 0.06
313 0.06
314 0.05
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.11
321 0.11
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.14
326 0.14
327 0.17
328 0.15
329 0.18
330 0.19
331 0.23
332 0.23
333 0.31
334 0.37
335 0.42
336 0.49
337 0.52
338 0.53
339 0.58
340 0.56
341 0.56
342 0.49
343 0.43
344 0.36
345 0.34
346 0.32
347 0.22
348 0.21
349 0.13
350 0.14
351 0.16
352 0.17
353 0.15
354 0.17
355 0.18
356 0.2
357 0.19
358 0.17
359 0.14
360 0.13
361 0.11
362 0.09
363 0.08
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.06
371 0.08
372 0.12
373 0.16
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.17
378 0.15
379 0.13
380 0.1
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.09
391 0.1
392 0.16
393 0.25
394 0.26
395 0.29
396 0.3
397 0.29
398 0.29
399 0.37
400 0.37
401 0.38
402 0.39
403 0.38
404 0.38
405 0.38
406 0.36
407 0.27
408 0.27
409 0.2
410 0.21
411 0.21
412 0.2
413 0.19
414 0.19
415 0.18
416 0.13
417 0.1
418 0.08
419 0.08
420 0.11
421 0.12
422 0.16
423 0.17
424 0.18
425 0.19
426 0.2
427 0.2
428 0.24
429 0.29
430 0.34
431 0.38
432 0.45
433 0.53
434 0.58
435 0.58
436 0.53
437 0.51
438 0.45
439 0.45
440 0.39
441 0.32
442 0.28
443 0.25
444 0.23
445 0.21
446 0.17
447 0.12
448 0.09
449 0.07
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.09
459 0.08
460 0.07
461 0.09
462 0.11
463 0.12
464 0.13
465 0.13
466 0.11
467 0.15
468 0.16
469 0.15
470 0.13
471 0.16
472 0.19
473 0.29
474 0.33
475 0.31
476 0.34
477 0.35
478 0.45
479 0.47
480 0.5
481 0.52
482 0.58
483 0.63
484 0.69
485 0.79
486 0.78
487 0.83
488 0.85
489 0.79
490 0.79
491 0.75
492 0.68
493 0.59
494 0.51
495 0.48
496 0.45
497 0.46
498 0.38
499 0.37
500 0.36
501 0.39
502 0.41
503 0.34
504 0.28
505 0.25
506 0.27
507 0.28
508 0.31
509 0.28
510 0.26
511 0.26
512 0.26
513 0.25
514 0.27
515 0.25
516 0.25
517 0.27
518 0.33
519 0.41
520 0.49
521 0.57
522 0.6
523 0.69
524 0.69
525 0.75
526 0.76
527 0.76
528 0.73
529 0.74
530 0.75
531 0.69
532 0.73
533 0.7
534 0.63
535 0.56
536 0.58
537 0.54
538 0.48
539 0.5
540 0.49
541 0.47
542 0.48
543 0.48
544 0.44
545 0.42
546 0.45
547 0.42
548 0.38
549 0.36
550 0.41
551 0.44
552 0.45
553 0.51
554 0.55
555 0.61
556 0.67
557 0.74
558 0.73
559 0.76
560 0.76
561 0.73
562 0.73
563 0.72
564 0.69
565 0.64
566 0.57
567 0.49
568 0.43
569 0.37
570 0.3
571 0.3
572 0.35
573 0.41
574 0.46
575 0.51
576 0.54
577 0.56
578 0.55
579 0.49
580 0.41
581 0.34
582 0.32
583 0.31
584 0.36
585 0.42
586 0.47
587 0.51
588 0.56
589 0.6
590 0.59
591 0.61
592 0.61
593 0.59
594 0.62
595 0.67
596 0.66
597 0.65
598 0.66
599 0.61
600 0.53
601 0.47
602 0.38
603 0.32
604 0.34
605 0.34
606 0.38
607 0.43